水稻作為人類淀粉的主要攝取來源,是全球重要的糧食作物之一,它在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中具有舉足輕重的地位。隨著世界人口不斷增加,水稻的需求量日漸上漲,然而干旱、鹽以及重金屬等非生物脅迫卻嚴(yán)重影響到水稻產(chǎn)量,并且呈明顯上升趨勢(shì),其中鹽脅迫由于鹽堿地的不斷蔓延,目前這種趨勢(shì)變得更為突出,因此進(jìn)行水稻鹽脅迫響應(yīng)機(jī)制研究將有利于人們對(duì)水稻耐鹽分子機(jī)理的認(rèn)識(shí),最終有利于水稻耐鹽分子育種。本研究利用RNA-seq技術(shù),對(duì)正常和鹽脅迫處理水稻的葉片和根進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,旨在探究鹽脅迫對(duì)全基因組水平基因表達(dá)的影響,進(jìn)而有利于水稻耐鹽標(biāo)記的篩選和應(yīng)用;同時(shí)為后期鑒定鹽響應(yīng)的啟動(dòng)子和增強(qiáng)子等功能性DNA元件打下基礎(chǔ)。為進(jìn)一步探究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)水平上的變化是如何影響鹽脅迫響應(yīng)基因的差異表達(dá)情況,本研究還對(duì)上述水稻兩種組織分別進(jìn)行組蛋白修飾相關(guān)的ChIP-seq分析,所用的組蛋白相關(guān)的抗體為H3K4/27/36me3,H3K9/27ac和H4K12ac,該分析一方面有利于探究鹽脅迫引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化情況,同時(shí)揭示各組蛋白修飾與基因差異表達(dá)的關(guān)系,從而從染色體結(jié)構(gòu)變化方面來解釋水稻耐鹽的表觀分子機(jī)制。本論文取得的主要研究結(jié)果如下:... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：86 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１不同細(xì)胞器中的脅迫感應(yīng)和信號(hào)傳導(dǎo)（Ａ）各細(xì)胞器脅迫感應(yīng)模型

強(qiáng)光等非生物脅迫，不僅在受到脅迫的部位產(chǎn)生威脅，同樣對(duì)遠(yuǎn)端組織也會(huì)產(chǎn)生影響，??導(dǎo)致系統(tǒng)性獲得適應(yīng)性（ＳＡＡ），ＳＡＡ包含長(zhǎng)距離滲透壓信號(hào)和離子信號(hào)既２１］，例如??Ｃａ２＋和ＲＯＳ信號(hào)（圖１－２）。鹽脅迫使植株體內(nèi)的Ｃａ２＋和ＲＯＳ信號(hào)以ｌｃｍ／ｓ的速度傳??輸，這種現(xiàn)象分別在鈣敏感熒光蛋白的轉(zhuǎn)基因植株？和一個(gè)ＲＯＳ相關(guān)啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)熒??光素酶的表達(dá)實(shí)驗(yàn)中得到了驗(yàn)證Ｍ〇Ｃａ２＋和ＲＯＳ信號(hào)可以引起植物組織末梢細(xì)胞脅迫??相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)，ＲＯＳ必須在質(zhì)膜上ＮＡＤＰＨ氧化酶ＲｂｏｈＤ的作用下才能起作??用，此外Ｃａ２＋信號(hào)傳導(dǎo)也依賴于液泡上ＴＰＣ１離子通道，因?yàn)椋裕校茫蓖ǖ烙兄冢茫幔玻??的跨膜釋放。ＲＯＳ信號(hào)可以激活Ｃａ２＋依賴激酶ＣＰＫ，ＣＰＫ５可使ＲｂｏｈＤ發(fā)生磷酸化，??從而做出應(yīng)激響應(yīng)［２４，２５１??．．．ｈＡ??ｉ?；?；??：?Ｃａ。?！?Ｃａ？－??ＲｂｏｈＤ?；?ｐｊｐ?ｊ?ＲｔＫ?｜?ＲｂｏｈＤ?ｐｊｐ?＊?ＲＬＫ?ＲｂｏｈＤ??、－－?＼?｝＇?々一—－－?－．．?；：；??；狗?｜?ｐ？…．ｉ?．?．？？……??ＣＰＫ５．?ＣＰＫ５，??Ｃａ－＇＊?—？?ＣＢＬｓ－?Ｃａ２＊?￣￣？?ＣＢＬｓ－??ＣＩＰＫｓ?ＣＩＰＫｓ??■?■?．?．?．．．?－?－－－－－?．．?？?＿?．?

第一部分文獻(xiàn)綜述脅迫對(duì)組蛋白修飾的影響??免疫沉淀測(cè)序（ＣｈＩＰ－ｓｅｑ）是近年來將新一代測(cè)序技術(shù)，在全基因組水平上分析組蛋白修飾、ＤＮＡ甲基化、ＤＮ體定位的高通量測(cè)序技術(shù)由于測(cè)序技術(shù)的不斷革ｈｉｐ分辨率不高、高噪音、低覆蓋率等問題，隨著測(cè)序價(jià)步成為許多實(shí)驗(yàn)室用來研宄基因調(diào)控機(jī)理和表觀遺傳機(jī)說，ＣｈＩＰ－ｓｅｑ包括兩個(gè)部分，分別是高通量測(cè)序和染色：首先，通過組蛋白特異抗體富集目的蛋白，然后用帶下來，達(dá)到收集ＤＮＡ的目的；然后將富集的ＤＮＡ構(gòu)平臺(tái)進(jìn)行文庫(kù)的測(cè)序。最終我們得到數(shù)百萬條序列，我，從而得到了這些ＤＮＡ片段與組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子的集ｉ??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3428771