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‘培矮64S’與其eui突變體‘長選3S’穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)組差異分析

發(fā)布時間:2021-11-16 12:40
  為從蛋白質(zhì)表達水平了解長穗頸溫敏核不育水稻穗頸節(jié)間伸長機理,該研究以長穗頸(EUI)溫敏核不育水稻‘長選3S’為材料,溫敏核不育水稻‘培矮64S’為對照,采用固相pH梯度雙向凝膠電泳和質(zhì)譜分析方法,對2個水稻材料抽穗前2 d的穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)進行分離,并進行差異蛋白質(zhì)組學的比較研究。結(jié)果表明:(1)獲得了分辨率和重復性較好的雙向凝膠電泳圖譜。(2)對40個差異蛋白質(zhì)點進行MALDI-TOF-TOF-MS肽質(zhì)譜指紋圖譜分析,成功鑒定其中27個差異蛋白質(zhì)點;與‘培矮64S’相比,‘長選3S’中有17個上調(diào)表達和10個下調(diào)表達的蛋白質(zhì)。(3)差異蛋白質(zhì)按照其功能可分為6類,其中主要是與細胞代謝相關蛋白,其次是與細胞壁重建相關蛋白;并且這些差異蛋白質(zhì)可能與‘長選3S’抽穗期穗頸節(jié)間劇烈伸長生長有關,尤其是細胞壁重建相關蛋白與細胞的伸長密切相關。(4)實時熒光定量PCR對隨機挑選的蛋白點2、7、8、24、35和36所對應的基因在兩個材料最上節(jié)間的表達結(jié)果顯示,‘長選3S’的2(Os10g08550)、7(Os12g42876)、8(Os01g55830)基因的表達量較‘培矮64S’明顯下調(diào),而24... 

【文章來源】:西北植物學報. 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:12 頁

【部分圖文】:

‘培矮64S’與其eui突變體‘長選3S’穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)組差異分析


鑒定的蛋白質(zhì)點2-DE放大圖

熒光定量PCR,基因,相關蛋白,蛋白質(zhì)


為深入解析eui突變體‘長選3S’的抽穗性狀與差異表達蛋白質(zhì)之間的內(nèi)在聯(lián)系,將鑒定的蛋白質(zhì)在Mascot (http://www.matrixscience.com)網(wǎng)站對本地數(shù)據(jù)庫進行檢索,并根據(jù)相關文獻報道對這些蛋白質(zhì)按照功能進行分類(表3)。由表3可知,這些得到成功鑒定的蛋白質(zhì)可分為6類:(1) 碳水化合物與能量代謝相關蛋白,占鑒定蛋白數(shù)的33.33% (下同); (2) 氨基酸代謝相關蛋白,占11.11%;(3) 細胞壁重建相關蛋白,占25.93%; (4) 細胞解毒相關蛋白,占18.52%; (5) 基因表達調(diào)控相關蛋白,占7.41%和(6) 細胞骨架相關蛋白,占3.70%。其中與代謝(如碳水化合物與能量代謝、氨基酸代謝及細胞解毒等)相關的蛋白質(zhì)較多,占鑒定蛋白數(shù)的62.96%,其次是細胞壁重建相關蛋白。2.5 實時熒光定量PCR分析

形態(tài)圖,蛋白質(zhì),植株,條件


根據(jù)差異蛋白質(zhì)的表達質(zhì)量,對40個差異蛋白質(zhì)點進行了肽質(zhì)量指紋圖譜分析及數(shù)據(jù)庫檢索,最終有27個蛋白質(zhì)點得到成功鑒定(表3),占總差異蛋白質(zhì)點的67.5%。與‘培矮64S’相比,這些鑒定的蛋白質(zhì)中,有10個在‘長選3S’穗頸節(jié)中表達下調(diào)的蛋白質(zhì)(圖3,A)和17個表達上調(diào)的蛋白質(zhì)(圖3,B)。其余13個蛋白質(zhì)點未能得到鑒定,這可能是由于目標蛋白質(zhì)含量較少,在MALDI-TOF-TOF-MS分析中不易得到較高質(zhì)量的肽質(zhì)譜指紋圖,或者因為匹配率和覆蓋率較低等原因,增加了解譜難度,最終影響蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫檢索鑒定的成功率。表2 20 ℃條件下‘長選3S’與‘培矮64S’性狀比較Table 2 Comparison of morphological traits between ‘Changxuan 3S’ and ‘Peiai 64S’ at 20 ℃ 材料Material 稈高Culm length/cm 劍葉鞘長Leaf sheath/cm 最上節(jié)間長度Uppermost internode/cm 穗頸伸出度Panicle extension/cm 花粉可染Stainable pollen/% 自交結(jié)實率Selfed seeds/% 長選3S Changxuan 3S 89.46±0.43** 34.84±1.87** 47.53±2.57** 12.65±1.77** 85.32±0.57 33.74±1.57 培矮64S Peiai 64S 68.37±0.52 30.57±1.54 24.64±2.15 -5.93±1.18 87.88±0.57 34.71±2.64 注:**為t測驗0.01顯著水平Note: ** is t test 0.01 level significance

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]植物發(fā)育突變體的蛋白質(zhì)組學研究[D]. 蕭小鵑.湖南大學 2008
[2]長穗頸eui基因促進溫敏核不育水稻最上節(jié)間伸長機理的研究[D]. 梁滿中.湖南師范大學 2008



本文編號:3498909

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