利用水稻MAGIC群體和種質(zhì)資源關(guān)聯(lián)分析定位抽穗期和株高QTL
發(fā)布時(shí)間:2021-08-06 13:30
抽穗期和株高是水稻重要的農(nóng)藝性狀,抽穗期的長(zhǎng)短決定水稻在不同生態(tài)區(qū)域的地區(qū)適應(yīng)性和季節(jié)適應(yīng)性。在不降低抗倒伏能力的情況下,適當(dāng)增加株高可以有效增加生物量,從而進(jìn)一步提高水稻產(chǎn)量。本研究利用多親本高代互交系(multi-parents advanced generation inter-cross,MAGIC)群體(2個(gè)4親本群體DC1、DC2和1個(gè)8親本群體8way)及其復(fù)合群體DC12(DC1+DC2)和RMPRIL(DC1+DC2+8way)作為遺傳定位群體,結(jié)合55K高通量SNP基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析定位影響水稻抽穗期和株高的QTL。同時(shí)從源于全球89個(gè)國(guó)家和地區(qū)遺傳變異豐富的3000份水稻種質(zhì)資源中選取2412份種質(zhì)材料(包括1386份秈稻和674份粳稻),結(jié)合40萬(wàn)SNP標(biāo)記進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,并對(duì)MAGIC群體的定位結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.2015年和2016年分別在江西萍鄉(xiāng)和廣東深圳采集3個(gè)MAGIC群體的抽穗期和株高數(shù)據(jù),結(jié)合Rice 55K SNP芯片進(jìn)行基因分型,利用關(guān)聯(lián)分析方法檢測(cè)到3個(gè)影響抽穗期的主效QTL(qHD3、qHD6和qHD8),分別位于第3、6...
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
親本MAGIC群體設(shè)計(jì)路線
16 圖 2.1 MAGIC 群體在不同環(huán)境下抽穗期和株高分布圖Fig2.1 Frequency distribution of heading date (HD) and plant height (PH) in MAGIC populationsacross different environments
22 圖 2.2 5 個(gè) MAGIC 群體在不同環(huán)境下關(guān)聯(lián)分析定位到影響抽穗期 QTL 的 Manhattan 圖Fig.2.2 Manhattan plot of association mapping of heading date (HD) in the five populations across different environmentsA1-A4、B1-B4、C1-C4、D1-D4 和 E1-E4 分別表示 DC1、DC2、DC12、8way 和 RMPRIL 群體在 15JX、16JX、15SZ 和 16SZ 4 個(gè)環(huán)境下的定位結(jié)果;水平實(shí)線表示全基因組顯著性閥值 P <10-5。DC1 (A1-A4), DC2 (B1-B4), 8way (C1-C4), DC12 (D1-D4) and RMPRIL (E1-E4) represent five populations in 15JX,16JX, 15SZ and 16SZ. Horizontal solid line indicates the genome-wide significance threshold P <.10-5.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用高世代回交群體定位水稻抽穗期和株高QTL[J]. 馮玉濤,蔣海潮,高冠軍,張慶路,何予卿. 分子植物育種. 2014(01)
[2]LHD1,an Allele of DTH8/Ghd8,Controls Late Heading Date in Common Wild Rice (Oryza rufipogon)[J]. Xiaodong Dai,Younian Ding,Lubin Tan,Yongcai Fu,Fengxia Liu,Zuofeng Zhu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Ping Gu,Hongwei Cai and Chuanqing Sun State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,National Evaluation Centre for Agricultural Wild Plants (Rice),Laboratory of Crop Heterosis and Utilization of the Ministry of Education,Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement,Department of Plant Genetics and Breeding,China Agricultural University,Beijing 100193,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[3]水稻抽穗期遺傳與分子調(diào)控機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 胡時(shí)開,蘇巖,葉衛(wèi)軍,郭龍彪. 中國(guó)水稻科學(xué). 2012(03)
[4]水稻株高QTL定位及精確性分析[J]. 張志勇,黃育民,張凱,王侯聰,江良榮. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(01)
[5]關(guān)聯(lián)分析在作物種質(zhì)資源分子評(píng)價(jià)中的應(yīng)用[J]. 王榮煥,王天宇,黎裕. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2007(03)
[6]利用2個(gè)相關(guān)群體定位和比較水稻株高與抽穗期QTL[J]. 劉文俊,王令強(qiáng),何予卿. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(02)
