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小麥穗發(fā)芽抗性基因的全基因組關(guān)聯(lián)分析及等位變異發(fā)掘

發(fā)布時(shí)間:2021-11-13 00:35
  小麥?zhǔn)鞘澜缟献钪饕募Z食作物之一,在收獲前若遇連陰雨天氣或在濕熱環(huán)境中儲(chǔ)藏時(shí)間較長(zhǎng)則易發(fā)生穗發(fā)芽。穗發(fā)芽的發(fā)生嚴(yán)重影響小麥的產(chǎn)量和加工品質(zhì),從而給農(nóng)作物生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。本研究通過穗上發(fā)芽和籽粒發(fā)芽的試驗(yàn)方法,于2017年和2018年對(duì)383份小麥材料進(jìn)行了穗發(fā)芽抗性鑒定,明確我國(guó)北方冬麥區(qū)主要小麥材料的穗發(fā)芽抗性狀況,利用已有660K的SNP芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),尋找與小麥穗發(fā)芽抗性顯著相關(guān)的遺傳位點(diǎn);同時(shí)克隆10個(gè)已報(bào)道的控制穗發(fā)芽抗性的基因,通過三代測(cè)序技術(shù)發(fā)掘與穗發(fā)芽抗性相關(guān)的等位變異,尋找新的等位變異遺傳位點(diǎn),為改良小麥穗發(fā)芽抗性提供基因資源。主要結(jié)果如下:穗發(fā)芽表型數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明,材料間發(fā)芽率差異顯著,遺傳變異十分豐富。穗上發(fā)芽及籽粒發(fā)芽的重復(fù)間相關(guān)性均較高,表明這些性狀遺傳力較高,表型變異主要由遺傳控制,但穗上發(fā)芽與籽粒發(fā)芽間相關(guān)性較低,表明二者的遺傳基礎(chǔ)不同。GWAS在多個(gè)環(huán)境共檢測(cè)到17個(gè)顯著穩(wěn)定的關(guān)聯(lián)位點(diǎn),穗上發(fā)芽與籽粒發(fā)芽的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)存在明顯差異,也表明控制這兩個(gè)性狀背后的遺傳機(jī)制存在差異。穗上發(fā)芽共檢測(cè)到6個(gè)顯著的穩(wěn)定關(guān)聯(lián)位點(diǎn),其中以3... 

【文章來(lái)源】:北京農(nóng)學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

小麥穗發(fā)芽抗性基因的全基因組關(guān)聯(lián)分析及等位變異發(fā)掘


2017年小麥穗發(fā)芽率不同環(huán)境下的相關(guān)性分析

小麥穗發(fā)芽,相關(guān)性分析,發(fā)芽率,籽粒發(fā)芽


表 3-4 2018 年小麥發(fā)芽率不同環(huán)境下相關(guān)性分析Table 3-4 Correlation analysis of different wheat germination rates in 2018環(huán)境EnvironmentSeed.R1 Seed.R2 Seed.R3 Seed. Mean Spike.R1 Spike.R2 Spike.R3Seed. R2 0.88 **Seed. R3 0.87 ** 0.89 **Seed. Mean 0.96 ** 0.96 ** 0.96 **Spike.R1 0.21 0.19 0.21 0.21Spike.R2 0.12 0.12 0.13 0.13 0.87 **Spike.R3 0.11 0.11 0.14 0.12 0.85 ** 0.88 **Spike.Mean 0.16 0.15 0.16 0.16 0.95 ** 0.96 ** 0.95 **發(fā)芽率和籽粒發(fā)芽率分別用Spike和Seed表示,Mean 表示平均發(fā)芽率,R表示重復(fù)組 **表示相關(guān)性達(dá)到極顯著(P<0.01)

曼哈頓,小麥穗,發(fā)芽率,群體


圖 3:小麥穗上發(fā)芽率在關(guān)聯(lián)群體中的曼哈頓圖和 Q-Q 圖Figure 3: Manhattan and Q-Q plots of germination rate on wheat spikes in associated populations曼哈頓圖中藍(lán)色和紅色橫線分別為篩選關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的顯著性閾值線,Q-Q 圖中紅色直線為預(yù)期值

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3491955

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