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不育臨界溫度不同的培矮64S近等基因系育性相關(guān)小RNA差異分析

發(fā)布時間:2021-09-22 23:07
  光溫敏核不育水稻的花粉育性受穗發(fā)育期的光周期和溫度調(diào)控,歷經(jīng)大量研究但其光溫育性調(diào)控機理仍不明確。培矮64S是以農(nóng)墾58S作為不育基因源衍生的秈型光溫敏核不育系,是兩系法雜交稻組合中廣泛應用的母本,然而在實際生產(chǎn)應用中因其不育性易受到低溫影響而造成制種損失的情況時有發(fā)生。研究溫度對育性的調(diào)控機理,具有生殖發(fā)育調(diào)控理論意義和溫度穩(wěn)定型不育材料培育的指導作用。在光敏不育基因調(diào)控機理研究中,已發(fā)現(xiàn)mi RNA參與了光敏核不育水稻育性的轉(zhuǎn)換調(diào)控過程,本研究試圖探討在溫度調(diào)控育性的過程中是否也存在mi RNA的參與,并通過這些育性溫度調(diào)節(jié)相關(guān)的mi RNA分析其調(diào)節(jié)機制。研究選用對育性溫度反應不同的培矮64S近等基因系(PA2364S、PA2864S),在不同溫度條件下的幼穗進行降解組測序以及結(jié)合前期研究的轉(zhuǎn)錄組測序、small RNA測序進行聯(lián)合分析,篩選特異性mi RNA及其靶基因的表達差異進一步解析育性溫度穩(wěn)定性機理,為溫度穩(wěn)定性的不育系選育與鑒定提供基礎(chǔ)信息。獲得了如下主要結(jié)果:1.對前期已有不育系材料育性進行驗證,花粉碘染鏡檢顯示近等基因系PA2364S與PA2864S表現(xiàn)出明顯的育性... 

【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

不育臨界溫度不同的培矮64S近等基因系育性相關(guān)小RNA差異分析


溫度處理下PA2364S(左)與PA2864S(右)花粉育性Fig.3-1PollenfertilityofPA2364S(left)andPA2864S(right)undertemperaturetreatment

序列,自然溫度,大田,測序


不育臨界溫度不同的培矮64S近等基因系育性相關(guān)小RNA差異分析21圖3-22018-2019年間7月、8月大田自然溫度統(tǒng)計Fig.3-2StatisticsoffieldnaturaltemperatureinJulyandAugustfrom2018to2019注:圖3-2-A表示為2018年溫度統(tǒng)計;圖3-2-B表示為2019年溫度統(tǒng)計Note:Figure3-2istemperaturestatisticsin2018;figure3-2istemperaturestatisticsin2019.3.2不同溫度處理下miRNA降解組差異分析3.2.1降解組數(shù)據(jù)概括為了確定miRNA及其靶基因之間存在的靶切調(diào)控關(guān)系,本研究進行了降解組測序,測序材料為PA2364S,具體取樣時期為:溫度處理前幼穗分化時期的Ⅲ期幼穗、21℃低溫處理下的Ⅵ期、Ⅶ期幼穗,自然高溫處理條件下的Ⅵ期、Ⅶ期幼穗。為了保證測序數(shù)據(jù)的可靠性,所有材料均取三次重復,樣品數(shù)量總計15個;溫度處理前的Ⅲ期(Q),21℃低溫處理Ⅵ期與Ⅶ期(L6/L7)與高溫處理Ⅵ期與Ⅶ期(H6/H7),按照不同處理及時期進行樣品混合,共構(gòu)建了Q、L6、H6、L7、H7五個降解組文庫,構(gòu)建好的文庫用IlluminaHiseq2000/2500進行測序,測序讀長為單端1×50bp。在獲得的原始數(shù)據(jù)中,每個文庫的reads數(shù)目均在2400萬以上,其中除去3’接頭后剪切位點標簽較短(<15nt)的reads只占0.55%(表3-2),對測序數(shù)據(jù)獲得Unique序列以及每個Unique序列相應拷貝數(shù)目、以及除去3’接頭后剪切位點標簽較短(<15nt)的序列數(shù)目、unique數(shù)目。并且對測序的結(jié)果中能夠比對上mRNA的剪切位點標簽數(shù)目、unique標簽數(shù)目進行統(tǒng)計,該數(shù)據(jù)統(tǒng)計得到mRNA(即cDNA)與降解組測序得到的降解片段相互的覆蓋度都較高。

靶基因,農(nóng)業(yè)大學,學位論文,華中


華中農(nóng)業(yè)大學2020屆碩士研究生學位論文24圖3-3miRNA切割靶基因的T-plot圖Fig.3-3Targetplotsshowedsignatureabundanceinthepositionoftargettranscripsidentified注:圖3-3-A、B、C、D、E分別表示剪切類型0、1、2、3、4。Note:figure3-3-A,B,C,DandErepresentthecleavagestypes0,1,2,3and4,respectively.

【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
[1]光溫敏核不育水稻育性差異相關(guān)的小RNA分析[D]. 熊信果.華中農(nóng)業(yè)大學 2019



本文編號:3404540

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