色氨酰-tRNA合成酶基因WRS1調(diào)控水稻種子發(fā)育
發(fā)布時間:2022-01-02 07:42
【目的】氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetases, aa RSs)與遺傳信息傳遞密切相關(guān),已發(fā)現(xiàn)植物中aaRSs家族蛋白在維持翻譯功能之余,還參與配子發(fā)生與胚發(fā)育、質(zhì)體的早期發(fā)育以及免疫信號的感知與病害防御等生物學(xué)過程。本研究利用水稻胚乳發(fā)育缺陷突變體,分析水稻色氨酰-tRNA合成酶(WRS1)在胚乳發(fā)育中的作用,證明WRS1基因編碼一個影響水稻胚乳發(fā)育的關(guān)鍵因子。【方法】本研究通過甲烷磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate, EMS)誘變秈稻(Oryza sativa subsp. indica)品種N22,篩選到一個穩(wěn)定遺傳的水稻粉質(zhì)胚乳突變體(wrs1),圖位克隆獲得目標(biāo)基因。對wrs1成熟種子進行形態(tài)學(xué)觀察以及淀粉相關(guān)理化性質(zhì)測定,利用細胞學(xué)切片分析wrs1發(fā)育中胚乳的結(jié)構(gòu),利用實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)和GUS活性染色分析基因表達模式,通過q RT-PCR比較野生型與突變體花后12 d胚乳中淀粉合成相關(guān)基因表達情況,免疫印跡檢測野生型與突變體成熟種子中淀粉合成...
【文章來源】:中國水稻科學(xué). 2020,34(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:14 頁
【部分圖文】:
野生型與wrs1突變體表型分析
與野生型相比,wrs1突變體籽?偟矸酆肯陆盗7.18%,直鏈淀粉含量無差異(圖2-A~B)。基于上述淀粉顆粒形態(tài)及總淀粉含量的變化,對突變體中淀粉理化特性進一步探究。RVA譜分析野生型和突變體淀粉糊化特性的變化,結(jié)果表明wrs1突變體淀粉的黏度分布類似于野生型但水平較低,其峰值黏度和最終黏度分別為野生型的81.84%和87.52%(圖2-C,表2)。尿素濃度梯度溶解實驗顯示,突變體米粉更難溶于尿素溶液中,在4 mol/L時突變體和野生型溶解體積出現(xiàn)差異,6 mol/L時差異達到顯著(圖2-D~E)。綜上所述,wrs1突變體中胚乳的主要填充物淀粉的含量及理化特性發(fā)生相應(yīng)改變。2.3 wrs1造粉體發(fā)育異常
由于wrs1突變體純合致死,將wrs1雜合植株與粳稻滇粳優(yōu)1號配組,從F2群體中挑選46個具有粉質(zhì)胚乳表型的隱性極端個體,利用133個覆蓋水稻12條染色體的InDel和SSR多態(tài)性標(biāo)記進行連鎖分析。初步將基因定位在第12染色體長臂的3.7 Mb區(qū)間內(nèi),進一步篩選了974個極端個體并開發(fā)標(biāo)記將基因限定在183 kb區(qū)間內(nèi)(圖4-A)。利用NCBI數(shù)據(jù)庫預(yù)測,該區(qū)間內(nèi)有16個開放讀碼框(open reading frames,ORFs)。進一步測序發(fā)現(xiàn)wrs1突變體在基因Os12g0540900的第6外顯子上存在一個SNP(由G變成T),導(dǎo)致甲硫氨酸(Met)被異亮氨酸(Ile)替換(圖4-B)。Os12g0540900基因編碼區(qū)序列全長1227 bp,編碼一個色氨酰-tRNA合成酶(WRS1)。為驗證Os12g0540900是目的基因,構(gòu)建了由花椰菜花葉病毒的35S啟動子驅(qū)動WRS1編碼區(qū)的pCAMBIA1305.1-WRS1-GFP載體,轉(zhuǎn)化wrs1突變體愈傷。提取T0代轉(zhuǎn)基因植株葉片的DNA,進行轉(zhuǎn)基因陽性PCR檢測(圖4-C),進一步測序確認轉(zhuǎn)基因陽性家系基因組序列中Os12g0540900基因型與突變體一致,且植株能正常生長、種子表型恢復(fù)透明(圖4-D)。因此,突變的Os12g0540900確實是導(dǎo)致wrs1表型的基因。
本文編號:3563775
【文章來源】:中國水稻科學(xué). 2020,34(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:14 頁
【部分圖文】:
野生型與wrs1突變體表型分析
與野生型相比,wrs1突變體籽?偟矸酆肯陆盗7.18%,直鏈淀粉含量無差異(圖2-A~B)。基于上述淀粉顆粒形態(tài)及總淀粉含量的變化,對突變體中淀粉理化特性進一步探究。RVA譜分析野生型和突變體淀粉糊化特性的變化,結(jié)果表明wrs1突變體淀粉的黏度分布類似于野生型但水平較低,其峰值黏度和最終黏度分別為野生型的81.84%和87.52%(圖2-C,表2)。尿素濃度梯度溶解實驗顯示,突變體米粉更難溶于尿素溶液中,在4 mol/L時突變體和野生型溶解體積出現(xiàn)差異,6 mol/L時差異達到顯著(圖2-D~E)。綜上所述,wrs1突變體中胚乳的主要填充物淀粉的含量及理化特性發(fā)生相應(yīng)改變。2.3 wrs1造粉體發(fā)育異常
由于wrs1突變體純合致死,將wrs1雜合植株與粳稻滇粳優(yōu)1號配組,從F2群體中挑選46個具有粉質(zhì)胚乳表型的隱性極端個體,利用133個覆蓋水稻12條染色體的InDel和SSR多態(tài)性標(biāo)記進行連鎖分析。初步將基因定位在第12染色體長臂的3.7 Mb區(qū)間內(nèi),進一步篩選了974個極端個體并開發(fā)標(biāo)記將基因限定在183 kb區(qū)間內(nèi)(圖4-A)。利用NCBI數(shù)據(jù)庫預(yù)測,該區(qū)間內(nèi)有16個開放讀碼框(open reading frames,ORFs)。進一步測序發(fā)現(xiàn)wrs1突變體在基因Os12g0540900的第6外顯子上存在一個SNP(由G變成T),導(dǎo)致甲硫氨酸(Met)被異亮氨酸(Ile)替換(圖4-B)。Os12g0540900基因編碼區(qū)序列全長1227 bp,編碼一個色氨酰-tRNA合成酶(WRS1)。為驗證Os12g0540900是目的基因,構(gòu)建了由花椰菜花葉病毒的35S啟動子驅(qū)動WRS1編碼區(qū)的pCAMBIA1305.1-WRS1-GFP載體,轉(zhuǎn)化wrs1突變體愈傷。提取T0代轉(zhuǎn)基因植株葉片的DNA,進行轉(zhuǎn)基因陽性PCR檢測(圖4-C),進一步測序確認轉(zhuǎn)基因陽性家系基因組序列中Os12g0540900基因型與突變體一致,且植株能正常生長、種子表型恢復(fù)透明(圖4-D)。因此,突變的Os12g0540900確實是導(dǎo)致wrs1表型的基因。
本文編號:3563775
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