福建主要茶樹品種(系)DNA指紋圖譜研究與構建
發(fā)布時間:2021-07-07 10:34
福建具有豐富的茶樹資源,作為福建重要經濟作物之一,擁有悠久的茶樹栽培歷史。同時由于茶樹品種間的雜交及長期引種栽培,積累了大量的茶樹種質資源。為了鑒別福建茶樹種質資源,探索出適合用于茶樹遺傳多樣性分析的方法,本研究對共55份供試材料的遺傳多樣性進行分析。試驗采用了 ISSR、SCOT、iPBS三種標記對55份福建主要茶樹品種(品系)茶樹資源的遺傳多樣性進行分析,并分別構建了 55份供試材料的指紋圖譜。具體結果如下:(1)篩選出的11條ISSR引物對55份供試材料共檢測出156個位點,其中多態(tài)性條帶152條,平均每條引物擴增出14.2條,平均PPB為97.45%。獲得的55份材料間的遺傳相似系數(shù)在0.56~0.92之間,平均為0.72,構建了 55份茶樹品種(系)的ISSR標記指紋圖譜。55份供試材料共兩個群體的觀測等位基因數(shù)Na為1.87,有效等位基因數(shù)Ne為1.54,Nei基因多樣性為0.31,香農指數(shù)Shannon為0.46,遺傳分化Gst為0.05,基因流Nm為9.99。在遺傳相似系數(shù)為0.68處,將55份茶樹資源分成3大類。(2)本實驗首次利用SCOT標記對福建茶樹資源進行分析,...
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1?iPBS標記擴增原理(引自Kalendar等,2010)??Figl-1.?IPBS?marker?amplification?principle?(from?Kalendar,etal.2010)??5.2?iPBS分子標記應用??
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]43份油菜菌核病抗性資源的SCoT、SSR與SRAP標記分析[J]. 張羽,張曉娟,陳進,孫曉敏,張成兵. 西北農林科技大學學報(自然科學版). 2017(01)
[2]SCoT標記分析陜西茶樹資源的遺傳多樣性[J]. 陳熙,張羽,李佼,席彥軍,張顏青. 茶葉科學. 2016(02)
[3]41份葡萄種質遺傳多樣性的ISSR和SCoT對比分析[J]. 王發(fā)明,李潔維,葉開玉,龔弘娟,莫權輝,蔣橋生,劉平平. 廣西植物. 2017(01)
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[8]鳳凰單叢茶樹資源遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 吳清韓,莊東紅,朱慧,趙慶芳,楊培奎,馬瑞君. 熱帶作物學報. 2015(03)
[9]98份甘蔗種質資源遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 昝逢剛,應雄美,吳才文,趙培方,陳學寬,馬麗,蘇火生,劉家勇. 中國農業(yè)科學. 2015(05)
[10]SCoT分子標記在植物研究中的應用進展[J]. 龍治堅,范理璋,徐剛,胡尚連,韓國輝. 植物遺傳資源學報. 2015(02)
博士論文
[1]‘東魁’楊梅(Myrica rubra cv.Dongkui)兩個變異材料的發(fā)掘及鑒定[D]. 陳方永.華中農業(yè)大學 2014
[2]鐵觀音茶樹種性分化的分子鑒定及差異表達基因分離研究[D]. 陳志丹.福建農林大學 2013
[3]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT標記的柑橘連鎖圖譜構建及雜種和多倍體遺傳分析[D]. 韓國輝.西南大學 2012
[4]利用ISSR和EST-SSR標記研究中國茶樹資源的遺傳多樣性和遺傳結構[D]. 姚明哲.浙江大學 2009
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碩士論文
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[2]扇脈杓蘭遺傳多樣性的SCoT分析及扇脈組的親緣地理學研究[D]. 張俊麗.華東師范大學 2016
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[4]基于DArT技術的大黃魚耐低溫性狀相關分子標記的篩選[D]. 閆松松.寧波大學 2014
[5]5種山茶屬野生油茶ISSR親緣關系研究及指紋圖譜的構建[D]. 李國帥.中南林業(yè)科技大學 2014
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[7]割手密分子遺傳連鎖圖譜的構建[D]. 楊海霞.廣西大學 2013
[8]川渝選育茶樹品種的RAPD和ISSR分析[D]. 遲琳.四川農業(yè)大學 2013
[9]特異茶樹種質資源RAPD標記向SCAR標記轉化的研究[D]. 吳永勝.四川農業(yè)大學 2012
[10]30份四川茶樹主要種質資源遺傳多樣性和親緣關系的SRAP分析[D]. 席春奕.四川農業(yè)大學 2012
本文編號:3269474
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1?iPBS標記擴增原理(引自Kalendar等,2010)??Figl-1.?IPBS?marker?amplification?principle?(from?Kalendar,etal.2010)??5.2?iPBS分子標記應用??
