以色列及周邊地區(qū)野生大麥群體遺傳多態(tài)性分析
發(fā)布時間:2021-08-29 17:39
本研究以源自大麥起源及多樣性中心--以色列南部、中部和北部的9個不同自然群體144個生態(tài)型的野生二棱大麥為材料,采用SSR標(biāo)記在DNA分子水平對該材料進(jìn)行遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析研究。主要研究結(jié)果如下:1.從大麥全基因組染色體的120對SSR標(biāo)記中篩選出42對多態(tài)性高、重復(fù)性好的SSR引物,這些引物均勻分布在7條染色體上,平均每條染色體上有6對,且位于染色體不同Bin位置上。2.利用篩選的42對SSR引物對以色列9個野生二棱大麥自然群體進(jìn)行多態(tài)性研究,共檢測到189個等位變異,平均每個標(biāo)記有4.5個,變幅為37個。標(biāo)記多態(tài)性信息含量(PIC)平均值為0.6968,變幅為0.52990.8233。其中,Bmag0812的PIC值最大,其次是HVM74;PIC值最小的是Bmag0105。本實(shí)驗(yàn)的PIC值均大于0.5,表明所選SSR標(biāo)記多態(tài)性都比較明顯。另外我們發(fā)現(xiàn)位于染色體5H上的SSR標(biāo)記等位基因位點(diǎn)多,多態(tài)性信息含量也較大。3.通過聚類分析144個野生二棱大麥生態(tài)型可知,遺傳相似性指數(shù)介于0.55030.9365間,...
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
以色列9個野生大麥群體地理分布
數(shù)量Quantity基因型GenotypeSBH9 SBH10 SBH11 SBH09-1 SBHSBH09-5 SBH09-6 SBH09-7 SBH09-8 11 Nah20 Nah21 Nah22 Nah23 Nah24 NNah29 Nah3018 SBW1 SBW2 SBW3 SBW5 SBW6 SBW09-2 SBW09-3 SBW09-5 SBWSBW09-10 SBW09-13 SBW09-14 SBW10 GN1 GN2 GN3 GN4 GN5 GN6 GN7 GN群體北不同地區(qū)的 9 個野生大麥群體共 101 個基因(Baek, 2003),各位點(diǎn)地理名稱及生態(tài)地理數(shù)據(jù)
置為 100000,做遺傳結(jié)構(gòu)圖。第三章 結(jié)果分析3.1 SSR 引物的篩選3.1.1 瓊脂糖電泳初篩本 實(shí) 驗(yàn) 所 用 引 物 序 列 信 息 均 從 GrainGenes 數(shù) 據(jù) 庫 獲 得 (http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml ),由上海生工生物技術(shù)服務(wù)公司合成。從以色列野生二棱大麥 28 個群體中隨機(jī)抽取一個基因型作為篩選引物的樣本,用瓊脂糖凝膠電泳對合成的 150 對 SSR 引物多態(tài)性進(jìn)行初篩 (圖 3-1) ,根據(jù)條帶清晰度可以優(yōu)化 PCR 程序,選擇各引物合適的退火溫度。最終篩選出具有多態(tài)性且均勻分布在大麥基因組的 7 條染色體的引物 42 對,其在染色體上的位置如圖 3-2,從圖中可得,擴(kuò)增片段大小在 100~300bp之間。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥籽粒蛋白含量相關(guān)基因NAM新等位變異的挖掘[J]. 朱娉,馮波,徐智斌,樊小莉,王濤. 麥類作物學(xué)報. 2016(07)
[2]微衛(wèi)星DNA進(jìn)化特征研究進(jìn)展[J]. 柳瑩,唐永政,高麗. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(06)
[3]西藏青稞種質(zhì)資源醇溶蛋白遺傳多樣性分析[J]. 曾興權(quán). 西藏科技. 2014(06)
[4]大麥遺傳多樣性及連鎖不平衡分析[J]. 賴勇,孟亞雄,王晉,范貴強(qiáng),司二靜,王鵬喜,李葆春,馬小樂,楊軻,尚勛武,王化俊. 作物學(xué)報. 2013(12)
[5]大麥DUS測試標(biāo)準(zhǔn)品種的遺傳多樣性分析及指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 王艷平,沈奇,張繼紅,李華勇,吳燕. 麥類作物學(xué)報. 2013(02)
[6]大麥SSR標(biāo)記遺傳多樣性及其與農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 賴勇,王鵬喜,范貴強(qiáng),司二靜,王晉,楊軻,孟亞雄,李葆春,馬小樂,尚勛武,王化俊. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(02)
[7]野生大麥種質(zhì)在大麥育種中的利用研究[J]. 牛小霞,呂建敏,郭天云. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(20)
[8]CAPS標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 邢延豪,周延清,楚素霞,郭靜佩,周鵬,范念斯. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]起源地生態(tài)地理因素對野生二棱大麥生長的影響[J]. 嚴(yán)俊,王瑩,Y.Gutterman,E.Nevo,程劍平. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(06)
[10]植物遺傳多樣性及其影響因素[J]. 文亞峰,韓文軍,吳順. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2010(12)
博士論文
[1]以色列野生二粒小麥遺傳多樣性及模式種短柄草幼苗和根系研究[D]. 董攀.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]大麥黃花葉病抗性鑒定及關(guān)聯(lián)SSR標(biāo)記的篩選[D]. 劉志敏.揚(yáng)州大學(xué) 2011
