茶樹內(nèi)生草螺菌WT00C的基因組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-01 18:01
草螺菌WT00C(Herbaspirillum sp.WT00C)是我們實(shí)驗(yàn)室從茶樹中分離出的一種內(nèi)生細(xì)菌。前期實(shí)驗(yàn)表明,它能產(chǎn)氨、合成生長(zhǎng)素吲哚乙酸和嗜鐵素,能夠有效地經(jīng)過傷口感染進(jìn)入并定殖茶樹體內(nèi)。噴灑和澆灌都不能夠感染植物且不能在水稻、小麥、油菜和白菜等農(nóng)作物中定殖。大田實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),浸泡扦插條或噴灑修剪的大田茶樹,草螺菌WT00C能促進(jìn)茶樹扦插枝生根和發(fā)芽,促進(jìn)大田茶樹新生側(cè)芽生長(zhǎng),嫩芽生物量增加達(dá)8 kg/畝。雖然草螺菌WT00C與兩種固氮內(nèi)生草螺菌(織片草螺菌Herbaspirillum seropedicae和紅蒼白草螺菌Herbaspirillum rubrisubalbican)一樣具有植物促生作用,但草螺菌WT00C不能固氮且宿主也不同。為了弄清楚草螺菌WT00C的促生作用以及它的宿主特異性,本研究試圖利用分子生物學(xué)和生物信息學(xué)方法,解析草螺菌WT00C基因組DNA序列并加以注釋。草螺菌WT00C基因組的大小為6,079,821 bp,包含5537個(gè)基因,基因平均長(zhǎng)度為955 bp。分析基因組注釋結(jié)果及代謝情況發(fā)現(xiàn),,草螺菌WT00C有四個(gè)末端氧化酶,有負(fù)責(zé)糖類轉(zhuǎn)運(yùn)的A...
【文章來源】:湖北大學(xué)湖北省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【圖文】:
五種草螺菌的形態(tài)特征:A:H.massiliense[18]
圖 1.2 草螺菌屬 16s rRNA 聚類分析[23]1.1.3 草螺菌多樣性己有的資料表明,不同環(huán)境中都存在草螺菌屬的細(xì)菌,如稻田[24, 25]、火山沉積物[26]、山巖[27]、水[10]、果蠅卵巢[28]、鹽水湖[29]、甘蔗[30]、污染土壤中的熒蒽[3]、茶樹[31]、蕉樹[32]、野生稻[30]等。較廣的分布說明草螺菌屬的細(xì)菌具有較大的代謝多樣性[33]。此外,臨床病例中也報(bào)道過草螺菌。在蜂窩組織炎和菌血癥的病人[34]、囊性纖維化患者[35-37]、主動(dòng)脈夾層動(dòng)脈瘤[38]、在淋巴細(xì)胞白血病患者[39, 40]、癌癥患者[41]中發(fā)現(xiàn)螺菌細(xì)菌。不過,這些病源草螺菌都未進(jìn)行詳細(xì)的分類鑒定。據(jù)研究報(bào)道,不同種屬草螺菌能夠顯示 HeLa 細(xì)胞的毒性作用,密度低、表面離散的草螺菌表現(xiàn)出較低的毒[42]。盡管來源于不同的生理環(huán)境,草螺菌屬的細(xì)菌擁有相似的生理生化特性,并且該屬 DNA 相似度很高,16S rDNA 相似性為 98. 5-99. 4%,DNA 的 GC 含量為 61- 65%。
