[目的]玉米穗發(fā)芽嚴重影響作物產(chǎn)量與品質(zhì),本研究通過分析玉米穗發(fā)芽突變體（viviparous）vp-like8與野生型在轉(zhuǎn)錄水平上的差異,探索玉米穗發(fā)芽相關(guān)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),深入解析玉米穗發(fā)芽發(fā)生的分子機制。[方法]對本實驗室發(fā)現(xiàn)的玉米穗發(fā)芽突變體vp-like8的雜合體分別與自交系Mo17和Zheng58雜交,然后再自交,隨機選取具有穗發(fā)芽表型的F2果穗,發(fā)芽籽粒和正常籽粒各取40粒,剝除種皮,分別混池Mo17背景的突變體（Mo17_mut）和野生型（Mo17_wt）,Zheng58背景的突變體（Zheng58_mut）和野生型（Zheng58_wt）等4份試驗樣品,利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)（RNA-Seq）,借助生物信息學(xué)手段,對野生型和突變體進行比較轉(zhuǎn)錄組分析。[結(jié)果]在vp-like8突變體中,共篩選到2750個差異表達基因,其中1 812個基因在突變體中上調(diào)表達,938個下調(diào)表達。GO（Gene ontology）功能富集分析和KEGG代謝通路富集分析發(fā)現(xiàn),差異基因主要富集在代謝途徑（Metabolic ... 

【文章來源】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,40(03)北大核心

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

差異表達基因的GO分類

qRT-PCR驗證隨機挑選的DEGs

利用IGV驗證read counts結(jié)果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]玉米穗發(fā)芽突變體vp-like8的遺傳分析及突變基因鑒定[J]. 王瑞,陳陽松,孫明昊,張秀艷,杜依聰,鄭軍.  作物學(xué)報. 2019(05)
[2]水稻制種中雜交種子穗發(fā)芽生理特性研究[J]. 廖泳祥,黃靜,高梅,李東,薛晶晶,張紅宇,徐培洲,吳先軍.  核農(nóng)學(xué)報. 2009(05)
[3]葡萄糖和ABA對小麥胚萌發(fā)過程中α-淀粉酶表達的調(diào)控[J]. 孫果忠,張秀英,閆長生,肖世和.  華北農(nóng)學(xué)報. 2009(01)
[4]作物種子穗發(fā)芽研究現(xiàn)狀[J]. 王小春,楊文鈺.  種子. 2003(04)
[5]小麥穗發(fā)芽抗性機理與遺傳研究[J]. 張海峰,盧榮禾.  作物學(xué)報. 1993(06)

博士論文
[1]轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析在玉米籽粒功能基因挖掘中的應(yīng)用[D]. 何騁.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017



本文編號：3517881