簇毛麥6V#4S特異標(biāo)記連鎖圖譜建立與小麥染色體新易位系創(chuàng)制
發(fā)布時(shí)間:2021-11-07 17:20
簇毛麥(Dasypyrum villosum(L.)P.Candary,syn.Haynaldia villosa Schur)是小麥的近緣種屬,含有多種有益基因。Pm97033是小麥-簇毛麥T6V#4S·6DL臂間易位系,攜帶簇毛麥抗白粉病基因PmV,廣譜高抗小麥白粉病,且其基因序列及其對多數(shù)白粉菌株的反應(yīng)型與位于6V#2S上的抗白粉病基因Pm21有差異,因此,是1個(gè)具有潛在應(yīng)用價(jià)值的白粉病優(yōu)異抗源。然而,T6V#4S·6DL易位染色體在雜種后代中的遺傳傳遞率較低,在育種上尚未廣泛利用。為了解析引起T6V#4S·6DL易位染色體遺傳不穩(wěn)定的原因,靶向改造T6V#4S·6DL易位染色體,促進(jìn)其在育種中的利用,本項(xiàng)目通過:(1)開發(fā)PmV和Pm21基因以及6A,6D特異的分子標(biāo)記以便于分子標(biāo)記輔助選擇;(2)將T6V#4S·6DL和T6V#2S·6AL易位染色體同時(shí)導(dǎo)入ph1b突變體的遺傳背景中,以誘導(dǎo)外源染色體臂間的基因重組;(3)輻射處理T6V#4S·6DL易位系植株花粉以截短6V#4S的非靶標(biāo)區(qū)域;(4)利用6V#4(6D)和6V#2(6A)2個(gè)異代換系雜交及雜種F2
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本研究技術(shù)路線圖
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論第二章PmV/Pm21基因及小麥6AS和6DS特異分子標(biāo)記的開發(fā)9圖2-1PmV和Pm21的分子標(biāo)記的開發(fā)以及其在染色體分布Fig.2-1PmVandPm21specificmarkersandtheirchromosomaldistributiona:特異于PmV基因及Pm21基因的所有標(biāo)記分布示意圖;b:特異于PmV及Pm21基因的分子標(biāo)記的開發(fā);M:DL5000;1:宛7107;2:易位系T6V#4S·6DL(Pm97033);3:簇毛麥No.1026;4:易位系T6V#2S·6AL(10SR3109);5:簇毛麥D.v#2a:TheschematicdiagramofthedistributionofallprimersforthePmVgeneandPm21gene;b:DevelopmentofmolecularmarkersofthePmVgeneandPm21gene;M:DL5000;1:Wan7107;2:T6V#4S·6DLtranslocationlinePm97033;3:D.villosumNo.1026;4:T6V#2S·6ALtranslocationline10SR3109;5:D.villosum#22.3.2小麥6AS和6DS染色體的特異分子標(biāo)記開發(fā)首先利用中國春第六群缺體四體系的DNA以及小麥宛7107為模板,對2.2.1設(shè)計(jì)的197對引物進(jìn)行初步篩選,發(fā)現(xiàn)有1對引物N-P4可在小麥宛7107和CSN6BT6A、CSN6BT6D、CSN6DT6A和CSN6DT6B中擴(kuò)增出相同大小的條帶,而不能在CSN6AT6B和CSN6AT6D中擴(kuò)增出此條帶,表明N-P4是6AS特異的分子標(biāo)記(圖2-2a);另外1對引物N-P5可在小麥宛7107,CSN6BT6A和CSN6BT6D中擴(kuò)增出兩條帶,而只能在CSN6AT6B、CSN6AT6D擴(kuò)增出分