為了探明迪卡517、鄭單1002噴施外源ABA后脫水速率變化的分子機(jī)制,發(fā)掘影響脫水速率的關(guān)鍵差異表達(dá)基因及代謝通路,利用Illumina HiSeq^TM2500測(cè)序儀分別對(duì)噴施ABA前后迪卡517（脫水速率較快）和鄭單1002（脫水速率較慢）的穗位葉進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。原始序列經(jīng)過質(zhì)量控制、基因組比對(duì)、測(cè)序飽和度、基因覆蓋度及冗余序列分析后進(jìn)行基因功能注釋。結(jié)果顯示,迪卡517外源ABA處理與正常生長(zhǎng)條件對(duì)比組檢測(cè)到1 732個(gè)差異表達(dá)基因,其中1 251個(gè)為上調(diào)表達(dá)基因,481個(gè)為下調(diào)表達(dá)基因;鄭單1002外源ABA處理與正常生長(zhǎng)條件對(duì)比組檢測(cè)到52個(gè)差異表達(dá)基因,其中24個(gè)為上調(diào)表達(dá)基因;迪卡517外源ABA處理與鄭單1002外源ABA處理對(duì)比組檢測(cè)到3 867個(gè)差異表達(dá)基因,其中1 946個(gè)為上調(diào)表達(dá)基因。不同對(duì)比組中篩選到差異表達(dá)基因GO分類情況、COG基因產(chǎn)物分類、KEGG代謝通路分析不同。轉(zhuǎn)錄因子分析共獲得多個(gè)重要的轉(zhuǎn)錄因子家族,主要有AGC蛋白激酶家族、AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族、ARID轉(zhuǎn)錄因子、AUX/IAA轉(zhuǎn)錄因子家族、Alfin-like... 

【文章來源】：華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(04)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

外源ABA處理不同對(duì)比組玉米材料差異表達(dá)基因火山圖

圖6 對(duì)比分析了外源ABA對(duì)不同玉米品種脫水速率相關(guān)基因的影響。DK517-ABA80 VS DK517-CK(G1對(duì)比組)、ZD1002-ABA80 VS ZD1002-CK(G3對(duì)比組)共檢測(cè)到了10個(gè)共同差異表達(dá)基因,分別為:Zm00001d035000,在G1對(duì)比組中上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中下調(diào)表達(dá),在玉米中表達(dá)未標(biāo)記蛋白LOC100279096;Zm00001d042063,在G1、G3對(duì)比組中均呈上調(diào)表達(dá),玉米植株中表達(dá)假設(shè)蛋白 ZEAMMB73;Zm00001d045314,在G1對(duì)比組中上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中下調(diào)表達(dá),在玉米中表達(dá)S-腺苷甲硫氨酸依賴性甲基轉(zhuǎn)移酶;Zm00001d003938,在G1對(duì)比組上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組下調(diào)表達(dá),在玉米中表達(dá)甾醇皂苷;Zm00001d028647,在G1對(duì)比組中呈上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中呈下調(diào)表達(dá),在玉米中表達(dá)未標(biāo)記蛋白LOC100280456;Zm00001d029778,在G1對(duì)比組中呈上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中呈下調(diào)表達(dá),在玉米植株中表達(dá)EC蛋白同系物;Zm00001d032186,在G1、G3對(duì)比組中均呈上調(diào)表達(dá),在玉米植株中表達(dá)未標(biāo)記蛋白LOC100192110前體;Zm00001d033447,在G1對(duì)比組中呈上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中呈下調(diào)表達(dá),功能未知;Zm00001d037988,在G1對(duì)比組中呈上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中呈下調(diào)表達(dá),在玉米植株中表達(dá)EMB564蛋白;Zm00001d046065,在G1對(duì)比組中呈上調(diào)表達(dá)而在G3對(duì)比組中呈下調(diào)表達(dá),在玉米植株中表達(dá)組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶B催化亞體。G1對(duì)比組中存在1 722個(gè)特異的差異表達(dá)基因;G3對(duì)比組中存在42個(gè)特異的差異表達(dá)基因。圖3 外源ABA處理后ZD1002-ABA80 VS ZD1002-CK對(duì)比組差異表達(dá)基因KEGG分類圖

圖2 外源ABA處理后DK517-ABA80 VS DK517-CK對(duì)比組差異表達(dá)基因KEGG分類圖圖4 外源ABA處理后DK517-ABA80 VS ZD1002-ABA80對(duì)比組差異表達(dá)基因KEGG分類圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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