甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間的遺傳及株高和開花時(shí)間的QTL定位
發(fā)布時(shí)間:2021-06-20 16:02
甘藍(lán)型油菜是我國(guó)重要的油料作物,是我國(guó)食用植物油的主要來(lái)源。株高和開花時(shí)間是當(dāng)前油菜育種的兩個(gè)重要性狀,適當(dāng)?shù)慕档椭旮吆涂s短開花時(shí)間,對(duì)于提高油菜抗倒伏性和早熟性,推動(dòng)油菜機(jī)械化收獲,促進(jìn)油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有戰(zhàn)略意義。本課題組從2015年開始對(duì)甘藍(lán)型油菜株高和開花時(shí)間進(jìn)行深入研究,選用兩個(gè)甘藍(lán)型油菜的高代自交系YG-1(高桿晚熟)和72-27-1-2(矮桿早熟)為親本,利用其六世代群體研究了株高性狀的遺傳;并利用SSR標(biāo)記初步構(gòu)建了甘藍(lán)型油菜株高和開花時(shí)間的遺傳圖譜,對(duì)株高與開花時(shí)間QTL進(jìn)行初步定位(劉霞2018)。本研究在前期研究基礎(chǔ)上,一方面繼續(xù)開展了開花時(shí)間及相關(guān)性狀的數(shù)量遺傳分析,另一方面,采用SLAF-seq技術(shù)對(duì)F2群體進(jìn)行測(cè)序,構(gòu)建株高和開花時(shí)間高密度遺傳圖譜,進(jìn)一步對(duì)株高與開花時(shí)間QTL進(jìn)行定位、預(yù)測(cè)候選基因,以期為油菜矮化和早熟育種提供理論和技術(shù)基礎(chǔ)。本研究取得的主要結(jié)果如下:1.開花時(shí)間的“主基因+多基因”遺傳分析構(gòu)建的六世代遺傳群體種植于楊凌和三原兩點(diǎn),調(diào)查其現(xiàn)蕾時(shí)間(ST)、抽薹時(shí)間(BT)和開花時(shí)間(FT),應(yīng)用植物數(shù)量性狀“主基因+多基因...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 研究背景
1.2 株高和開花的遺傳研究
1.2.1 影響植物株高的主要因素
1.2.2 開花的遺傳研究
1.3 植物數(shù)量性狀主基因+多基因遺傳分析研究
1.3.1 主基因+多基因遺傳分析研究思路
1.3.2 開花時(shí)間的主基因+多基因遺傳分析研究進(jìn)展
1.4 蕓薹屬遺傳圖譜的研究進(jìn)展
1.4.1 油菜遺傳圖譜的研究
1.4.2 SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建遺傳圖譜的研究
1.5 油菜株高及相關(guān)性狀和開花時(shí)間的QTL研究進(jìn)展
1.5.1 油菜株高及相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.5.2 油菜開花時(shí)間的QTL研究進(jìn)展
1.6 本研究的目的意義
第二章 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間的主基因+多基因遺傳分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 材料種植與田間管理
2.2.2 性狀調(diào)查及方法
2.2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 六世代群體各性狀統(tǒng)計(jì)性狀及次數(shù)分布
2.3.2 開花時(shí)間及關(guān)聯(lián)性狀主基因+多基因遺傳分析
2.4 討論
2.4.1 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間及關(guān)聯(lián)性狀的遺傳分析
2.4.2 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間遺傳與QTL比較分析
2.5 結(jié)論
第三章 基于SLAF-seq技術(shù)的甘藍(lán)型油菜高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 DNA的提取與檢測(cè)
3.2.2 酶切方案設(shè)計(jì)
3.2.3 重測(cè)序建庫(kù)測(cè)序
3.2.4 SLAF建庫(kù)測(cè)序
3.2.5 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與評(píng)估
3.2.6 SNP標(biāo)記的開發(fā)與基因分型
3.2.7 遺傳圖譜構(gòu)建
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 基因組DNA質(zhì)量檢測(cè)
3.3.2 生物信息學(xué)分析
3.3.3 遺傳圖譜構(gòu)建
3.3.4 繪制連鎖群
3.3.5 遺傳圖譜基本信息統(tǒng)計(jì)
3.3.6 遺傳圖譜評(píng)估
3.4 討論
3.4.1 SLAF-seq技術(shù)在SNP標(biāo)記開發(fā)的可行性
3.4.2 甘藍(lán)型高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
3.4.3 偏分離標(biāo)記分析
3.5 結(jié)論
第四章 甘藍(lán)型油菜株高與開花時(shí)間的QTL定位及候選基因分析
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 性狀調(diào)查與分析
4.2.2 QTL定位方法與軟件
4.2.3 候選基因注釋
4.2.4 候選基因分析
4.2.5 SCAR標(biāo)記的開發(fā)
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 表型統(tǒng)計(jì)
4.3.2 相關(guān)性分析
4.3.3 QTL定位分析
4.3.4 QTL物理位置一致性比較
4.3.5 候選基因注釋
4.3.6 候選基因分析
4.3.7 候選基因表達(dá)分析
