提高產(chǎn)量是玉米育種工作中的首要目標(biāo),而育種的關(guān)鍵在于種質(zhì)資源,我國玉米種質(zhì)基礎(chǔ)狹窄,限制了玉米突破性品種的選育。研究種質(zhì)的遺傳結(jié)構(gòu),挖掘優(yōu)異的遺傳變異對(duì)玉米產(chǎn)量的提高具有重要意義。本試驗(yàn)以陜A群、陜B群選育的122份自交系和4份國內(nèi)外常用的自交系（PH6WC、4CV、昌7-2、鄭58）為材料,對(duì)126份自交系進(jìn)行了tGBS測序和田間試驗(yàn),通過tGBS測序測得的基因型數(shù)據(jù)以及楊凌和榆林兩點(diǎn)測得的產(chǎn)量數(shù)據(jù)進(jìn)行了遺傳結(jié)構(gòu)及產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)分析旨在指導(dǎo)雜交選育工作及挖掘與產(chǎn)量相關(guān)的優(yōu)異變異。主要結(jié)論有:1.通過tGBS測序,總共獲得了299,598,955個(gè)原始reads,對(duì)這些reads進(jìn)行比對(duì)和過濾,按照缺失率≤50%和最小等位基因頻率（MAF）≥0.01等條件篩選到了46,046個(gè)SNP,平均標(biāo)記密度為46.7kb,主要分布于內(nèi)含子區(qū)（25%）和基因下游區(qū)域（23%）。其中31,983個(gè)SNP的MAF≥0.05,為高質(zhì)量SNP,平均標(biāo)記密度為65.9kb,內(nèi)含子和基因下游區(qū)域的SNP分布接近50%。2.陜B群自交系比陜A群自交系有更高的平均MAF和多態(tài)性信息含量（PIC）,以及更多的特有SNP... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

26個(gè)自交系的SNP注釋

西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文的平均 MAF 值和 PIC 值均低于陜 B 群的。由于陜 B 群自交系有 94 個(gè)，陜 A 群自系僅有 32 個(gè)，為了避免材料數(shù)目的差異對(duì)試驗(yàn)結(jié)果造成影響，本試驗(yàn)按照陜 A 群自系的材料數(shù)，對(duì)陜 B 群自交系進(jìn)行了 10 次隨機(jī)抽樣，計(jì)算得到陜 B 群自交系的 MA為 0.161，PIC 為 0.191，仍大于陜 A 群自交系的 MAF 和 PIC 值。

和陜 B 群自交系中的 SNP 位點(diǎn)在染色體上的分布。紅色代表色代表陜 B 群特有的 SNP，藍(lán)色代表陜 A 群和陜 B 群共有的 ion of polymorphic loci across the genome in the ShaanAand Shaaf unique SNPs in the ShaanAand Shaan B groups is labelled in redy, and blue represents the SNPs common to the Shaan Aand Shaan 和群體結(jié)構(gòu)分析26 份自交系的親緣關(guān)系，對(duì)這些自交系進(jìn)行兩兩間親緣數(shù)的變化范圍為 0 到 1.03。大約 61.82%的自交系間的親系的親緣關(guān)系系數(shù)在 0.05 到 0.5 之間，1.35%的自交系間，僅有 0.15%的自交系的親緣關(guān)系系數(shù)超過 0.7（圖4 和 116 之間的親緣關(guān)系最近，緊接著是自交系 74 和 9親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，與已知的系譜一致。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3269835