芝麻（Sesamum indicum L.,2n=26）屬胡麻科胡麻屬,是我國重要的油料作物之一。它不僅含有大量的脂肪和蛋白質(zhì),還富含各種抗氧化物質(zhì)和礦物質(zhì)元素,被廣泛應(yīng)用于食品加工、醫(yī)療保健和抗衰老等方面。本研究以選自核心種質(zhì)的366份具有代表性的芝麻種質(zhì)為樣本,利用 SALF-seq（Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing）技術(shù)測序獲得89,924個分布于整個基因組的SNP標(biāo)記,評估366份芝麻樣本的群體結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性及連鎖不平衡水平;利用44,109個SNP標(biāo)記對363份芝麻樣本的主要農(nóng)藝性狀和耐漬性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)掘優(yōu)異等位變異,為芝麻的種質(zhì)改良和品種選育提供基礎(chǔ)信息。具體研究內(nèi)容和結(jié)果如下:1.366份芝麻樣本的遺傳變異分析。通過SLAF-seq方法對366份芝麻樣本進(jìn)行簡化基因組測序并開發(fā)了 89,924個分布于整個基因組上的SNP標(biāo)記,平均密度為2.67 kb/SNP;群體結(jié)構(gòu)分析表明366份樣本可劃分為3個亞群（Pop 1、Pop 2和Mixed）;主成分分析（PCA）和進(jìn)化樹分析結(jié)果進(jìn)一步驗證了 3個亞群的... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：168 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２－１?３６６份芝麻種質(zhì)資源的地理分布??Ａ：?３６６份芝麻樣本分布于１２個國家，紅點代表芝麻樣本的地理位置

圖２－３?ＳＮＰｓ在芝麻１３條連鎖群上的分布情況

性狀的全雒因組關(guān)聯(lián)分析???Ａ?Ｂ??－８６００００?ｃ?兔?７〇〇〇??〇?°?６０００?＼??－８８００００?°?＼??５０００?＼??§?－９０００００?°?４０００?＼??３?＿?。?＇。。。?＼??－９２００００?＼??２０００?＼??－９４００００?１〇〇〇?＼??－９６００００?°?〇?＾?＾?＊??２?４?６?８?１０￣￣?—２?３?４?５?６?７?８?９＿??■■■ｉｉ??Ａｃｃｅｓｓｉｏｎｓ??圖２－４?３６６份芝麻資源群體結(jié)構(gòu)分析??（Ａ）夂值由１到１０時對應(yīng)的值。（Ｂ）的變化圖。??（Ｃ）尤＝２時的分群示意圖，紅色代表Ｐｏｐｌ，綠色代表Ｐｏｐ２??Ｆｉｇｕｒｅ?２－４?Ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?３６６?ｓｅｓａｍｅ?ａｃｃｅｓｓｉｏｎｓ?ｂｙ?ＳＴＲＵＣＴＵＲＥ??（Ａ）?Ｅｓｔｉｍａｔｅｄ?ＬｎＰ（Ｄ）?ｏｆ?ｐｏｓｓｉｂｌｅ?ｃｌｕｓｔｅｒｓ?（Ｋ）?ｆｒｏｍ?１?ｔｏ?１０；?（Ｂ）?ＡＫ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｒａｔｅ?ｏｆ?ｃｈａｎｇｅ?ｏｆ??ＬｎＰ（Ｄ）?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｓｕｃｃｅｓｓｉｖｅ?Ｋ＼?（Ｃ）?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?＝?２．?Ａ?ｇｉｖｅｎ?ｇｒｏｕｐ?ｉｓ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｅｄ：??Ｒｅｄ，?Ｐｏｐ?１；?Ｇｒｅｅｎ，?Ｐｏｐ?２．??通過分析群體Ｑ值表明大部分材料遺傳背景混雜，因此將Ｑ?２?７０％的樣本劃入對??應(yīng)的亞群，剩余樣本劃分為混合群，最終，３６６份樣本共劃為分３個亞群，分別為：??亞群１?（Ｐｏｐｌ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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