細(xì)胞大。é蘭)0.6-0.7以 N2為唯一氮源+鞭毛 1-3 個(gè) N03-條件下厭氧生長(zhǎng)-生長(zhǎng)溫度(℃) 22-38葡萄糖+GC 含量%67±0.5蔗糖-生長(zhǎng) pH5.3-8.0α-酮戊二酸+2% NaCl -檸檬酸+“+”表示實(shí)驗(yàn)陽(yáng)性;“-”表示實(shí)驗(yàn)陰性[1]1.1.3.2 Herbaspirillum rubrisubalbicanH. rubrisubalbican(紅蒼白草螺菌)是從病變的甘蔗葉片中分離并鑒定的內(nèi)生草螺菌。它能夠?qū)е赂收岙a(chǎn)生條斑病,是一種較弱的植物致病菌[3, 33, 43, 44]。最開始被認(rèn)為屬于假單胞菌屬[44],后根據(jù)其生理生化特性以及 DDH 值,修正了其屬名,正式更名為Herbaspirillum rubrisubalbican[4]。H. rubrisubalbican 致病情況見圖 1.3.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩株茶樹內(nèi)生草螺菌的微生物學(xué)特性[J]. 王婷,楊升,陳亞雪,胡玲玲,屠琴,張麗,劉雪芹,王行國(guó). 微生物學(xué)報(bào). 2014(04)
本文編號(hào):3562554
【文章來源】:湖北大學(xué)湖北省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【圖文】:
五種草螺菌的形態(tài)特征:A:H.massiliense[18]
圖 1.2 草螺菌屬 16s rRNA 聚類分析[23]1.1.3 草螺菌多樣性己有的資料表明,不同環(huán)境中都存在草螺菌屬的細(xì)菌,如稻田[24, 25]、火山沉積物[26]、山巖[27]、水[10]、果蠅卵巢[28]、鹽水湖[29]、甘蔗[30]、污染土壤中的熒蒽[3]、茶樹[31]、蕉樹[32]、野生稻[30]等。較廣的分布說明草螺菌屬的細(xì)菌具有較大的代謝多樣性[33]。此外,臨床病例中也報(bào)道過草螺菌。在蜂窩組織炎和菌血癥的病人[34]、囊性纖維化患者[35-37]、主動(dòng)脈夾層動(dòng)脈瘤[38]、在淋巴細(xì)胞白血病患者[39, 40]、癌癥患者[41]中發(fā)現(xiàn)螺菌細(xì)菌。不過,這些病源草螺菌都未進(jìn)行詳細(xì)的分類鑒定。據(jù)研究報(bào)道,不同種屬草螺菌能夠顯示 HeLa 細(xì)胞的毒性作用,密度低、表面離散的草螺菌表現(xiàn)出較低的毒[42]。盡管來源于不同的生理環(huán)境,草螺菌屬的細(xì)菌擁有相似的生理生化特性,并且該屬 DNA 相似度很高,16S rDNA 相似性為 98. 5-99. 4%,DNA 的 GC 含量為 61- 65%。
細(xì)胞大。é蘭)0.6-0.7以 N2為唯一氮源+鞭毛 1-3 個(gè) N03-條件下厭氧生長(zhǎng)-生長(zhǎng)溫度(℃) 22-38葡萄糖+GC 含量%67±0.5蔗糖-生長(zhǎng) pH5.3-8.0α-酮戊二酸+2% NaCl -檸檬酸+“+”表示實(shí)驗(yàn)陽(yáng)性;“-”表示實(shí)驗(yàn)陰性[1]1.1.3.2 Herbaspirillum rubrisubalbicanH. rubrisubalbican(紅蒼白草螺菌)是從病變的甘蔗葉片中分離并鑒定的內(nèi)生草螺菌。它能夠?qū)е赂收岙a(chǎn)生條斑病,是一種較弱的植物致病菌[3, 33, 43, 44]。最開始被認(rèn)為屬于假單胞菌屬[44],后根據(jù)其生理生化特性以及 DDH 值,修正了其屬名,正式更名為Herbaspirillum rubrisubalbican[4]。H. rubrisubalbican 致病情況見圖 1.3.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩株茶樹內(nèi)生草螺菌的微生物學(xué)特性[J]. 王婷,楊升,陳亞雪,胡玲玲,屠琴,張麗,劉雪芹,王行國(guó). 微生物學(xué)報(bào). 2014(04)
本文編號(hào):3562554
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