基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的茅蒼術(shù)扁莖變異機制研究
發(fā)布時間:2021-08-21 22:30
茅蒼術(shù)Atractylodes lancea(Thunb.)DC.為菊科多年生植物,其根莖為我國傳統(tǒng)常用中藥材,藥材名蒼術(shù)。目前茅蒼術(shù)的歷史道地產(chǎn)區(qū)江蘇茅山一帶已無商品藥材供應(yīng),市場上的茅蒼術(shù)藥材大部分為湖北等省份的人工栽培品。位于湖北省黃岡市的英山、羅田等縣的人工規(guī)模化種植茅蒼術(shù),經(jīng)過長期多代無性繁殖已導(dǎo)致部分植株發(fā)生退化和變異,形成了多種變異類型,其中包括茅蒼術(shù)扁莖變異這一類型。本文從病原菌、化學(xué)成分差異以及轉(zhuǎn)錄組等多角度研究正常茅蒼術(shù)和扁莖變異茅蒼術(shù)的品質(zhì)差異,旨在闡明茅蒼術(shù)扁莖變異的發(fā)生機制,提升栽培藥材品質(zhì)。主要研究內(nèi)容如下:1.采用分子生物學(xué)及組織化學(xué)等方法鑒定導(dǎo)致茅蒼術(shù)扁莖變異病的病原菌。通過形態(tài)特征分析發(fā)現(xiàn),扁莖變異茅蒼術(shù)植株與植原體引起的病害癥狀相符。進一步利用植原體16S rDNA基因的通用引物,通過巢式PCR檢測出扁莖變異茅蒼術(shù)中存在植原體,再經(jīng)基因序列分析和系統(tǒng)進化分析,顯示湖北英山茅蒼術(shù)中檢測到的植原體屬于翠菊黃化植原體16SrI-B亞組。DAPI組織化學(xué)染色發(fā)現(xiàn),扁莖變異茅蒼術(shù)與正常茅蒼術(shù)相比,扁莖變異植株莖橫切片中存在大量點狀熒光,進一步驗證了扁莖茅蒼術(shù)中...
【文章來源】:湖北中醫(yī)藥大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:91 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略詞表
前言
第一章 茅蒼術(shù)扁莖變異病的病原菌鑒定
1 實驗材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
2 實驗方法
2.1 扁莖茅蒼術(shù)的病原菌鑒定
2.2 扁莖茅蒼術(shù)的組織化學(xué)鑒定
2.3 扁莖茅蒼術(shù)的發(fā)病率調(diào)查
3 實驗結(jié)果與分析
3.1 感病植株的性狀鑒定
3.2 扁莖茅蒼術(shù)的病原菌鑒定
3.3 感病植株的組織化學(xué)鑒定
3.4 扁莖變異茅蒼術(shù)的發(fā)病率調(diào)查
4 討論
第二章 扁莖變異對茅蒼術(shù)產(chǎn)量和品質(zhì)的影響
1 材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 儀器及設(shè)備
1.3 實驗試劑
2 實驗方法
2.1 顯微鑒別
2.2 正常茅蒼術(shù)和扁莖茅蒼術(shù)形態(tài)學(xué)對比
2.3 薄層TLC鑒別
2.4 水分測定
2.5 HPLC測定蒼術(shù)素含量
2.6 GC測定β-桉葉醇含量
2.7 揮發(fā)油含量的測定
2.8 GC-MS分析揮發(fā)油主成分
3 實驗結(jié)果
3.1 顯微鑒別
3.2 正常茅蒼術(shù)和扁莖茅蒼術(shù)形態(tài)學(xué)對比
3.3 薄層TLC鑒別
3.4 水分測定結(jié)果
3.5 HPLC測定蒼術(shù)素含量結(jié)果
3.6 GC測定β-桉葉醇結(jié)果
3.7 揮發(fā)油含量測定結(jié)果
3.8 GC-MS分析揮發(fā)油主成分結(jié)果
4 討論
第三章 基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的茅蒼術(shù)扁莖變異機制研究
1 實驗材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
2 實驗方法
2.1 RNA提取
2.2 轉(zhuǎn)錄組高通量測序
2.3 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4 轉(zhuǎn)錄本拼接
2.5 基因功能注釋
2.6 轉(zhuǎn)錄本表達豐度估計
2.7 差異表達分析
2.8 關(guān)鍵基因的實時熒光定量PCR驗證
