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RR-BLUP方法預(yù)測(cè)玉米自交系M54測(cè)交后代產(chǎn)量

發(fā)布時(shí)間:2021-07-26 20:21
  基因組選擇是一種適用于動(dòng)植物數(shù)量性狀改良的分子標(biāo)記輔助選擇策略,與傳統(tǒng)的分子標(biāo)記輔助選擇策略(連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析)相比,基因組選擇不需要事先確定一個(gè)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)效應(yīng)顯著的分子標(biāo)記子集,而是直接使用分布于全基因組的分子標(biāo)記預(yù)測(cè)育種值或基因型值;蚪M選擇在動(dòng)物和林木育種中已經(jīng)得到實(shí)際應(yīng)用。隨著以SNP為代表的高通量分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,測(cè)定育種材料全基因組分子標(biāo)記的成本不斷降低,如果能運(yùn)用雜交親本的基因組標(biāo)記來預(yù)測(cè)雜交組合產(chǎn)量表現(xiàn),將會(huì)減少參加田間試驗(yàn)的雜交組合的數(shù)量,提高育種效率,節(jié)約育種成本。本研究提出了一種在固定測(cè)驗(yàn)種條件下運(yùn)用RR-BLUP模型預(yù)測(cè)雜交組合產(chǎn)量表現(xiàn)的應(yīng)用模式。以優(yōu)良玉米自交系M54為測(cè)驗(yàn)種,與一個(gè)雙親后代的分離衍生的高代近交系群體組配雜交組合,使用R語(yǔ)言Synbreed軟件包中的RR-BLUP模型估計(jì)了測(cè)交群體內(nèi)SNP標(biāo)記效應(yīng),并進(jìn)行了5重交叉驗(yàn)證,相關(guān)系數(shù)的平均值在0.67左右,達(dá)到中等相關(guān)水平。 

【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(24)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【部分圖文】:

RR-BLUP方法預(yù)測(cè)玉米自交系M54測(cè)交后代產(chǎn)量


產(chǎn)量數(shù)據(jù)BLUP的頻率分布

分布情況,頻率分布,基因組,玉米


2 302個(gè)SNP標(biāo)記在玉米基因組的分布情況

染色體,情況,組配,自交


以‘昌7-2’與‘LM-1’為雙親組配F1,F1連續(xù)自交產(chǎn)生236個(gè)高代近交系,與優(yōu)良自交系M54組配成測(cè)交種。2012年、2013年在河南省長(zhǎng)葛市、遼寧省鐵嶺市、北京市海淀區(qū)上莊鎮(zhèn)進(jìn)行兩年三點(diǎn)的產(chǎn)量試驗(yàn)。每個(gè)地點(diǎn)設(shè)置3次重復(fù),單行種植,行距0.6 m,行長(zhǎng)4.5 m,密度4 000株/畝。成熟時(shí)按行收獲,考察穗數(shù),穂重,粒重,籽粒含水量。籽粒重量換算成13%的含水量下的重量,再?gòu)膯沃戤a(chǎn)量換算成畝產(chǎn),其中2013年長(zhǎng)葛市試驗(yàn)點(diǎn)受干旱影響嚴(yán)重,沒有測(cè)產(chǎn)數(shù)據(jù),其余數(shù)據(jù)匯總成2年5點(diǎn)數(shù)據(jù)。3.2 表型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于育種值預(yù)測(cè)的基因組選擇方法的比較(英文)[J]. 王欣,楊澤峰,徐辰武.  Science Bulletin. 2015(10)
[2]數(shù)量性狀基因定位研究中若干常見問題的分析與解答[J]. 李慧慧,張魯燕,王建康.  作物學(xué)報(bào). 2010(06)



本文編號(hào):3304301

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