[7]不同環(huán)境條件下水稻株高的QTL定位分析[J]. 葉少平,李杰勤,張啟軍,趙兵,李平. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(01)
[8]作物分子設(shè)計(jì)育種[J]. 萬(wàn)建民. 作物學(xué)報(bào). 2006(03)
[9]水稻品種生育期的遺傳和基因定位[J]. 鄧曉建,周開達(dá),李仁端,王文明,朱立煌. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(02)
[10]水稻長(zhǎng)穗頸高稈隱性基因eui2的遺傳及其微衛(wèi)星分析[J]. 楊蜀嵐,楊仁崔,曲雪萍,章清杞,黃榮華,王斌. 植物學(xué)報(bào). 2001(01)
碩士論文
[1]秈稻矮稈多蘗突變體的遺傳分析與基因定位研究[D]. 徐斌.廈門大學(xué) 2007
本文編號(hào):3325864
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
親本MAGIC群體設(shè)計(jì)路線
16 圖 2.1 MAGIC 群體在不同環(huán)境下抽穗期和株高分布圖Fig2.1 Frequency distribution of heading date (HD) and plant height (PH) in MAGIC populationsacross different environments
22 圖 2.2 5 個(gè) MAGIC 群體在不同環(huán)境下關(guān)聯(lián)分析定位到影響抽穗期 QTL 的 Manhattan 圖Fig.2.2 Manhattan plot of association mapping of heading date (HD) in the five populations across different environmentsA1-A4、B1-B4、C1-C4、D1-D4 和 E1-E4 分別表示 DC1、DC2、DC12、8way 和 RMPRIL 群體在 15JX、16JX、15SZ 和 16SZ 4 個(gè)環(huán)境下的定位結(jié)果;水平實(shí)線表示全基因組顯著性閥值 P <10-5。DC1 (A1-A4), DC2 (B1-B4), 8way (C1-C4), DC12 (D1-D4) and RMPRIL (E1-E4) represent five populations in 15JX,16JX, 15SZ and 16SZ. Horizontal solid line indicates the genome-wide significance threshold P <.10-5.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用高世代回交群體定位水稻抽穗期和株高QTL[J]. 馮玉濤,蔣海潮,高冠軍,張慶路,何予卿. 分子植物育種. 2014(01)
[2]LHD1,an Allele of DTH8/Ghd8,Controls Late Heading Date in Common Wild Rice (Oryza rufipogon)[J]. Xiaodong Dai,Younian Ding,Lubin Tan,Yongcai Fu,Fengxia Liu,Zuofeng Zhu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Ping Gu,Hongwei Cai and Chuanqing Sun State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,National Evaluation Centre for Agricultural Wild Plants (Rice),Laboratory of Crop Heterosis and Utilization of the Ministry of Education,Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement,Department of Plant Genetics and Breeding,China Agricultural University,Beijing 100193,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[3]水稻抽穗期遺傳與分子調(diào)控機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 胡時(shí)開,蘇巖,葉衛(wèi)軍,郭龍彪. 中國(guó)水稻科學(xué). 2012(03)
[4]水稻株高QTL定位及精確性分析[J]. 張志勇,黃育民,張凱,王侯聰,江良榮. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(01)
[5]關(guān)聯(lián)分析在作物種質(zhì)資源分子評(píng)價(jià)中的應(yīng)用[J]. 王榮煥,王天宇,黎裕. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2007(03)
[6]利用2個(gè)相關(guān)群體定位和比較水稻株高與抽穗期QTL[J]. 劉文俊,王令強(qiáng),何予卿. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(02)
[7]不同環(huán)境條件下水稻株高的QTL定位分析[J]. 葉少平,李杰勤,張啟軍,趙兵,李平. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(01)
[8]作物分子設(shè)計(jì)育種[J]. 萬(wàn)建民. 作物學(xué)報(bào). 2006(03)
[9]水稻品種生育期的遺傳和基因定位[J]. 鄧曉建,周開達(dá),李仁端,王文明,朱立煌. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(02)
[10]水稻長(zhǎng)穗頸高稈隱性基因eui2的遺傳及其微衛(wèi)星分析[J]. 楊蜀嵐,楊仁崔,曲雪萍,章清杞,黃榮華,王斌. 植物學(xué)報(bào). 2001(01)
碩士論文
[1]秈稻矮稈多蘗突變體的遺傳分析與基因定位研究[D]. 徐斌.廈門大學(xué) 2007
本文編號(hào):3325864
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