福建主要茶樹品種(系)DNA指紋圖譜研究與構建??6.2本研究的技術路線??55個茶樹DNA提取???y???x???i???ISSR-PCR?SCOT-PCR?iPBS-PCR??反應體系優(yōu)化?反應體系優(yōu)化?反應體系優(yōu)化???Y???i???Y???ISSR引物篩選?SCOT引物篩選?iPBS引物篩選???y???5???j???ISSR-PCR?擴增?SCOT-PCR?擴增?iPBS-PCR?擴增???I???j???I???ISSR-PCR?電泳?SCOT-PCR?電泳?iPBS-PCR?電泳??+??I??T??T?士??I???聚類?DNA指紋?聚類?DNA指紋?聚類?DNA指紋??分析?圖譜構建?分析?圖譜構建?分析?圖譜構建??|??T????—???遺傳多樣性、親緣?遺傳多樣性、親緣?it傳多樣性、親緣??關系分析?關系分析?關系分析???Y???綜合各標記分析情況,對比出最適??合用于福建茶樹品種(系)親緣關??系分析、DNA指紋圖譜構建的標??記??圖1-2本研究技術路線圖??Fig?1-2?The?outline?and?techniques?of?this?study??12??
215.3?1.94?鬼洞白雞冠?1411.5?2.00??福云?6?號?228.3?1.95??2.2篩選出的ISSR引物及多態(tài)性分析??優(yōu)化后的PCR擴增程序及優(yōu)化后擴增體系:總體積20?ul,其中全式金2?x??EasyTaq?PCR?SuperMix?10?nL,50?ng/成?DNA?I?nL,濃度為?100?umol/L?引物?2?pL,??ddH20補足總體積。采用7個有代表性茶樹DNA基因組組成的基因池對50條??ISSR通用引物進行有無多態(tài)性條帶的篩選試驗,圖2-2為部分引物多態(tài)性篩選??情況。對比擴增條帶的穩(wěn)定性、條帶的清晰度,從50條引物中篩選到11條多態(tài)??性良好,擴增穩(wěn)定、清晰的引物。對篩選出的11條具有較好多態(tài)性的引物進行??退火溫度的篩選,以電泳條帶中有清晰條帶所在溫度為退火溫度,最后得到11??條引物的最適退火溫度,如圖2-3為引物UBC841、UBC853和UBC854的退火??溫度電泳圖。對55份供試材料進行擴增,擴增圖譜2.4為引物892的擴增情況,??在篩選到的11條引物中單引物UBC840最多能擴增出19條;引物UBC880和??881擴增最少,為11條條帶;共得到156條DNA譜帶,平均每條引物擴增出14.2??條條帶,其中多態(tài)性譜帶152條,平均多態(tài)性比率(PPB)為97.45%;多態(tài)性位點??百分率(PPL)最高為100%,最低為87.5%(如表2-5),說明供試茶樹遺傳資源??的多態(tài)性較為豐富。??———a—BBH——??2000bp?遼:??l()(M>hp?…:L?.:?v''?f'?.?'?,:?;■??750bp??500bp?I?縛
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[6]貴州地方茶樹品種資源遺傳多樣性RAPD分析[J]. 鄢東海,劉聲傳,羅顯揚,魏杰,陸建良,范方媛. 中國農學通報. 2015(19)
[7]利用AFLP標記構建4種薯蕷屬植物的指紋圖譜[J]. 郭文,李婉琳,肖繼坪,白磊,賈振華,龍雯虹,郭華春. 分子植物育種. 2015(03)
[8]鳳凰單叢茶樹資源遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 吳清韓,莊東紅,朱慧,趙慶芳,楊培奎,馬瑞君. 熱帶作物學報. 2015(03)
[9]98份甘蔗種質資源遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 昝逢剛,應雄美,吳才文,趙培方,陳學寬,馬麗,蘇火生,劉家勇. 中國農業(yè)科學. 2015(05)
[10]SCoT分子標記在植物研究中的應用進展[J]. 龍治堅,范理璋,徐剛,胡尚連,韓國輝. 植物遺傳資源學報. 2015(02)
博士論文
[1]‘東魁’楊梅(Myrica rubra cv.Dongkui)兩個變異材料的發(fā)掘及鑒定[D]. 陳方永.華中農業(yè)大學 2014
[2]鐵觀音茶樹種性分化的分子鑒定及差異表達基因分離研究[D]. 陳志丹.福建農林大學 2013
[3]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT標記的柑橘連鎖圖譜構建及雜種和多倍體遺傳分析[D]. 韓國輝.西南大學 2012
[4]利用ISSR和EST-SSR標記研究中國茶樹資源的遺傳多樣性和遺傳結構[D]. 姚明哲.浙江大學 2009
[5]EST-SSR和ISSR分子標記在云南茶樹資源中的應用研究[D]. 劉本英.中國農業(yè)科學院 2009
[6]茶樹遺傳多樣性分析與遺傳圖譜構建[D]. 黃福平.浙江大學 2005
碩士論文
[1]陜西茶樹種質資源DNA指紋圖譜構建[D]. 陳熙.陜西理工學院 2016
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[4]基于DArT技術的大黃魚耐低溫性狀相關分子標記的篩選[D]. 閆松松.寧波大學 2014
[5]5種山茶屬野生油茶ISSR親緣關系研究及指紋圖譜的構建[D]. 李國帥.中南林業(yè)科技大學 2014
[6]油茶種質資源多樣性的ISSR分析[D]. 周蘭英.湖南師范大學 2014
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[8]川渝選育茶樹品種的RAPD和ISSR分析[D]. 遲琳.四川農業(yè)大學 2013
[9]特異茶樹種質資源RAPD標記向SCAR標記轉化的研究[D]. 吳永勝.四川農業(yè)大學 2012
[10]30份四川茶樹主要種質資源遺傳多樣性和親緣關系的SRAP分析[D]. 席春奕.四川農業(yè)大學 2012
本文編號:3269474
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