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絞股藍譜系地理學及絞股藍屬系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時間:2021-07-14 09:06
  絞股藍屬(Gynostemma Bl.)隸屬于葫蘆科(Cucurbitaceae),屬下共包括2亞屬(絞股藍亞屬和喙果藤亞屬)2組(喙果藤組和五柱絞股藍組)17種2變種,中國分布有2亞屬2組14種2變種。絞股藍屬植物的自然地理分布從中國的秦嶺南坡、長江流域及其以南廣大地區(qū)一直延伸到熱帶亞洲。然而,絞股藍屬物種的系統(tǒng)發(fā)育關系和譜系地理歷史長期以來一直存在爭議。本研究首先對絞股藍屬植物進行大規(guī)模的野外資源調(diào)查和群體遺傳學采樣,共收集到該屬14個物種覆蓋整個自然地理分布區(qū)域的71個居群材料,進一步利用三對具有豐富變異位點的葉綠體基因間隔區(qū)(cpDNA non-coding regions)trn L-trnF,rpl20-rps12,psbB-psbF和核糖體內(nèi)轉錄間隔區(qū)基因(ITS)以及低拷貝核基因RPB2對絞股藍屬所有的居群樣品進行測序分析,以期揭示絞股藍屬植物的譜系進化歷史和該屬物種間的系統(tǒng)發(fā)育關系。具體研究結果如下:基于cpDNA序列構建絞股藍系統(tǒng)發(fā)育樹,并通過化石校正估算絞股藍地理譜系分化時間,然后進行祖先分布區(qū)重建,得到絞股藍的譜系地理模式如下:(1)絞股藍種內(nèi)出現(xiàn)了明顯的譜系分... 

【文章來源】:西北大學陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:140 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

絞股藍譜系地理學及絞股藍屬系統(tǒng)發(fā)育研究


[113]比較分析了細胞色素C在豬、馬、金槍魚和酵母中的差異之后發(fā)現(xiàn),親緣關系越近的物種之間的遺傳距離越小,親緣關系越遠的物種之間的遺傳距離越大

路線圖,避難所,路線


第一章前言5識別冰期避難所的方法有兩種(圖1.2):一是收集研究目標類群的古生物學、生態(tài)學或者遺傳學數(shù)據(jù)來推測避難所可能的地理位置和存在時間;二是研究對避難所維持可能起到作用的氣候環(huán)境和地理自然過程。圖1.2鑒定冰期避難所的兩種研究路線Fig.1.2Schematicoutlineoftwoapproachestotheidentificationofrefugia使用譜系地理學方法通過分析現(xiàn)今物種群體樣本的遺傳地理分布模式以及推測群體動態(tài)歷史來鑒定冰期避難所[76],結合化石記錄和物種分布?梢愿玫赝茰y冰期避難所的存在[60]。1.1.3譜系地理學研究方法1.1.3.1巢式枝系分析法(Nestedcladeanalysis)巢式枝系分析法的基本思路是將親緣關系近的單倍型彼此相連,并且進一步形成更高階的支系。進行譜系地理研究時,通過研究單倍型巢式分支連接結構與地理分布信息之間的相關關系,再通過統(tǒng)計檢驗方法推測群體在不同時間經(jīng)歷的進化事件,比如近期的群體擴張、地理隔離效應、遷移路線、冰期避難所等[183]。1.1.3.2分子鐘法估算分化時間以及化石校正物種譜系發(fā)生時間的測定對于理解物種在不同時間的進化速率和模式以及全球氣候變化對物種進化起到何種作用很重要。分子鐘方法可以將遺傳數(shù)據(jù)和地質事件以及化石記錄進行整合分析,幫助確定化石匱乏的生物類群確定其譜系分化發(fā)生時間。最初的

