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茶樹(shù)R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-01 02:43
  茶樹(shù)是典型的富鋁(A1)嗜氟(F)的植物,鋁和氟在茶樹(shù)的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中具有重要的作用。轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors,TFs)在植物生理生長(zhǎng)和脅迫生長(zhǎng)中發(fā)揮著重要的作用,它參與植物逆境應(yīng)答反應(yīng),是植物抗逆反應(yīng)體系中調(diào)控功能基因表達(dá)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),如AP2/EREBP、MYB、NAC、WRKY和bZIP等。其中,MYB類轉(zhuǎn)錄因子是植物體內(nèi)最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,在植物抗逆脅迫過(guò)程中也起著重要的作用。作為MYB類轉(zhuǎn)錄因子中數(shù)目最多且功能多樣化的一類MYB蛋白-R2R3-MYB亞類,其涉及植物中多個(gè)非生物脅迫的過(guò)程。然而,茶樹(shù)中關(guān)于R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的報(bào)道很少。因此,在本研究研究中,我們主要篩選和鑒定了茶樹(shù)R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子,并且分析了其在不同組織和不同濃度的Al3+和F-處理下的相對(duì)表達(dá)量。本研究從本課題組已有的茶樹(shù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中,利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的在線搜索工具BLAST程序鑒定出43個(gè)屬于R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的CsMYB基因。這些基因被命名為CsMYB01至CsMYB43。另外,根據(jù)MEME在線軟件預(yù)測(cè)了 43個(gè)茶樹(shù)R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的保... 

【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

茶樹(shù)R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及表達(dá)分析


圖2-3?CsMYB的R2R3結(jié)構(gòu)域序列標(biāo)識(shí)logo圖

亞族,蛋白,茶樹(shù)


12個(gè)擬南芥R2R3-MYB類AtMYB蛋白與43個(gè)茶樹(shù)R2R3-MYB類CsMYB蛋白進(jìn)行??聚類,依據(jù)擬南芥R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子的分類標(biāo)準(zhǔn)[231,茶樹(shù)的43個(gè)CsMYB蛋白??被進(jìn)一步分類成25個(gè)亞族(如圖2-1)。其中,亞族5,亞族6,亞族10至亞族12,??亞族19,亞族23沒(méi)有比對(duì)上的CsMYB蛋白,亞族7,亞族9,亞族13,亞族16,??亞族17,亞族20和亞族25各有1個(gè)CsMYB蛋白;亞族2,亞族3,亞族15,亞族??18,亞族21和亞族24各有2個(gè)CsMYB蛋白;亞族1有3個(gè)CsMYB蛋白;亞族8??有4個(gè)CsMYB蛋白;亞族4有5個(gè)CsMYB蛋白;亞族14和亞族22各有6個(gè)CsMYB??蛋白[7]。為了進(jìn)一步研究茶樹(shù)CsMYB蛋白的功能,根據(jù)前人的研宄報(bào)道,本研究從??43個(gè)茶樹(shù)CsMYB蛋白中篩選出9個(gè)與非生物脅迫相關(guān)的CsMYB候選蛋白進(jìn)行下一??步研宄,它們分屬于亞族4,亞族13,亞族17,亞族22(CyM75//,CyMr5i7,CvMy_fi29,??卵至CsMKSW)。將這9個(gè)CsMYB候選蛋白運(yùn)用DNAMAN軟??R2?domain??CsMYB?17???aiNHIIK'i?JHGC?pSVPKLAGLCPC^^^Slff?^?IP?|D?51??CsMYB29?\?IiE^FL|?eEGP?IF??D?51??CSMYB38?g?Js?滅?SCF?g涵?薦顧讓?cffc5。??CSMYB39?g?j?j趣

花粉,茶樹(shù),花粉管,第四


圖3-1?9個(gè)茶樹(shù)CsMYB基因在不同組織(根,莖,第一葉,花,果,芽,第四葉,花粉,花粉??管)中的相對(duì)表達(dá)量。??Fig.3-1?The?relative?expression?levels?of?nine?CsMYB?genes?in?different?tissues?(root,?stem,?first?leaf,??flower,?fourth?leaf,?pollen,?pollen?tube).??外(亞族22)在莖中的表達(dá)量最高,在花粉中的表達(dá)量最低。CvMTBW?(亞??族22)在花和花粉管的表達(dá)量都很高,幾乎是相同的表達(dá)水平,莖次之。??(亞族22)在花粉管中的表達(dá)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其它組織的表達(dá)水平,表明(亞??族22)基因在花粉管中的特異性表達(dá)。(亞族22)的表達(dá)主要集中在果實(shí)??和花粉管中,且(亞族22)在果實(shí)中的表達(dá)水平明顯高于花粉管中的表達(dá)??水平,在果實(shí)中的表達(dá)量是其根的13倍,在花粉管中的表達(dá)量是其根的7倍,在其??它組織中幾乎不表達(dá)^??24??


本文編號(hào):3469366

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