大豆蔓生性和株高QTL定位
發(fā)布時間:2021-09-11 20:36
野生大豆是拓寬栽培大豆遺傳基礎(chǔ)、提供優(yōu)異基因的重要資源,但蔓生習(xí)性極大限制其在栽培大豆育種改良中的利用。不同遺傳背景栽培大豆與野生大豆雜交后代蔓生性狀分離各異,暗示著大豆蔓生性調(diào)控的復(fù)雜性。深入了解蔓生性的遺傳規(guī)律有助于全面解析蔓生性狀調(diào)控機(jī)理,為野生資源高效利用奠定基礎(chǔ)。本研究以栽培大豆中黃39(ZH39)為母本,野生大豆ZYD2738和ZYD3687為父本分別構(gòu)建分離群體,通過BSA法和遺傳連鎖圖譜兩種方法,發(fā)掘蔓生性與株高性狀相關(guān)QTL位點(diǎn)。主要研究結(jié)果如下:1.利用ZH39×ZYD2738 F2群體中的極端個體分別構(gòu)建直立和蔓生DNA池,用200 K SNP芯片檢測DNA池,在第2、5、8、12、13、15、17和19染色體上,檢測到8個可能與蔓生性狀相關(guān)的染色體區(qū)間,利用這8個區(qū)間的60個SSR標(biāo)記對F2群體進(jìn)行基因分型,在第2、17和19號染色體檢測到蔓生性QTL qVG-2、qVG-17和qVG-19。利用190個SSR標(biāo)記構(gòu)建F6群體遺傳連鎖圖譜,在2、17和19染色體檢測到3個蔓生性相關(guān)QTL,分別為q...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
親本表型鑒定和各群體表型頻數(shù)分布
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位152.2.2基于BSA法進(jìn)行QTL定位利用200KSNP芯片檢測ZH39×ZYD2738F2群體直立DNA池1和蔓生DNA池2,結(jié)果顯示在大豆2、5、8、12、13、15、17和19號染色體上檢測DNA池間SNP分布存在顯著差異的區(qū)間(圖2-2)。利用分布在2、5、8、12、13、15、17和19號染色體60對多態(tài)性SSR標(biāo)記檢測ZH39×ZYD2738F2群體,結(jié)合2016年三亞田間表型,進(jìn)行蔓生性和株高相關(guān)QTL定位,在2、17和19號染色體上共檢測到6個QTL,而5、8、12、13和15號染色體上未檢測到QTL。蔓生性定位結(jié)果顯示,qVG-19的表型貢獻(xiàn)率最大為19.30%,qVG-2和qVG-17貢獻(xiàn)率較低,分別為6.79%和2.77%;qVG-2、qVG-19加性效應(yīng)為負(fù)值,蔓生性增效基因來自父本ZYD2738,而qVG-17加性效應(yīng)為正,蔓生性增效基因來自母本ZH39。株高定位結(jié)果顯示,qPH-19的表型貢獻(xiàn)率最大為25.44%,qPH-2和qPH-17貢獻(xiàn)率較低,分別為5.09%和7.63%;qPH-2、qPH-19加性效應(yīng)為負(fù)值,蔓生性增效基因來自父本ZYD2738,而qPH-17加性效應(yīng)為正,蔓生性增效基因來自母本ZH39。6個QTL中,qVG-2、qVG-17、qVG-19分別與qPH-2、qPH-17、qPH-19定位區(qū)間完全一致,表明這三個位點(diǎn)能同時控制蔓生性和株高性狀(表2-2)。圖2-2利用BSA法鑒定蔓生連鎖位點(diǎn)Fig.2-2IdentificationoflocuslinkedwithvininggrowthhabitbyusingBSAmethod
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位17圖2-3864對SSR標(biāo)記在大豆染色體的分布Fig.2-3Distributionof864SSRmarkerson20soybeanchromosomes表2-2利用不同分離群體定位到QTLTable2-2SummaryofQTLsdetectedindifferentpopulations群體Population性狀(年份)Traits(Year)QTL標(biāo)記區(qū)間Markerinterval區(qū)間大小Intervalsize(Mb)LODPVE(%)ADDF2VG(2016)qVG-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.346.79-1.12qVG-17ssr_17_09-ssr_02_131.63.362.770.55qVG-19ssr_19_09-ssr_19_111.620.3719.30-1.89PH(2016)qPH-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.875.09-5.05qPH-17ssr_17_09-ssr_02_131.610.567.635.05qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.629.6425.44-11.27F6VG(2017)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.24.477.91-0.82qVG-17ssr_17_09-ssr_17_100.13.936.690.78qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.27.7915.10-1.18PH(2017)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.23.585.24-3.51qPH-17ssr_17_09-ssr_17_100.17.1610.905.14qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.610.0016.97-6.52F6VG(2018)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.25.6810.11-1.52qVG-17ssr_17_10-ssr_17_110.12.604.360.96qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.28.7715.28-1.94PH(2018)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.24.155.60-3.67qPH-17ssr_17_10-ssr_17_110.15.497.174.24qPH-19ssr_19_09-ssr_19_100.214.0721.81-7.56
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物關(guān)聯(lián)分析應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 岳慶春,傅迦得,章辰飛,吳月燕. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(18)
[2]全基因組關(guān)聯(lián)分析在作物育種研究中的應(yīng)用[J]. 曹英杰,楊劍飛,王宇. 核農(nóng)學(xué)報. 2019(08)
[3]野生大豆利用價值的研究進(jìn)展[J]. 王付娟,劉書含,李娟,周強(qiáng). 信陽農(nóng)林學(xué)院學(xué)報. 2019(02)
[4]野生大豆PI342618B蔓生性QTL定位研究[J]. 劉莉,邢光南,栗旭亮,許志永,孔杰杰,蓋鈞鎰,趙團(tuán)結(jié). 大豆科學(xué). 2015(06)
[5]基于基因組學(xué)的作物種質(zhì)資源研究:現(xiàn)狀與展望[J]. 黎裕,李英慧,楊慶文,張錦鵬,張金梅,邱麗娟,王天宇. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[6]大豆種質(zhì)資源遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 何真,韻曉東,武凱,姬虎太,常建忠,喬麟軼,鄭軍. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2015(02)
[7]全基因組關(guān)聯(lián)分析在植物中的應(yīng)用[J]. 涂雨辰,田云,盧向陽. 化學(xué)與生物工程. 2013(06)
[8]野生大豆在大豆育種中的應(yīng)用[J]. 馬曉萍,楊光宇,楊振宇,王洋,陳健. 作物研究. 2009(01)
[9]野生大豆、黑豆和大豆的異黃酮類成分比較[J]. 周三,關(guān)崎春雄,岳旺,澤聰子,楊志宏. 大豆科學(xué). 2008(02)
[10]中國野生大豆的遺傳多樣性和生態(tài)特異性分析[J]. 丁艷來,趙團(tuán)結(jié),蓋鈞鎰. 生物多樣性. 2008(02)
碩士論文
[1]小麥骨干親本周8425B白粉病成株抗性QTL定位[D]. 賈奧琳.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號:3393678
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
親本表型鑒定和各群體表型頻數(shù)分布
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位152.2.2基于BSA法進(jìn)行QTL定位利用200KSNP芯片檢測ZH39×ZYD2738F2群體直立DNA池1和蔓生DNA池2,結(jié)果顯示在大豆2、5、8、12、13、15、17和19號染色體上檢測DNA池間SNP分布存在顯著差異的區(qū)間(圖2-2)。利用分布在2、5、8、12、13、15、17和19號染色體60對多態(tài)性SSR標(biāo)記檢測ZH39×ZYD2738F2群體,結(jié)合2016年三亞田間表型,進(jìn)行蔓生性和株高相關(guān)QTL定位,在2、17和19號染色體上共檢測到6個QTL,而5、8、12、13和15號染色體上未檢測到QTL。蔓生性定位結(jié)果顯示,qVG-19的表型貢獻(xiàn)率最大為19.30%,qVG-2和qVG-17貢獻(xiàn)率較低,分別為6.79%和2.77%;qVG-2、qVG-19加性效應(yīng)為負(fù)值,蔓生性增效基因來自父本ZYD2738,而qVG-17加性效應(yīng)為正,蔓生性增效基因來自母本ZH39。