Argonaute蛋白是RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體（RISC）的核心蛋白,它聯(lián)合不同小RNA參與植物體內(nèi)各種RNA沉默通路,在植物生長發(fā)育、抗逆境脅迫和抗病毒防御等生命過程發(fā)揮重要作用。本研究利用生物信息學(xué)方法在馬鈴薯中鑒定并克隆了14個(gè)StAGOs基因,并通過表達(dá)分析初步探究其基因功能。主要結(jié)果如下:1.通過生物信息學(xué)方法找到了14個(gè)潛在的馬鈴薯AGO基因,分別編碼475（StAGO4-3）到1127個(gè)氨基酸（StAGO1-2）。這些StAGOs基因分布在馬鈴薯第1、2、3、6、7、9、12號(hào)染色體上,對其編碼蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)StAGO4-3缺少PAZ結(jié)構(gòu)域,可能為假基因,其余13個(gè)StAGOs基因包含AGO蛋白典型的保守結(jié)構(gòu)域,鑒定確實(shí)為AGO基因家族的成員。2.根據(jù)NCBI和PGSC數(shù)據(jù)庫中StAGOs基因轉(zhuǎn)錄本序列信息,設(shè)計(jì)特異性引物,從馬鈴薯中克隆得到了14個(gè)StAGOs基因的全長cDNA序列,測序結(jié)果表明克隆的序列與數(shù)據(jù)庫中的序列相似度從83.15%（StAGO2-2）到99.59%（StAGO1-2）,編碼蛋白的相似度從66.22%（StAGO2-2）到99.73%（S... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

pHELLSGATE8載體結(jié)構(gòu)

圖 3.1 StAGOs 基因外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析。黃色條：外顯子，黑線：內(nèi)含子Fig.3.1 Exon/intron organizations of StAGOs. Yellow bars: exons; black lines: introns.表 3-2 StAGOs 的蛋白相關(guān)信息

圖3.2 StAGOs基因在染色體上的分布。箭頭代表基因的轉(zhuǎn)錄方向Fig.3.2 Genomic distributions of StAGOs on potato chromosomes. The arrows next to genenames show the direction of transcription為研究確定的StAGOs 基因是否為能發(fā)揮其家族正常功能的功能基因而非假

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：3377758