粳稻云引免疫應(yīng)答相關(guān)基因OsGT64A的克隆及功能初步分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-02 09:50
云引是本實(shí)驗(yàn)室引進(jìn)的一個(gè)廣譜抗稻瘟病粳稻品種,通過與普感稻瘟病品種麗江新團(tuán)黑谷進(jìn)行雜交及多輪回交后構(gòu)建了相應(yīng)的近等基因系,并在抗、感病子代全基因組重測序的基礎(chǔ)上,從G0:0045087分類單元里篩選出一個(gè)可能參與水稻抗病過程的基因OsGT64A,結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)該基因進(jìn)行克隆與功能初步分析,主要的研究內(nèi)容及結(jié)果如下:1.以日本晴基因組為參考,設(shè)計(jì)引物,在云引和麗江新團(tuán)黑谷的基因組中分別克隆了該基因,通過測序比對(duì)后發(fā)現(xiàn),麗江新團(tuán)黑谷與日本晴的序列完全一致,但云引與它們之間存在一定差異,其中,云引在基因編碼區(qū)(CDS)上共缺失了12個(gè)堿基,同時(shí)還存在4處單堿基位點(diǎn)的替換,且有3處造成蛋白編碼氨基酸的改變。另外,還有4處單堿基的突變位于內(nèi)含子中;2.設(shè)計(jì)引物,分別在云引和麗江新團(tuán)黑谷中擴(kuò)增出該基因的啟動(dòng)子序列,經(jīng)測序比對(duì)后發(fā)現(xiàn),麗江新團(tuán)黑谷與日本晴一致,而云引與二者之間仍有少量的SNP(單核苷酸多態(tài)性)及Indel(插入缺失),通過Plantcare啟動(dòng)子元件分析網(wǎng)站預(yù)測,發(fā)現(xiàn)該基因的啟動(dòng)子序列存在多種已知的響應(yīng)元件,包括各種激素、防御、光、生理周期等響應(yīng)元件,由于云引啟動(dòng)子序列存在的突...
【文章來源】:福建師范大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:101 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3:三類糖基轉(zhuǎn)移酶的蛋白質(zhì)三維構(gòu)造Pi??Fig.3?The?protein?tertiary?structure?of?three?glycosyltransferases128】??-
(>.2.1.2?GT64糖基轉(zhuǎn)移酶家族??糖基轉(zhuǎn)移酶GT64家族廣泛存在于各種物種中,包括人、果蠅、擬南芥、??白楊等。通常為GT-A蛋白結(jié)構(gòu)(圖4),具有a?-?1?,?4-N-乙酰葡糖氨基轉(zhuǎn)移酶??活性,但動(dòng)物中的GT64成員多數(shù)是具有雙功能的,它們同時(shí)包含了?GT-A和??GT-B的結(jié)構(gòu)域132_明,兼有P-1,4-葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶活性,即一種蛋白可能具??有多種糖基轉(zhuǎn)移酶活性。而絕大多數(shù)植物中的GT64成員目前未被發(fā)現(xiàn)同時(shí)具??有兩種蛋白功能域,只是少數(shù)成員除了?C端的GT64結(jié)構(gòu)域外,在N端還具有??一個(gè)未知的結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域與已知或預(yù)測的結(jié)構(gòu)域都不相似,比如擬南芥??五PC-L2基因,這種可能的雙模結(jié)構(gòu)仍然需要更多的證據(jù)支持【3,34]。??N?贏-、??f.…....f??C7?/?2,??"??圖4:?GT-A蛋白結(jié)構(gòu)模式示意圖[31】??藍(lán)色柱子:a螺旋;橙色箭頭:0折疊;紅色實(shí)線:DxD模體;??Fig.4?The?schema?diagram?of?GT-A?protein?structure[川??Blue?cylinders:?a?-helices?;?Magenta?arrows:?P?-lip;?Red?line:?DxD?motif??目前,對(duì)GT64糖基轉(zhuǎn)移酶家族的研究集中在動(dòng)物中,包括人和小鼠,人??類中的GT64成員也稱之為Exostosin家族
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶生化特性和功能研究進(jìn)展[J]. 姬向楠,何非,段長青,王軍. 食品科學(xué). 2013(09)
[2]糖基轉(zhuǎn)移酶超家族[J]. 田鵬,劉占林. 生命的化學(xué). 2011(05)
[3]真菌鞘脂代謝及其與抗真菌藥物關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 郭星軍,茍萍. 生物技術(shù). 2010(02)
[4]葡萄次生代謝UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶研究進(jìn)展[J]. 王軍,于淼. 園藝學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]植物糖基轉(zhuǎn)移酶及其在代謝工程中的應(yīng)用[J]. 周文靈,陳剛,王瑛華,李玲. 生物技術(shù). 2009(06)
[6]植物小分子化合物的糖基化與糖基轉(zhuǎn)移酶[J]. 王軍,侯丙凱. 植物生理學(xué)通訊. 2008(05)
[7]根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)水稻遺傳轉(zhuǎn)化研究進(jìn)展及展望[J]. 寧約瑟,劉雄倫,戴良英,王國梁. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[8]植物蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位研究進(jìn)展[J]. 邢浩然,劉麗娟,劉國振. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2006(S2)
