發(fā)布時(shí)間：2021-07-06 14:55

　　木薯作為一種典型的多年生灌木植物,以其高生物量、抗貧瘠、抗病蟲害、耐干旱等特點(diǎn),被廣泛運(yùn)用于食用、飼用上。而且還被廣泛運(yùn)用于生產(chǎn)加工上,如造紙、紡織、淀粉生產(chǎn)及生物燃料生產(chǎn)等。雖然目前木薯的育種體系已經(jīng)較為成熟,但傳統(tǒng)的育種手段已經(jīng)不能滿足生產(chǎn)和生活的需求。因?yàn)閭鹘y(tǒng)育種的育種周期長,而且由于木薯基因組具有高度雜合的特性。這種雜合性雖然增加了木薯遺傳變異的豐富程度,但同時(shí)也增加了木薯培育過程的難度,所以通過分子標(biāo)記輔助育種來挖掘控制優(yōu)良性狀的等位基因?qū)τ谀臼淼倪z傳改良有重要意義。本研究中的實(shí)驗(yàn)群體來源于巴西不同地方的192份栽培木薯品種,共考察了包括株高、地上部分產(chǎn)量、鮮薯產(chǎn)量、產(chǎn)量指數(shù)、干物質(zhì)含量、淀粉產(chǎn)量在內(nèi)的6種數(shù)量性狀,進(jìn)行了12個(gè)不同環(huán)境的表型鑒定,并測量和記錄了表型觀測值。隨后,對(duì)考察的表型性狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并采取最佳線性無偏預(yù)測法（BLUP）對(duì)不同性狀的育種值進(jìn)行估算,然后利用BLUP計(jì)算過程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)對(duì)廣義遺傳力（H²）進(jìn)行了估算。同時(shí),提取該巴西木薯群體中的木薯基因組DNA,利用AFSM（擴(kuò)增片段單核苷酸多態(tài)性和甲基化）技術(shù)對(duì)DNA進(jìn)行簡化測序,... 

【文章來源】：廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-16個(gè)數(shù)量性狀BLUP值的頻率分布直方圖

碩士學(xué)位論文巴西木薯種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的GWAS分析24驗(yàn)使用的192份巴西栽培種木薯進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)的分析。當(dāng)亞群數(shù)K值范圍設(shè)置為1到12，計(jì)算在不同K值下的CVerror值。當(dāng)K從1到2時(shí)，CVerror值迅速減�。籏從2到4時(shí)，CVerror值逐漸增加；當(dāng)K從4到9時(shí)，CVerror值又逐漸減小并趨于平緩；當(dāng)K大于9時(shí)，CVerror值又出現(xiàn)一定的增幅(圖3-2)。由此結(jié)果可知：當(dāng)K等于9時(shí)，CVerror值最小，因此9是最恰當(dāng)?shù)膩喨簲?shù)，所以我們通過該結(jié)果將巴西栽培種木薯群體分為9個(gè)亞群，分別是亞群1、亞群2、亞群3、亞群4、亞群5、亞群6、亞群7、亞群8、亞群9(subgroup1-subgroup9)。圖3-2ADMIXTURE軟件分析得到的CVerror值Figure3-2CVerrorvalueanalyzedbyADMIXTUREsoftware通過ADMIXTURE軟件計(jì)算得到的每個(gè)個(gè)體該9個(gè)亞群中的Q值，將每個(gè)個(gè)體劃分至Q值最大時(shí)位于的亞群，因此確定每個(gè)亞群中的木薯材料（圖3-3）。經(jīng)過統(tǒng)計(jì)，9個(gè)亞群中包含的木薯材料分別是3份、22份、27份、6份、20份、25份、24份、12份和53份。圖3-3K=9時(shí)的群體結(jié)構(gòu)Figure3-3PopulationstructurebasedonK=9注：在該群體結(jié)構(gòu)中，每個(gè)個(gè)體用一根帶有9種不同顏色的線條表示，根據(jù)顏色的占比來推斷該個(gè)體屬于的亞群，紅、橙、草綠、綠、藍(lán)綠、淺藍(lán)、深藍(lán)、紫和紫紅色分別代表亞群1-亞群9.

碩士學(xué)位論文巴西木薯種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的GWAS分析24驗(yàn)使用的192份巴西栽培種木薯進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)的分析。當(dāng)亞群數(shù)K值范圍設(shè)置為1到12，計(jì)算在不同K值下的CVerror值。當(dāng)K從1到2時(shí)，CVerror值迅速減�。籏從2到4時(shí)，CVerror值逐漸增加；當(dāng)K從4到9時(shí)，CVerror值又逐漸減小并趨于平緩；當(dāng)K大于9時(shí)，CVerror值又出現(xiàn)一定的增幅(圖3-2)。由此結(jié)果可知：當(dāng)K等于9時(shí)，CVerror值最小，因此9是最恰當(dāng)?shù)膩喨簲?shù)，所以我們通過該結(jié)果將巴西栽培種木薯群體分為9個(gè)亞群，分別是亞群1、亞群2、亞群3、亞群4、亞群5、亞群6、亞群7、亞群8、亞群9(subgroup1-subgroup9)。圖3-2ADMIXTURE軟件分析得到的CVerror值Figure3-2CVerrorvalueanalyzedbyADMIXTUREsoftware通過ADMIXTURE軟件計(jì)算得到的每個(gè)個(gè)體該9個(gè)亞群中的Q值，將每個(gè)個(gè)體劃分至Q值最大時(shí)位于的亞群，因此確定每個(gè)亞群中的木薯材料（圖3-3）。經(jīng)過統(tǒng)計(jì)，9個(gè)亞群中包含的木薯材料分別是3份、22份、27份、6份、20份、25份、24份、12份和53份。圖3-3K=9時(shí)的群體結(jié)構(gòu)Figure3-3PopulationstructurebasedonK=9注：在該群體結(jié)構(gòu)中，每個(gè)個(gè)體用一根帶有9種不同顏色的線條表示，根據(jù)顏色的占比來推斷該個(gè)體屬于的亞群，紅、橙、草綠、綠、藍(lán)綠、淺藍(lán)、深藍(lán)、紫和紫紅色分別代表亞群1-亞群9.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]利用連鎖和全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定花生株型相關(guān)性狀的QTLs[D]. 李麗.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]木薯種質(zhì)資源綜合評(píng)價(jià)及主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 張圣奎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018

碩士論文
[1]木薯初級(jí)分子遺傳圖譜構(gòu)建[D]. 付瑜華.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3268453