模型圖,生態(tài)位,生態(tài)空間,物種


第一章前言71.1.3.3生態(tài)位模型分布區(qū)模擬生態(tài)位模型(ENM,Ecologicalnichemodeling)根據(jù)物種現(xiàn)今地理分布數(shù)據(jù)和地理點對應的環(huán)境變量參數(shù)進行運算構建模型,模擬物種的生態(tài)需求,再將計算結果投射到(Project)不同的時間和空間中來預測物種于此未知的實際分布地和潛在分布地[3]。生態(tài)位模型分布區(qū)模擬的基本原理是將物種的地理空間和生態(tài)空間結合起來,地理信息系統(tǒng)技術的快速發(fā)展以及全球物種分布庫的共享使得簡單易行的間接方法的生態(tài)位模型得以實現(xiàn)[115]。圖1.3生態(tài)模型將地理空間和生態(tài)空間兩者結合起來Fig.1.3Ecologicalnichemodeling生態(tài)位模型構建的前提如下:(1)分布地需要包括所有物種的發(fā)現(xiàn)地;(2)需要注意顯示中的物種遷移能力和地理阻隔會影響模型的預測;(3)物種的生態(tài)位在一段歷史時期內(nèi)是相對穩(wěn)定的,這樣運算出來的模型投射到另一地理空間或者時間范圍才具有合理性。1.1.4譜系地理學研究進展譜系地理學自從1980s提出以來得到了廣泛關注,研究范圍覆蓋了全球的生物多樣性熱點區(qū)域。隨著研究的深入和積累,可以探索到這些區(qū)域普遍存在的譜系地理模式,進而推測促進形成這些親緣地理模式的地質氣候歷史事件,為世界不同植物動物區(qū)系提供物種形成模式[74]以及群體遺傳學的進化透視[8]提供參考。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]絞股藍屬植物親緣關系初步分析[J]. 秦雙雙,李海濤,汪周勇,崔占虎,余麗瑩.  中國中藥雜志. 2015(09)
[2]廣西葫蘆科一新記錄種——翅莖絞股藍[J]. 彭玉德,謝月英,黃寶優(yōu),余麗瑩,黃雪彥.  中國現(xiàn)代中藥. 2013(12)
[3]長江東流水系建立的時限及其構造地貌意義[J]. 鄭洪波,王平,何夢穎,羅超,黃湘通,賈軍濤.  第四紀研究. 2013 (04)
[4]同源多倍體化效應研究進展[J]. 王家利,王芳,郭小麗,師承瑞,張愛民.  中國農(nóng)學通報. 2013(12)
[5]絞股藍屬植物系統(tǒng)進化研究進展述評[J]. 李忠虎,劉占林,趙鵬,蘇海倫,趙桂仿.  西北植物學報. 2012(10)
[6]ISSR-PCR鑒別絞股藍屬7種植物[J]. 王翀,周天華,楊雪,郭晶,趙桂仿.  中草藥. 2008(04)
[7]瓊州海峽成因與時代[J]. 趙煥庭,王麗榮,袁家義.  海洋地質與第四紀地質. 2007(02)
[8]分光光度法測定絞股藍中總皂苷的含量[J]. 盧金清,肖波,陳黎,喻樊,田耀平,詹曉蓮,徐玉婷,萬威.  湖北中醫(yī)雜志. 2007(01)
[9]粗莖秦艽與西藏秦艽(龍膽科)種間的形態(tài)學、染色體與分子界定[J]. 張小蘭,葛學軍,劉建全,袁永明.  植物分類學報. 2006(06)
[10]關于中國的亞熱帶[J]. 楊勤業(yè),鄭度,吳紹洪.  亞熱帶資源與環(huán)境學報. 2006(03)

博士論文
[1]絞股藍和心籽絞股藍的轉錄組分析及絞股藍屬系統(tǒng)發(fā)育初步研究[D]. 趙月梅.西北大學 2017

碩士論文
[1]青藏高原青甘韭的多次多倍化及譜系地理學研究[D]. 吳麗麗.蘭州大學 2010
[2]絞股藍多倍體的起源與進化研究[D]. 蔣玲艷.西北大學 2009



本文編號:3283839

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