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結合關聯(lián)與連鎖分析剖析玉米籽粒生育酚含量的遺傳基礎及一個主效QTL的精細定位

發(fā)布時間:2021-08-17 09:53
  生育酚在維持植物生長發(fā)育和人體健康中發(fā)揮著重要作用,而生育酚在藍藻和擬南芥等模式植物中的合成途徑也已經(jīng)有較為詳盡的研究,然而玉米(Zea mays L.)籽粒中生育酚含量的遺傳基礎至今仍不甚清楚。本研究將全基因組關聯(lián)分析(GWAS)與連鎖分析相結合,以剖析玉米籽粒生育酚的遺傳基礎。本研究以玉米籽粒中γ-生育酚、α-生育酚、δ-生育酚、總生育酚含量及α/γ-生育酚之比做為目標性狀進行研究,主要結果如下:本研究采用6個遺傳及生育酚表型變異豐富的重組自交系(RIL)群體用于連鎖分析;趯嶒炇仪捌诮⒌母呙芏冗z傳連鎖圖進行QTL定位,共檢測到89個QTL,其中有44個QTL在多個RIL群體中同時檢測到,另有45個QTL僅在單個RIL群體中檢測到。將影響不同性狀的置信區(qū)間重疊的QTL合并,得到41個非重復QTL,其中有10個主效QTL——每個主效QTL可解釋10%以上的表型變異,有11個非重復QTL可影響多個生育酚性狀。經(jīng)與之前研究比較,本研究檢測到的10個非重復QTL為首次檢測到,暗示不同遺傳背景可能含有不同有利等位基因。通過上位性分析,本研究發(fā)現(xiàn)兩個基因的互作對生育酚表型的貢獻僅起次要作用... 

【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:139 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

結合關聯(lián)與連鎖分析剖析玉米籽粒生育酚含量的遺傳基礎及一個主效QTL的精細定位


生育酚與生育三烯酚的分子結構與活性(引自DellaPennaandMène-Saffrané2011)

植基,焦磷酸,苯醌,木酮糖


圖 2 高等植物中生育酚的合成途徑DMPBQ,2,3-二甲基-5-植基-1,4-苯醌;D;GGPP,牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸;HG-6-植基-1,4-苯醌;PDP,植基二磷酸;P氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構酶;DXS,1兒基焦磷酸合酶;GGR,牻牛兒基牻牛兒iosynthetic pathway of tocopherols in higcompounds in this pathway are l-benzoquinol; DXP, 1-deoxy-D-xylulosGGPP, geranylgeranyl pyrophosphate; HGABQ, 2-methyl-6-phytyl-benzoquinol; PDP, piations for enzymes in the pathway reductoisomerase; DXS, deoxyoxylulose-5-phate synthase; GGR, geranylgeranygenase.

群體結構,關聯(lián)分析,示例,亞群


關聯(lián)分析中的群體結構示例 (引自 Rafalski亞群,抗病表型(圖中紅圈表示)頻率在兩亞在兩亞群中分布頻率差異較大的位點均可能被f population structure in association mappingn be divided into two subpopulations. Since ther

【參考文獻】:
期刊論文
[1]數(shù)量性狀基因的完備區(qū)間作圖方法[J]. 王建康.  作物學報. 2009(02)
[2]數(shù)量性狀基因定位的混合線性模型分析方法[J]. 朱軍.  遺傳. 1998(S1)

博士論文
[1]玉米籽粒氨基酸全基因組關聯(lián)分析與連鎖分析及玉米和水稻代謝組的比較分析[D]. 鄧敏.華中農業(yè)大學 2017
[2]一種交替運用固定效應和隨機效應模型優(yōu)化全基因組關聯(lián)分析的算法開發(fā)[D]. 劉小磊.華中農業(yè)大學 2016



本文編號:3347551

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