為了開發(fā)新的小麥分子標(biāo)記,利用前期小麥品種貴紫麥1號的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,對所得序列進(jìn)行EST-SSR（Expressed sequence tags-simple sequence repeat）標(biāo)記開發(fā),并對開發(fā)的標(biāo)記進(jìn)行了染色體定位、多態(tài)性篩選。結(jié)果表明,在119 572條總Unigenes序列中得到8 749條含SSR位點(diǎn)的EST序列,占7.3%,平均每8.04 kb就會出現(xiàn)1個SSR;EST序列中SSR類型的分布特點(diǎn)為三核苷酸重復(fù)類型最多,而五、六核苷酸重復(fù)類型出現(xiàn)頻次很少,單核苷酸重復(fù)以A/T出現(xiàn)頻次最多,二核苷酸重復(fù)以AG/CT出現(xiàn)頻次最多,三核苷酸重復(fù)以CCG/CGG出現(xiàn)頻次最多;對含SSR位點(diǎn)的EST序列進(jìn)行引物設(shè)計(jì),成功設(shè)計(jì)出引物的序列有5 503條,占總EST序列的62.9%,從中篩選到341對有效性EST-SSR引物;以中國春為對照,利用16份中國春缺體-四體系材料對341對EST-SSR引物進(jìn)行染色體定位,共定位153對引物、201個位點(diǎn),涉及除3A、5A、3B、4B及1D外的16條染色體,其中5B染色體定位引物對最多,達(dá)23對;篩選出53對多態(tài)性EST-SSR引... 

【文章來源】：河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,49(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：16 頁

【部分圖文】：

部分EST-SSR引物有效性檢測的電泳結(jié)果

表5 EST-SSR位點(diǎn)分布情況Tab.5 The distribution of EST-SSR sites個 同源群Homologous group 染色體組 Chromosome set 總計(jì) Total A B D 1 21 18 — 39 2 12 12 7 31 3 — — 11 11 4 11 — 9 20 5 — 23 9 32 6 4 11 15 30 7 15 8 15 38 總計(jì) Total 63 72 66 2012.3 52份小麥材料的EST-SSR遺傳多樣性分析

選用53對在貴紫麥1號和ZY96-3間具有多態(tài)性的EST-SSR引物,對52份小麥材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測(圖3),能夠在52份小麥材料中擴(kuò)增出穩(wěn)定清晰且具多態(tài)性條帶的EST-SSR引物18對(多態(tài)率為34%)。由表6可知,18對EST-SSR引物在52份小麥材料中檢測到100個等位基因位點(diǎn),變幅為3～10個,平均等位基因數(shù)5.6個;PIC值為0.303～0.791,平均為0.568。引物GZES652的等位基因位點(diǎn)最多,達(dá)10個,其PIC值也較高,為0.663;引物GZES529的PIC值最高,達(dá)0.791,等位基因位點(diǎn)也較多;引物GZES040的PIC值最低,為0.303,僅3個等位基因位點(diǎn)。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3389391