子量較大的條帶,在CSN6DT6A、CSN6DT6B中擴(kuò)增出較小的條帶,表明該標(biāo)記N-P5是6AS/6DS的共顯性標(biāo)記(圖2-2b);除此之外還有2對標(biāo)記ND-P7和ND-P8可在小麥宛7107和CSN6AT6B、CSN6AT6D、CSN6BT6A和CSN6BT6D中擴(kuò)增出同一大小條帶,但是無法在CSN6DT6A和CSN6DT6B中擴(kuò)增出相應(yīng)的條帶,表明這兩個(gè)標(biāo)記為6DS特異標(biāo)記(圖2-2c和圖2-2d)。由于這4對引物位于小麥第六同源群的短臂上,對分別缺失6AS和6DS的易位系T6V#2S.6AL(10SR3109)和T6V
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論第二章PmV/Pm21基因及小麥6AS和6DS特異分子標(biāo)記的開發(fā)10擴(kuò)增出6AS特異條帶,在易位系T6V#4S.6DL中則相反,擴(kuò)增出6AS特異帶,沒有擴(kuò)增出6DS特異帶,證明該標(biāo)記為6AS和6DS的多態(tài)性標(biāo)記(圖2-2f)。標(biāo)記ND-P7和ND-P8均可在小麥宛7107和易位系T6V#2S.6AL中擴(kuò)增出同一大小的條帶,而不能在易位系T6V#4S.6DL擴(kuò)增,證明這兩個(gè)標(biāo)記是特異于6DS的標(biāo)記(圖2-2g和2-2h)。圖2-2特異于6AS和6DS的分子標(biāo)記在小麥、小麥第六群缺體四體以及易位系中的擴(kuò)增圖譜Fig.2-2Amplificationpatternsof6AS-/6DS-specificmolecularmarkersinwheat,nulli-tetrasomiclinesof6A,6B,and6D,andtranslocationlinesa和e是標(biāo)記N-P4的擴(kuò)增圖譜;b和f是標(biāo)記N-P5的擴(kuò)增圖譜;c和g是標(biāo)記ND-P7的擴(kuò)增圖譜;d和h是標(biāo)記ND-P8的擴(kuò)增圖譜;M:DL5000;1和8:宛7107;2:CSN6AT6B;3:CSN6AT6D;4:CSN6BT6A;5:CSN6BT6D;6:CSN6DT6A;7:CSN6DT6B;9:易位系T6V#4S·6DL(Pm97033);10:易位系T6V#2S·6AL(10SR3109)aande:sampleswereamplifiedbymarkerN-P4.bandf:sampleswereamplifiedbymarkerN-P5.candg:sampleswereamplifiedbymarkerND-P7.dandh:sampleswereamplifiedbymarkerND-P8.M:DL5000;1and8:Wan7107;2:CSN6AT6B;3:CSN6AT6D;4:CSN6BT6A;5:CSN6BT6D;6:CSN6DT6A;7:CSN6DT6B;9:T6V#4S·6DLtranslocationlinePm97033;10:T6V#2S·6ALtranslocationline10RS31092.4討論DNA分子標(biāo)記是以生物個(gè)體間核苷酸序列變異為基礎(chǔ)的遺傳標(biāo)記,因此,可以直接在DNA水平上檢測生物個(gè)體之間的遺傳差異(熊發(fā)前等,2010;PANGetal.,2014)。分子標(biāo)記在分子生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用非常廣泛。分子標(biāo)記在基因組水平不僅可以檢測外源染色體片段,也可以用于鑒定不同的品種(CHENGetal.,2013),還可以檢測親代與子代在DNA水?