[2]甘啤系列啤酒大麥品種(系)與國外引進(jìn)品種遺傳多樣性的SSR分析[D]. 楊振華.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]一個野生大麥群體與栽培大麥品種間遺傳多樣性的比較[D]. 佘奎軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
[4]貴州省部分小麥種質(zhì)資源SSR遺傳多樣性研究及指紋圖譜構(gòu)建[D]. 張敏.貴州大學(xué) 2007
本文編號:3371090
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
以色列9個野生大麥群體地理分布
數(shù)量Quantity基因型GenotypeSBH9 SBH10 SBH11 SBH09-1 SBHSBH09-5 SBH09-6 SBH09-7 SBH09-8 11 Nah20 Nah21 Nah22 Nah23 Nah24 NNah29 Nah3018 SBW1 SBW2 SBW3 SBW5 SBW6 SBW09-2 SBW09-3 SBW09-5 SBWSBW09-10 SBW09-13 SBW09-14 SBW10 GN1 GN2 GN3 GN4 GN5 GN6 GN7 GN群體北不同地區(qū)的 9 個野生大麥群體共 101 個基因(Baek, 2003),各位點(diǎn)地理名稱及生態(tài)地理數(shù)據(jù)
置為 100000,做遺傳結(jié)構(gòu)圖。第三章 結(jié)果分析3.1 SSR 引物的篩選3.1.1 瓊脂糖電泳初篩本 實(shí) 驗(yàn) 所 用 引 物 序 列 信 息 均 從 GrainGenes 數(shù) 據(jù) 庫 獲 得 (http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml ),由上海生工生物技術(shù)服務(wù)公司合成。從以色列野生二棱大麥 28 個群體中隨機(jī)抽取一個基因型作為篩選引物的樣本,用瓊脂糖凝膠電泳對合成的 150 對 SSR 引物多態(tài)性進(jìn)行初篩 (圖 3-1) ,根據(jù)條帶清晰度可以優(yōu)化 PCR 程序,選擇各引物合適的退火溫度。最終篩選出具有多態(tài)性且均勻分布在大麥基因組的 7 條染色體的引物 42 對,其在染色體上的位置如圖 3-2,從圖中可得,擴(kuò)增片段大小在 100~300bp之間。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥籽粒蛋白含量相關(guān)基因NAM新等位變異的挖掘[J]. 朱娉,馮波,徐智斌,樊小莉,王濤. 麥類作物學(xué)報. 2016(07)
[2]微衛(wèi)星DNA進(jìn)化特征研究進(jìn)展[J]. 柳瑩,唐永政,高麗. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(06)
[3]西藏青稞種質(zhì)資源醇溶蛋白遺傳多樣性分析[J]. 曾興權(quán). 西藏科技. 2014(06)
[4]大麥遺傳多樣性及連鎖不平衡分析[J]. 賴勇,孟亞雄,王晉,范貴強(qiáng),司二靜,王鵬喜,李葆春,馬小樂,楊軻,尚勛武,王化俊. 作物學(xué)報. 2013(12)
[5]大麥DUS測試標(biāo)準(zhǔn)品種的遺傳多樣性分析及指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 王艷平,沈奇,張繼紅,李華勇,吳燕. 麥類作物學(xué)報. 2013(02)
[6]大麥SSR標(biāo)記遺傳多樣性及其與農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 賴勇,王鵬喜,范貴強(qiáng),司二靜,王晉,楊軻,孟亞雄,李葆春,馬小樂,尚勛武,王化俊. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(02)
[7]野生大麥種質(zhì)在大麥育種中的利用研究[J]. 牛小霞,呂建敏,郭天云. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(20)
[8]CAPS標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 邢延豪,周延清,楚素霞,郭靜佩,周鵬,范念斯. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(05)
[9]起源地生態(tài)地理因素對野生二棱大麥生長的影響[J]. 嚴(yán)俊,王瑩,Y.Gutterman,E.Nevo,程劍平. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(06)
[10]植物遺傳多樣性及其影響因素[J]. 文亞峰,韓文軍,吳順. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2010(12)
博士論文
[1]以色列野生二粒小麥遺傳多樣性及模式種短柄草幼苗和根系研究[D]. 董攀.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]大麥黃花葉病抗性鑒定及關(guān)聯(lián)SSR標(biāo)記的篩選[D]. 劉志敏.揚(yáng)州大學(xué) 2011
[2]甘啤系列啤酒大麥品種(系)與國外引進(jìn)品種遺傳多樣性的SSR分析[D]. 楊振華.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]一個野生大麥群體與栽培大麥品種間遺傳多樣性的比較[D]. 佘奎軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
[4]貴州省部分小麥種質(zhì)資源SSR遺傳多樣性研究及指紋圖譜構(gòu)建[D]. 張敏.貴州大學(xué) 2007
本文編號:3371090
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