硬脂酰-ACP脫氫酶是形成不飽和脂肪酸的關(guān)鍵酶。利用擬南芥蛋白序列作為比對序列在NCBI和Phytozome數(shù)據(jù)庫進行Blastp同源比對,共鑒定11個SbSADs基因。對SbSAD基因家族進行蛋白特性、進化關(guān)系、不同發(fā)育階段表達、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、染色體定位、基因二級和三級結(jié)構(gòu)、啟動子區(qū)的順式元件及種子發(fā)育階段表達分析,結(jié)果顯示,SbSADs基因編碼區(qū)為1 134～1 290bp,其編碼蛋白的氨基酸數(shù)為377～449,分子量最大為48.0kDa,最小為39.8kDa,等電點為5.26～8.76;根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹,將SbSAD基因家族分為3個亞族,其中亞族I在不同組織發(fā)育階段表達量較高;11個SbSADs基因不均等地定位在高粱1、2、3、4、6、7和10號染色體上;SbSADs蛋白二級結(jié)構(gòu)均以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,三級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,除SbSAD8外,其余SbSADs的蛋白三級結(jié)構(gòu)高度相似;11個SbSADs基因的啟動子區(qū)與低溫脅迫相關(guān)的元件數(shù)量高度富集。SbSAD5基因在種子發(fā)育5和10d均有較高的表達量。 

【文章來源】：作物雜志. 2020,(02)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

水稻、玉米、擬南芥和高粱SADs蛋白系統(tǒng)進化關(guān)系

另外，利用高粱不同發(fā)育階段Sb SADs的表達情況來進一步表征Sb SADs系統(tǒng)進化關(guān)系。圖2為Sb SAD6和Sb SAD9在高粱的不同發(fā)育階段的表達情況；其中Sb SAD9在開花期和幼嫩期的表達量較高，Sb SAD6在成熟期比在開花期表達量高。結(jié)合系統(tǒng)進化樹與不同組織部位發(fā)育階段Sb SADs的表達情況進行分析，結(jié)果表明，亞族I基因在不同發(fā)育階段均有表達（圖2）。2.3 Sb SADs基因結(jié)構(gòu)分析

利用GSDS(http：//gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php）在線軟件分析SbSAD基因家族內(nèi)含子和外顯子的數(shù)目，結(jié)果如圖3所示，在SbSAD基因家族中，Sb SAD8的外顯子數(shù)最多，含有6個外顯子；Sb SAD2、Sb SAD4和Sb SAD11均僅含有1個外顯子；其他基因含有2～3個外顯子。同時發(fā)現(xiàn)，Sb SAD6和Sb SAD9的基因結(jié)構(gòu)高度相似，表明Sb SAD基因家族在每個亞族相對保守。2.4 SbSADs蛋白保守基序分析

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3393414