3 實驗結(jié)果
3.1 RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
3.2 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)從頭組裝
3.3 全長轉(zhuǎn)錄本評估
3.4 unigene功能注釋
3.5 基因表達水平分析
3.6 基因差異表達分析
3.7 不同樣本的差異基因的GO和 KEGG Pathway富集分析
3.8 與植原體相關(guān)的差異基因KEGG Pathway表達分析
3.9 實時熒光定量PCR結(jié)果
4 討論
結(jié)語與創(chuàng)新
參考文獻
文獻綜述
參考文獻
附表
附錄
致謝
本文編號:3356455
【文章來源】:湖北中醫(yī)藥大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:91 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略詞表
前言
第一章 茅蒼術(shù)扁莖變異病的病原菌鑒定
1 實驗材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
2 實驗方法
2.1 扁莖茅蒼術(shù)的病原菌鑒定
2.2 扁莖茅蒼術(shù)的組織化學(xué)鑒定
2.3 扁莖茅蒼術(shù)的發(fā)病率調(diào)查
3 實驗結(jié)果與分析
3.1 感病植株的性狀鑒定
3.2 扁莖茅蒼術(shù)的病原菌鑒定
3.3 感病植株的組織化學(xué)鑒定
3.4 扁莖變異茅蒼術(shù)的發(fā)病率調(diào)查
4 討論
第二章 扁莖變異對茅蒼術(shù)產(chǎn)量和品質(zhì)的影響
1 材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 儀器及設(shè)備
1.3 實驗試劑
2 實驗方法
2.1 顯微鑒別
2.2 正常茅蒼術(shù)和扁莖茅蒼術(shù)形態(tài)學(xué)對比
2.3 薄層TLC鑒別
2.4 水分測定
2.5 HPLC測定蒼術(shù)素含量
2.6 GC測定β-桉葉醇含量
2.7 揮發(fā)油含量的測定
2.8 GC-MS分析揮發(fā)油主成分
3 實驗結(jié)果
3.1 顯微鑒別
3.2 正常茅蒼術(shù)和扁莖茅蒼術(shù)形態(tài)學(xué)對比
3.3 薄層TLC鑒別
3.4 水分測定結(jié)果
3.5 HPLC測定蒼術(shù)素含量結(jié)果
3.6 GC測定β-桉葉醇結(jié)果
3.7 揮發(fā)油含量測定結(jié)果
3.8 GC-MS分析揮發(fā)油主成分結(jié)果
4 討論
第三章 基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的茅蒼術(shù)扁莖變異機制研究
1 實驗材料和儀器
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
2 實驗方法
2.1 RNA提取
2.2 轉(zhuǎn)錄組高通量測序
2.3 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4 轉(zhuǎn)錄本拼接
2.5 基因功能注釋
2.6 轉(zhuǎn)錄本表達豐度估計
2.7 差異表達分析
2.8 關(guān)鍵基因的實時熒光定量PCR驗證
3 實驗結(jié)果
3.1 RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
3.2 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)從頭組裝
3.3 全長轉(zhuǎn)錄本評估
3.4 unigene功能注釋
3.5 基因表達水平分析
3.6 基因差異表達分析
3.7 不同樣本的差異基因的GO和 KEGG Pathway富集分析
3.8 與植原體相關(guān)的差異基因KEGG Pathway表達分析
3.9 實時熒光定量PCR結(jié)果
4 討論
結(jié)語與創(chuàng)新
參考文獻
文獻綜述
參考文獻
附表
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致謝
本文編號:3356455
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