兩個(gè)水稻品系的穗部性狀遺傳分析及DNA多態(tài)性的分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-09 09:30
以?xún)蓚(gè)遺傳基礎(chǔ)相近的水稻品系R4233和測(cè)679為材料,通過(guò)對(duì)其雜交F2代的穗長(zhǎng)、一次枝梗數(shù)、二次枝梗數(shù)和每穗總粒數(shù)等性狀的相關(guān)性分析和通徑分析,探討與兩個(gè)品系每穗總粒數(shù)相關(guān)性狀對(duì)每穗總粒數(shù)的影響能力。利用SSR標(biāo)記檢測(cè)R4233與測(cè)679的遺傳相似系數(shù),并利用全基因組重測(cè)序技術(shù)對(duì)R4233和測(cè)679進(jìn)行重測(cè)序,用來(lái)發(fā)掘大量的變異位點(diǎn)。根據(jù)這些變異位點(diǎn)進(jìn)行分子標(biāo)記的設(shè)計(jì),為構(gòu)建遺傳圖譜和比較基因組分析提供幫助。主要結(jié)果如下:1.在與兩品系每穗總粒數(shù)相關(guān)的性狀中,穗長(zhǎng)、一次枝梗數(shù)和二次枝梗數(shù)與每穗總粒數(shù)呈極顯著正相關(guān)。通過(guò)對(duì)穗長(zhǎng)、一次枝梗數(shù)、二次枝梗數(shù)和每穗總粒數(shù)的通徑分析,發(fā)現(xiàn)二次枝梗數(shù)對(duì)每穗總粒數(shù)的直接通徑系數(shù)最大,表明二次枝梗數(shù)對(duì)每穗總粒數(shù)的影響力最大。2.R4233和測(cè)679的遺傳相似系數(shù)為85.81%,與根據(jù)該品系系譜得到的遺傳相似系數(shù)89.9%相比較是在可接受范圍,表明R4233和測(cè)679的系譜是符合預(yù)期的。3.本次重測(cè)序深度為50X,共獲得68GB的數(shù)據(jù)。使用BWA軟件將重測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到日本晴上,共鑒定出了 R4233和測(cè)679中12條染色體上的SNP位點(diǎn)分別有422086...
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1穗長(zhǎng)頻度分布
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于重測(cè)序的大豆新品種齊黃34的全基因組變異挖掘[J]. 張彥威,李偉,張禮鳳,王彩潔,戴海英,徐冉. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]秈粳稻基因組295個(gè)InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)[J]. 初志戰(zhàn),郭海濱,曾棟昌,劉耀光. 作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]分子標(biāo)記在作物育種中應(yīng)用價(jià)值研究[J]. 郝曉華,郝曉玲. 農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備. 2015(08)
[4]利用二代測(cè)序技術(shù)高通量分析水稻品種間抗病性差異的分子基礎(chǔ)[J]. 劉永振,李構(gòu)思,王曉宇,韓靖鸞,蘇菁,朱小源,陳樂(lè)天. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(09)
[5]利用秈粳交RIL群體對(duì)水稻穗部性狀的QTL分析[J]. 劉丹,劉進(jìn),王嘉宇,毛艇,陳溫福. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[6]水稻產(chǎn)量性狀相關(guān)基因的克隆及其機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 盧忠誠(chéng),戴超浩,張玉川,許永漢,於金生. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(10)
[7]利用染色體單片段代換系定位水稻穗粒數(shù)QTL[J]. 朱金燕,楊梅,王中德,王軍,周勇,楊杰,范方軍,李文奇,梁國(guó)華,仲維功. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(04)
[8]水稻產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位[J]. 趙建國(guó),蔣開(kāi)鋒,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,曹應(yīng)江,游書(shū)梅,羅婧,張濤,鄭家奎. 中國(guó)水稻科學(xué). 2013(04)
[9]水稻穗粒數(shù)相關(guān)基因的初步定位[J]. 潘英華,余建平,張強(qiáng),熊海燕,朱汝財(cái),李自超. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]SRAP分子標(biāo)記分析廣西糯玉米地方品種的遺傳多樣性[J]. 王兵偉,覃永嬡,覃嘉明,黃安霞,秦洪波,時(shí)成俏. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]水稻每穗穎花數(shù)的遺傳基礎(chǔ)剖析及其主效QTLs精細(xì)定位[D]. 劉頭明.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]基于InDels分子標(biāo)記的扁豆遺傳多樣性分析[D]. 王林曉.河南工業(yè)大學(xué) 2016
