竹節(jié)參Panax japonicus C.A.Mey為五加科多年生草本植物,其主要化學(xué)成分為三萜皂苷。竹節(jié)參作為人參屬中的重要藥材,在我國民族醫(yī)藥中應(yīng)用十分廣泛。隨著生物科學(xué)的快速發(fā)展,相比于傳統(tǒng)化藥觀點,站在微觀分子角度看待現(xiàn)象和事物已成為新的切入點。本課題以竹節(jié)參根狀莖為研究試材,基于Illumina Hi Seq 2000測序平臺得到了完整的竹節(jié)參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),完成了原始數(shù)據(jù)前處理、代謝和功能歸類,并發(fā)掘整理出參與竹節(jié)參皂苷合成代謝的相關(guān)功能基因;進一步采用分子克隆方法從竹節(jié)參根狀莖中真實還原出基因序列,并進行序列重復(fù)性比對、蛋白質(zhì)基本特征、多級結(jié)構(gòu)、遺傳進化,定量表達等方面的分析。實驗結(jié)果如下:1、竹節(jié)參轉(zhuǎn)錄組原始數(shù)據(jù)19.6Gbp,初始短讀序為66,084,088條,通過質(zhì)量控制篩選后得到有效短讀序52,199,221條,平均長度為76.94bp。使用不參照任何現(xiàn)有序列信息的De novo方法對短讀序列進行拼接獲得66,404條Unigenes。其中有34,639條和19,739條Unigenes與NR和Swiss Prot數(shù)據(jù)庫中的序列信息相匹配;有26,909條和10,63... 

【文章來源】：武漢輕工大學(xué)湖北省

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

全部Unigene的序列長度區(qū)段

GC含量頻率分布

GO注釋

【參考文獻】：
期刊論文
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