株高定位結(jié)果顯示,qPH-19的表型貢獻(xiàn)率最大為25.44%,qPH-2和qPH-17貢獻(xiàn)率較低,分別為5.09%和7.63%;qPH-2、qPH-19加性效應(yīng)為負(fù)值,蔓生性增效基因來自父本ZYD2738,而qPH-17加性效應(yīng)為正,蔓生性增效基因來自母本ZH39。6個QTL中,qVG-2、qVG-17、qVG-19分別與qPH-2、qPH-17、qPH-19定位區(qū)間完全一致,表明這三個位點(diǎn)能同時控制蔓生性和株高性狀(表2-2)。圖2-2利用BSA法鑒定蔓生連鎖位點(diǎn)Fig.2-2IdentificationoflocuslinkedwithvininggrowthhabitbyusingBSAmethod
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章野生大豆ZYD2738蔓生性和株高QTL定位17圖2-3864對SSR標(biāo)記在大豆染色體的分布Fig.2-3Distributionof864SSRmarkerson20soybeanchromosomes表2-2利用不同分離群體定位到QTLTable2-2SummaryofQTLsdetectedindifferentpopulations群體Population性狀(年份)Traits(Year)QTL標(biāo)記區(qū)間Markerinterval區(qū)間大小Intervalsize(Mb)LODPVE(%)ADDF2VG(2016)qVG-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.346.79-1.12qVG-17ssr_17_09-ssr_02_131.63.362.770.55qVG-19ssr_19_09-ssr_19_111.620.3719.30-1.89PH(2016)qPH-2ssr_02_13-ssr_02_161.86.875.09-5.05qPH-17ssr_17_09-ssr_02_131.610.567.635.05qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.629.6425.44-11.27F6VG(2017)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.24.477.91-0.82qVG-17ssr_17_09-ssr_17_100.13.936.690.78qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.27.7915.10-1.18PH(2017)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.23.585.24-3.51qPH-17ssr_17_09-ssr_17_100.17.1610.905.14qPH-19ssr_19_09-ssr_19_111.610.0016.97-6.52F6VG(2018)qVG-2ssr_02_14-ssr_02_150.25.6810.11-1.52qVG-17ssr_17_10-ssr_17_110.12.604.360.96qVG-19ssr_19_09-ssr_19_100.28.7715.28-1.94PH(2018)qPH-2ssr_02_12-ssr_02_130.24.155.60-3.67qPH-17ssr_17_10-ssr_17_110.15.497.174.24qPH-19ssr_19_09-ssr_19_100.214.0721.81-7.56
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]基于基因組學(xué)的作物種質(zhì)資源研究:現(xiàn)狀與展望[J]. 黎裕,李英慧,楊慶文,張錦鵬,張金梅,邱麗娟,王天宇. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[6]大豆種質(zhì)資源遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 何真,韻曉東,武凱,姬虎太,常建忠,喬麟軼,鄭軍. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2015(02)
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[9]野生大豆、黑豆和大豆的異黃酮類成分比較[J]. 周三,關(guān)崎春雄,岳旺,澤聰子,楊志宏. 大豆科學(xué). 2008(02)
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碩士論文
[1]小麥骨干親本周8425B白粉病成株抗性QTL定位[D]. 賈奧琳.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號:3393678
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