發(fā)布時間：2021-10-07 18:30

　　隨著植物基因序列分析技術(shù)的日新月異的發(fā)展和測序成本的不斷降低,NCBI-EST數(shù)據(jù)庫容量每年都以成幾何倍數(shù)增長,不斷推動著包括EST-SSR在內(nèi)的各種分子標記技術(shù)在諸多植物中得到批量開發(fā)并實施相關(guān)研究。蒙古冰草是一種極耐旱的禾本科牧草,作為具有優(yōu)良抗性基因的牧草,目前分子水平上有關(guān)遺傳信息等研究相對較少,少數(shù)一些相關(guān)的報道也只停留在小麥的基因組學內(nèi),這在一定程度上制約了該種優(yōu)良牧草的合理利用。本論文采用高通量測序技術(shù),盡可能多的獲得蒙古冰草轉(zhuǎn)錄本序列信息,并對其進行系統(tǒng)注釋,鑒定轉(zhuǎn)錄本中的SSR位點,并篩選具有多態(tài)性的SSR,以期為蒙古冰草種質(zhì)資源的研究利用以及新品種選育提供依據(jù)。其主要結(jié)果如下:（1）利用Illumina HiSeq高通量測序技術(shù),在蒙古冰草葉片轉(zhuǎn)錄組中獲得了24237250個高質(zhì)量序列,將其拼裝組成75367條非冗余基因片段,經(jīng)系統(tǒng)評估結(jié)果顯示,序列組裝完整性較高,可滿足后續(xù)分析。將全部Unigene與Nr、KEGG等8個數(shù)據(jù)庫比對,其中得到37826（50.19%）個有注釋信息的基因。（2）利用MISA工具,含有SSR位點的EST序列為3751條,共有4396個S... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１?Ｕｎｉｇｅｎｅｓ長度分布圖??Ｆｉｇ．?１?ｕｎｉｇｅｎｅ?ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??

圖２?Ｎｒ同源種分布??Ｆｉｇ?２?Ｎｒ?ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ?ｓｐｅｃｉｅｓ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??

圖３?Ｕｎｉｇｅｎｅｓ序列的ＧＯ分析??Ｆｉｇ．?３?ｕｍｍａｒｙ?ｏｆ?ＧＯ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｕｎｉｇｅｎｅｓ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ．??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]黑果枸杞轉(zhuǎn)錄組SSR信息分析及分子標記開發(fā)[J]. 尹躍,安巍,趙建華,王亞軍,樊云芳,曹有龍.  浙江農(nóng)林大學學報. 2019(02)
[2]中國南瓜轉(zhuǎn)錄組SSR信息分析及其分子標記開發(fā)[J]. 朱海生,王彬,葉新如,劉建汀,李永平,陳敏氡,林琿,溫慶放.  中國細胞生物學學報. 2019(03)
[3]應(yīng)用ISSR分子標記分析裸大麥的遺傳多樣性[J]. 張超,才讓卓瑪,卡毛先,段瑞君.  分子植物育種. 2020(04)
[4]基于桑葚轉(zhuǎn)錄組測序的SSR位點分析[J]. 王暉,謝巖,孫志超,高玉軍,張東豪,宋永學,高妍夏.  分子植物育種. 2020(01)
[5]內(nèi)蒙古珍稀瀕危植物瀕�，F(xiàn)狀及優(yōu)先保護評估[J]. 劉哲榮,劉果厚,高潤宏.  應(yīng)用生態(tài)學報. 2019(06)
[6]夏枯草的轉(zhuǎn)錄組測序與次生代謝產(chǎn)物生物合成相關(guān)基因的挖掘[J]. 朱畇昊,張夢佳,李璐,趙樂,董誠明.  中草藥. 2019(05)
[7]大麥蛋白質(zhì)含量與SSR標記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 司二靜,楊淑蓮,孟亞雄,李葆春,馬小樂,汪軍成,任盼榮,姚立蓉,張宇,王化俊.  麥類作物學報. 2019(03)
[8]葉銹菌侵染的小麥葉片轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析[J]. 劉娜,喬妹,孫嘉偉,陳琰,侯春燕,韓勝芳,王冬梅.  植物遺傳資源學報. 2019(04)
[9]苦玄參轉(zhuǎn)錄組EST-SSR引物開發(fā)及群體遺傳多樣性分析[J]. 閆國躍,楊帆,白燕遠,李耀燕,吳夢麗,阿里穆斯,謝陽姣.  中草藥. 2019(01)
[10]基于EST-SSR標記的部分玉蘭屬植物親緣關(guān)系分析[J]. 王型力,駱甲,姚張秀,俞芹,王亞玲,張壽洲,申亞梅.  分子植物育種. 2018(24)

博士論文
[1]利用RNA-seq技術(shù)在云南山茶中解析重要分子通路與開發(fā)多態(tài)性EST-SSR[D]. 姚秋陽.云南大學 2015
[2]牧草種子萌發(fā)對溫度和水分脅迫的反應(yīng)[D]. 王麗娟.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2008
[3]內(nèi)蒙古冰草種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[D]. 李景欣.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2005
[4]玉蜀黍?qū)倩蚪M構(gòu)成及玉米新種質(zhì)創(chuàng)制研究[D]. 唐祈林.四川農(nóng)業(yè)大學 2003
[5]蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng）的遺傳多樣性研究[D]. 解新明.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2001

碩士論文
[1]水松EST-SSR分子標記開發(fā)及群體遺傳變異分析[D]. 林雪瑩.中南林業(yè)科技大學 2018
[2]應(yīng)用孢粉學和SNP分析廣西地方柑橘種質(zhì)資源遺傳多樣性[D]. 武曉曉.廣西師范大學 2018
[3]基于SSR分子標記的新麥草種質(zhì)遺傳多樣性及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 張晨.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[4]利用EST-SSR分子標記構(gòu)建小麥遺傳圖譜[D]. 代暢.西華師范大學 2018
[5]基于轉(zhuǎn)錄組信息的玫瑰SSR標記開發(fā)及野生玫瑰遺傳多樣性分析[D]. 夏峰梅.山東農(nóng)業(yè)大學 2016
[6]飼草型小黑麥的遺傳圖譜構(gòu)建及草產(chǎn)量和抗銹病相關(guān)基因的QTL定位[D]. 李冬梅.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2016
[7]老芒麥EST-SSR分子標記開發(fā)與遺傳多樣性分析[D]. 周強.蘭州大學 2016
[8]9個居群蒙古冰草染色體倍性檢測及遺傳多樣性SSR分析[D]. 高友漢.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2013
[9]不同小麥品種（系）耐鹽特性及RAPD初步分析[D]. 陳小梅.新疆農(nóng)業(yè)大學 2013



本文編號：3422555