藥用野生稻（Oryza officinalis）為我國本土野生稻之一,蘊含大量優(yōu)良農(nóng)藝性狀,是重要的水稻種質(zhì)資源庫。本研究通過對藥用野生稻幼苗高溫及鹽脅迫處理下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,得到的結(jié)果如下。對高溫、高鹽脅迫及對照組高通量轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得30.28Gb Clean Data,各樣品Clean Data均達到3.08Gb以上,Q30在86.06%及以上。對轉(zhuǎn)錄組測序所得的7701307條Conting拼接,共得到93339條Transcript和50233條Unigene。長度大于1000的Transcript的數(shù)有41159條占Transcript總數(shù)的44.09%。長度大于1000的Unigene數(shù)有14304條占總數(shù)的28.55%,Transcript與Unigene的N50分別為1878bp和1443bp。GO數(shù)據(jù)庫共注釋成功26139個Unigene,占Unigene總數(shù)的52.04%。其中大于300bp的Unigene個數(shù)為21979,占長度大于300bp Unigene總數(shù)的62.16%;大于1000bp的Unigene個數(shù)為11589占長度大于1000bp Unige... 

【文章來源】：華南農(nóng)業(yè)大學廣東省

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

藥用野生稻高溫處理1d至4d表型圖

圖 2 藥用野生稻高鹽處理下 1d 至 4d 表型圖A、B、C、D 分別為處理 1d、2d、3d、4d 后試驗組與對照組幼苗表型圖；A、B、C、D瓶中幼苗為處理組，右側(cè)錐形瓶中幼苗為對照組。2 藥用野生稻在高溫、高鹽脅迫下生理指標數(shù)據(jù)變化分析藥用野生稻幼苗在高溫、高鹽脅迫處理下，蛋白質(zhì)含量均表現(xiàn)降，其中高鹽下的蛋白質(zhì)含量下降顯著（p<0.05）。藥用野生稻在高溫、高鹽脅迫下，其可量、SOD 活力、POD 活力、丙二醛含量及脯氨酸含量均表現(xiàn)上升趨勢，其迫、高鹽脅迫下的可溶性糖含量及脯氨酸含量相比對照組均極顯著升高，高理下的丙二醛含量相比對照組也為極顯著增加；藥用野生稻幼苗在高溫、高 SOD 活力相比對照組顯著升高（表 4）。表 4 藥用野生稻高溫、高鹽處理下生理指標測量指標 CK 高溫處理 高鹽處理

GO 注釋分為分子功能（Molecular Function）、細胞組分（Cellular Component）和物學過程（Biological Process）三大類，這三大類中又包括 48 個功能亞類。鑒于同功能可能會被多個 Unigene 注釋，而同一 Unigene 又可能注釋到多個功能類。GO據(jù)庫共注釋成功 26139 個 Unigene，占 Unigene 總數(shù)的 52.04%。其中大于 300bp 的nigene 個數(shù)為 21979，占長度大于 300bp Unigene 總數(shù)的 62.16%；大于 1000bp 的nigene 個數(shù)為 11589 占長度大于 1000bp Unigene 總數(shù)的 81.19%。（圖 3、4 和 5）。分功能中注釋到 Unigene 數(shù)量最多的兩個個亞類為催化活性（catalytic activity）和結(jié)（binding），其所占比例總和明顯超過總數(shù)的 50%；細胞成分中注釋到 Unigene 總排名靠前的三個亞類是細胞組成（cell part）、細胞器（organelle）及細胞（cell），所占比例均明顯超過注釋到該分類的 10%；而生物過程中成功注釋數(shù)量前三的亞類細胞途徑（cellular process）、代謝途徑（metabolic process）以及單有機體過程single-organism process）。

【參考文獻】：
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