[2]水稻品種CO39及其N(xiāo)ILs基因組重測(cè)序序列的組裝與SNPs分析[D]. 陶歡.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[3]基于SSR分子標(biāo)記棉花品種DNA指紋圖譜構(gòu)建的研究[D]. 馮艷芳.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3273492
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1穗長(zhǎng)頻度分布
?Frist?panicle?branch??Panicle?length??圖3-1穗長(zhǎng)頻度分布?圖3-2?—次枝梗數(shù)頻度分布??Figure?3-1?the?frequency?distribution?of?panicle?Figure3 ̄2?the?frequency?distribution?of?first??length?panicle?branch??120?j??100?I?_?^??250?I?桃抑?^?=??A3.S0?80??2〇〇?|?r??衡679?坩雪60?r??21.89?‘?Z??址l?!????5?〇a?|?〇?(j?|?[?||i??_?麗圓?I?疆?I?ggg?寫(xiě)?§S88S8888888§??〇?r-Xi-X?J
?Frist?panicle?branch??Panicle?length??圖3-1穗長(zhǎng)頻度分布?圖3-2?—次枝梗數(shù)頻度分布??Figure?3-1?the?frequency?distribution?of?panicle?Figure3 ̄2?the?frequency?distribution?of?first??length?panicle?branch??120?j??100?I?_?^??250?I?桃抑?^?=??A3.S0?80??2〇〇?|?r??衡679?坩雪60?r??21.89?‘?Z??址l?!????5?〇a?|?〇?(j?|?[?||i??_?麗圓?I?疆?I?ggg?寫(xiě)?§S88S8888888§??〇?r-Xi-X?J
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于重測(cè)序的大豆新品種齊黃34的全基因組變異挖掘[J]. 張彥威,李偉,張禮鳳,王彩潔,戴海英,徐冉. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]秈粳稻基因組295個(gè)InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)[J]. 初志戰(zhàn),郭海濱,曾棟昌,劉耀光. 作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]分子標(biāo)記在作物育種中應(yīng)用價(jià)值研究[J]. 郝曉華,郝曉玲. 農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備. 2015(08)
[4]利用二代測(cè)序技術(shù)高通量分析水稻品種間抗病性差異的分子基礎(chǔ)[J]. 劉永振,李構(gòu)思,王曉宇,韓靖鸞,蘇菁,朱小源,陳樂(lè)天. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(09)
[5]利用秈粳交RIL群體對(duì)水稻穗部性狀的QTL分析[J]. 劉丹,劉進(jìn),王嘉宇,毛艇,陳溫福. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[6]水稻產(chǎn)量性狀相關(guān)基因的克隆及其機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 盧忠誠(chéng),戴超浩,張玉川,許永漢,於金生. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(10)
[7]利用染色體單片段代換系定位水稻穗粒數(shù)QTL[J]. 朱金燕,楊梅,王中德,王軍,周勇,楊杰,范方軍,李文奇,梁國(guó)華,仲維功. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(04)
[8]水稻產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位[J]. 趙建國(guó),蔣開(kāi)鋒,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,曹應(yīng)江,游書(shū)梅,羅婧,張濤,鄭家奎. 中國(guó)水稻科學(xué). 2013(04)
[9]水稻穗粒數(shù)相關(guān)基因的初步定位[J]. 潘英華,余建平,張強(qiáng),熊海燕,朱汝財(cái),李自超. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]SRAP分子標(biāo)記分析廣西糯玉米地方品種的遺傳多樣性[J]. 王兵偉,覃永嬡,覃嘉明,黃安霞,秦洪波,時(shí)成俏. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]水稻每穗穎花數(shù)的遺傳基礎(chǔ)剖析及其主效QTLs精細(xì)定位[D]. 劉頭明.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]基于InDels分子標(biāo)記的扁豆遺傳多樣性分析[D]. 王林曉.河南工業(yè)大學(xué) 2016
[2]水稻品種CO39及其N(xiāo)ILs基因組重測(cè)序序列的組裝與SNPs分析[D]. 陶歡.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[3]基于SSR分子標(biāo)記棉花品種DNA指紋圖譜構(gòu)建的研究[D]. 馮艷芳.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3273492
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