本文編號:3482249
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中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論第二章PmV/Pm21基因及小麥6AS和6DS特異分子標(biāo)記的開發(fā)9圖2-1PmV和Pm21的分子標(biāo)記的開發(fā)以及其在染色體分布Fig.2-1PmVandPm21specificmarkersandtheirchromosomaldistributiona:特異于PmV基因及Pm21基因的所有標(biāo)記分布示意圖;b:特異于PmV及Pm21基因的分子標(biāo)記的開發(fā);M:DL5000;1:宛7107;2:易位系T6V#4S·6DL(Pm97033);3:簇毛麥No.1026;4:易位系T6V#2S·6AL(10SR3109);5:簇毛麥D.v#2a:TheschematicdiagramofthedistributionofallprimersforthePmVgeneandPm21gene;b:DevelopmentofmolecularmarkersofthePmVgeneandPm21gene;M:DL5000;1:Wan7107;2:T6V#4S·6DLtranslocationlinePm97033;3:D.villosumNo.1026;4:T6V#2S·6ALtranslocationline10SR3109;5:D.villosum#22.3.2小麥6AS和6DS染色體的特異分子標(biāo)記開發(fā)首先利用中國春第六群缺體四體系的DNA以及小麥宛7107為模板,對2.2.1設(shè)計(jì)的197對引物進(jìn)行初步篩選,發(fā)現(xiàn)有1對引物N-P4可在小麥宛7107和CSN6BT6A、CSN6BT6D、CSN6DT6A和CSN6DT6B中擴(kuò)增出相同大小的條帶,而不能在CSN6AT6B和CSN6AT6D中擴(kuò)增出此條帶,表明N-P4是6AS特異的分子標(biāo)記(圖2-2a);另外1對引物N-P5可在小麥宛7107,CSN6BT6A和CSN6BT6D中擴(kuò)增出兩條帶,而只能在CSN6AT6B、CSN6AT6D擴(kuò)增出分子量較大的條帶,在CSN6DT6A、CSN6DT6B中擴(kuò)增出較小的條帶,表明該標(biāo)記N-P5是6AS/6DS的共顯性標(biāo)記(圖2-2b);除此之外還有2對標(biāo)記ND-P7和ND-P8可在小麥宛7107和CSN6AT6B、CSN6AT6D、CSN6BT6A和CSN6BT6D中擴(kuò)增出同一大小條帶,但是無法在CSN6DT6A和CSN6DT6B中擴(kuò)增出相應(yīng)的條帶,表明這兩個(gè)標(biāo)記為6DS特異標(biāo)記(圖2-2c和圖2-2d)。由于這4對引物位于小麥第六同源群的短臂上,對分別缺失6AS和6DS的易位系T6V#2S.6AL(10SR3109)和T6V
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論第二章PmV/Pm21基因及小麥6AS和6DS特異分子標(biāo)記的開發(fā)10擴(kuò)增出6AS特異條帶,在易位系T6V#4S.6DL中則相反,擴(kuò)增出6AS特異帶,沒有擴(kuò)增出6DS特異帶,證明該標(biāo)記為6AS和6DS的多態(tài)性標(biāo)記(圖2-2f)。標(biāo)記ND-P7和ND-P8均可在小麥宛7107和易位系T6V#2S.6AL中擴(kuò)增出同一大小的條帶,而不能在易位系T6V#4S.6DL擴(kuò)增,證明這兩個(gè)標(biāo)記是特異于6DS的標(biāo)記(圖2-2g和2-2h)。圖2-2特異于6AS和6DS的分子標(biāo)記在小麥、小麥第六群缺體四體以及易位系中的擴(kuò)增圖譜Fig.2-2Amplificationpatternsof6AS-/6DS-specificmolecularmarkersinwheat,nulli-tetrasomiclinesof6A,6B,and6D,andtranslocationlinesa和e是標(biāo)記N-P4的擴(kuò)增圖譜;b和f是標(biāo)記N-P5的擴(kuò)增圖譜;c和g是標(biāo)記ND-P7的擴(kuò)增圖譜;d和h是標(biāo)記ND-P8的擴(kuò)增圖譜;M:DL5000;1和8:宛7107;2:CSN6AT6B;3:CSN6AT6D;4:CSN6BT6A;5:CSN6BT6D;6:CSN6DT6A;7:CSN6DT6B;9:易位系T6V#4S·6DL(Pm97033);10:易位系T6V#2S·6AL(10SR3109)aande:sampleswereamplifiedbymarkerN-P4.bandf:sampleswereamplifiedbymarkerN-P5.candg:sampleswereamplifiedbymarkerND-P7.dandh:sampleswereamplifiedbymarkerND-P8.M:DL5000;1and8:Wan7107;2:CSN6AT6B;3:CSN6AT6D;4:CSN6BT6A;5:CSN6BT6D;6:CSN6DT6A;7:CSN6DT6B;9:T6V#4S·6DLtranslocationlinePm97033;10:T6V#2S·6ALtranslocationline10RS31092.4討論DNA分子標(biāo)記是以生物個(gè)體間核苷酸序列變異為基礎(chǔ)的遺傳標(biāo)記,因此,可以直接在DNA水平上檢測生物個(gè)體之間的遺傳差異(熊發(fā)前等,2010;PANGetal.,2014)。分子標(biāo)記在分子生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用非常廣泛。分子標(biāo)記在基因組水平不僅可以檢測外源染色體片段,也可以用于鑒定不同的品種(CHENGetal.,2013),還可以檢測親代與子代在DNA水?
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