[9]植物系統(tǒng)性獲得抗性及其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑[J]. 趙淑清,郭劍波. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2003(07)
碩士論文
[1]粳稻云引稻瘟病抗性基因Pi-y43(t)的精細(xì)定位和圖位克隆[D]. 陳錦文.福建農(nóng)林大學(xué) 2011
[2]粳稻云引稻瘟病抗性基因的遺傳學(xué)分析及精細(xì)定位[D]. 鄭釗.福建師范大學(xué) 2009
本文編號(hào):3528197
【文章來源】:福建師范大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:101 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3:三類糖基轉(zhuǎn)移酶的蛋白質(zhì)三維構(gòu)造Pi??Fig.3?The?protein?tertiary?structure?of?three?glycosyltransferases128】??-
(>.2.1.2?GT64糖基轉(zhuǎn)移酶家族??糖基轉(zhuǎn)移酶GT64家族廣泛存在于各種物種中,包括人、果蠅、擬南芥、??白楊等。通常為GT-A蛋白結(jié)構(gòu)(圖4),具有a?-?1?,?4-N-乙酰葡糖氨基轉(zhuǎn)移酶??活性,但動(dòng)物中的GT64成員多數(shù)是具有雙功能的,它們同時(shí)包含了?GT-A和??GT-B的結(jié)構(gòu)域132_明,兼有P-1,4-葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶活性,即一種蛋白可能具??有多種糖基轉(zhuǎn)移酶活性。而絕大多數(shù)植物中的GT64成員目前未被發(fā)現(xiàn)同時(shí)具??有兩種蛋白功能域,只是少數(shù)成員除了?C端的GT64結(jié)構(gòu)域外,在N端還具有??一個(gè)未知的結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域與已知或預(yù)測的結(jié)構(gòu)域都不相似,比如擬南芥??五PC-L2基因,這種可能的雙模結(jié)構(gòu)仍然需要更多的證據(jù)支持【3,34]。??N?贏-、??f.…....f??C7?/?2,??"??圖4:?GT-A蛋白結(jié)構(gòu)模式示意圖[31】??藍(lán)色柱子:a螺旋;橙色箭頭:0折疊;紅色實(shí)線:DxD模體;??Fig.4?The?schema?diagram?of?GT-A?protein?structure[川??Blue?cylinders:?a?-helices?;?Magenta?arrows:?P?-lip;?Red?line:?DxD?motif??目前,對(duì)GT64糖基轉(zhuǎn)移酶家族的研究集中在動(dòng)物中,包括人和小鼠,人??類中的GT64成員也稱之為Exostosin家族
ET(ethylene,乙。┑龋鼈兌荚谥参矬w響應(yīng)生物及I丨生物脅邊巾扮演心:取耍的??角色,除了乙烯外,它們多數(shù)都還擁有糖基化衍生化合物【37_39】。其中,SA、JA??介導(dǎo)的抗病途徑是植物中十分重要的防御途徑(
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶生化特性和功能研究進(jìn)展[J]. 姬向楠,何非,段長青,王軍. 食品科學(xué). 2013(09)
[2]糖基轉(zhuǎn)移酶超家族[J]. 田鵬,劉占林. 生命的化學(xué). 2011(05)
[3]真菌鞘脂代謝及其與抗真菌藥物關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 郭星軍,茍萍. 生物技術(shù). 2010(02)
[4]葡萄次生代謝UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶研究進(jìn)展[J]. 王軍,于淼. 園藝學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]植物糖基轉(zhuǎn)移酶及其在代謝工程中的應(yīng)用[J]. 周文靈,陳剛,王瑛華,李玲. 生物技術(shù). 2009(06)
[6]植物小分子化合物的糖基化與糖基轉(zhuǎn)移酶[J]. 王軍,侯丙凱. 植物生理學(xué)通訊. 2008(05)
[7]根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)水稻遺傳轉(zhuǎn)化研究進(jìn)展及展望[J]. 寧約瑟,劉雄倫,戴良英,王國梁. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[8]植物蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位研究進(jìn)展[J]. 邢浩然,劉麗娟,劉國振. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2006(S2)
[9]植物系統(tǒng)性獲得抗性及其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑[J]. 趙淑清,郭劍波. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2003(07)
碩士論文
[1]粳稻云引稻瘟病抗性基因Pi-y43(t)的精細(xì)定位和圖位克隆[D]. 陳錦文.福建農(nóng)林大學(xué) 2011
[2]粳稻云引稻瘟病抗性基因的遺傳學(xué)分析及精細(xì)定位[D]. 鄭釗.福建師范大學(xué) 2009
本文編號(hào):3528197
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