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水稻苗期耐冷性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及主效QTL的精細(xì)定位與應(yīng)用

發(fā)布時間:2021-09-30 16:58
  植物在生長過程中會遇到各種變化的環(huán)境條件。其中,低溫脅迫是影響作物生長、產(chǎn)量和限制作物地理分布的主要逆境環(huán)境因素之一。水稻是世界上最主要的糧食作物之一,世界上一半人口以大米為主食。水稻起源于熱帶和亞熱帶地區(qū),相對于大麥、小麥等其它農(nóng)作物,水稻對低溫脅迫更為敏感,高緯度和高海拔地區(qū)的水稻也更容易遭受冷害的影響。即使在溫度適宜區(qū)種植水稻,連續(xù)數(shù)天的低溫也會對水稻的生長和產(chǎn)量造成重要影響。因此,發(fā)掘重要的水稻耐冷資源,并剖析其耐冷機制,有利于指導(dǎo)水稻耐冷分子設(shè)計育種。本研究利用全基因組關(guān)聯(lián)分析方法,鑒定到一個主效的苗期耐冷QTL,并利用圖位克隆方法對qCT11進行精細(xì)定位。主要結(jié)果如下:1.鑒定了550份來自53個國家的水稻種質(zhì)苗期的耐冷性。結(jié)果表明大多數(shù)秈稻品種不耐冷,粳稻品種較耐冷。也發(fā)現(xiàn)了部分極耐冷的秈稻種質(zhì)和極不耐冷的粳稻種質(zhì)。水稻種質(zhì)的耐冷性為育種等研究提供重要參考依據(jù)。2.過濾后用于GWAS分析的SNPs共有20,000個。SNP間距平均為18.6 kb,遠遠小于水稻的LD衰退值。利用Kinship計算的親緣關(guān)系值表明,550份水稻種質(zhì)中絕大多數(shù)種質(zhì)的親緣關(guān)系較遠。群體結(jié)構(gòu)對GW... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

水稻苗期耐冷性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及主效QTL的精細(xì)定位與應(yīng)用


007-2016年中國農(nóng)作物總成災(zāi)面積變化

中低溫,水稻,轉(zhuǎn)錄組學(xué),代謝組學(xué)


中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文 第一章 引言化氫的清除能力,使幼穗免受脂質(zhì)過氧化傷害,從而提高低溫脅迫下小穗育性(Ns et al., 2003, Luet al., 2007, Sato et al., 2011, Garighan et al., 2014)。代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究表明,活性氧信號途徑應(yīng)答是決定粳稻較強低溫耐受性的關(guān)鍵,水稻在低溫逆境下主要應(yīng)答是抗氧化代謝響應(yīng)(Zhanget al., 2016)。

水稻種質(zhì)


科學(xué)院博士學(xué)位論文 第二章 水稻苗期耐冷性第二章 水稻苗期耐冷性狀的全基因組材料與方法驗材料用到的 550 份種質(zhì)資源來源于 3000 份水稻基因組項目(3KRGP2中挑選的 550 份種質(zhì)來自 53 個國家,包含了秈稻(Indica)、粳稻iatetype)、Aus/boro 和 Basmati/sadri 五個類型(圖 2.1)。550 份種別占 46%和 33%。6%1%

【參考文獻】:
期刊論文
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[4]利用重組自交系群體檢測水稻芽期耐冷性QTL[J]. 林靜,張亞東,朱鎮(zhèn),趙凌,陳濤,王才林.  江西農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2008(03)
[5]水稻RIL群體芽期耐冷性基因的分子標(biāo)記定位[J]. 陳瑋,李煒.  武漢植物學(xué)研究. 2005(02)
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[9]水稻秈粳交DH群體苗期的耐冷性QTLs分析[J]. 錢前,曾大力,何平,鄭先武,陳英,朱立煌.  科學(xué)通報. 1999(22)
[10]冷害類型及其防御技術(shù)[J]. 韓學(xué)儉.  植物醫(yī)生. 1999(03)

博士論文
[1]基于SSSL的水稻耐冷QTL的定位和聚合效應(yīng)[D]. 楊梯豐.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]水稻耐冷基因COR1的克隆與功能研究[D]. 黃李超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015



本文編號:3416295

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