4.3.8 SCAR標(biāo)記的開發(fā)
4.4 討論
4.4.1 株高及相關(guān)性狀QTL定位結(jié)果比較
4.4.2 開花時(shí)間及相關(guān)性狀QTL定位結(jié)果比較
4.4.3 本研究試驗(yàn)創(chuàng)新與不足
4.5 結(jié)論
第五章 全文結(jié)論
5.1 開花時(shí)間的“主基因+多基因”遺傳分析
5.2 株高與開花時(shí)間的表型統(tǒng)計(jì)與相關(guān)性分析
5.3 基于SLAF-seq技術(shù)的甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜構(gòu)建
5.4 株高與開花時(shí)間性狀的QTL定位
5.5 候選基因預(yù)測(cè)與分析
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘藍(lán)型油菜株高及其相關(guān)性狀的主基因+多基因遺傳分析[J]. 劉霞,張冰冰,馬兵,趙娜,田正書,秦夢(mèng)凡,王陽(yáng),郎麗娜,劉亞萍,黃鎮(zhèn),徐愛(ài)遐. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(04)
[2]基于SSR標(biāo)記的四倍體鴨茅遺傳圖譜加密[J]. 唐露,金夢(mèng)雅,黃琳凱,張旭,趙欣欣,張新全. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[3]高粱株型性狀數(shù)量遺傳分析[J]. 李延玲,白曉倩,于澎湃,高建明,裴忠有,羅峰,孫守鈞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]甘藍(lán)型油菜莖稈強(qiáng)度性狀的主基因+多基因遺傳分析[J]. 李洪戈,張麗萍,伍曉明. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]切花小菊主要分枝性狀的混合遺傳分析[J]. 楊信程,蘇江碩,吳洋洋,張飛,管志勇,陳發(fā)棣,房偉民. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[6]基于SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建亞麻高密度遺傳圖譜[J]. 高鳳云,斯欽巴特爾,張輝,賈霄云,伊六喜,周宇,李強(qiáng),葉應(yīng)福,侯建華. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(03)
[7]Rapeseed research and production in China[J]. Qiong Hu,Wei Hua,Yan Yin,Xuekun Zhang,Lijiang Liu,Jiaqin Shi,Yongguo Zhao,Lu Qin,Chang Chen,Hanzhong Wang. The Crop Journal. 2017(02)
[8]甘藍(lán)型油菜抗寒相關(guān)基因的QTL初步定位[J]. 趙娜,郎麗娜,盧虹,劉璐,劉亞萍,劉霞,田正書,王陽(yáng),黃鎮(zhèn),徐愛(ài)遐. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(05)
[9]胡麻粗脂肪含量的主基因+多基因遺傳分析[J]. 化青春,趙利,王利民,趙瑋,黨照,張建平,黨占海. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(11)
[10]大粒型水稻材料粒型性狀的QTL定位[J]. 汪欲鵬,王根發(fā),武志峰,王智權(quán),石慶華,潘曉華,吳自明. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(12)
博士論文
[1]辣椒高密度遺傳圖譜構(gòu)建與小孢子胚胎發(fā)生QTL定位[D]. 張曉芬.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]利用高密度SNP圖譜定位甘藍(lán)型油菜含油量及角粒相關(guān)性狀QTL[D]. 陳軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]金花菜的遺傳多樣性及連鎖圖譜構(gòu)建[D]. 任海龍.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[4]梅花高密度遺傳圖譜構(gòu)建及部分觀賞性狀QTL分析[D]. 張杰.北京林業(yè)大學(xué) 2016
[5]春性甘藍(lán)型油菜遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及開花時(shí)間的QTL定位分析[D]. 柳海東.青海大學(xué) 2015
[6]甘藍(lán)型油菜導(dǎo)入系構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]牡丹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL分析[D]. 蔡長(zhǎng)福.北京林業(yè)大學(xué) 2015
[8]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[9]甘藍(lán)型油菜硼高效基因的定位[D]. 趙尊康.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[10]甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜構(gòu)建及農(nóng)藝、品質(zhì)性狀的QTL定位[D]. 王峰.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜株高遺傳及株高和開花時(shí)間的QTL定位[D]. 劉霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)型油菜一個(gè)主效開花期QTLqFTc2-1的精細(xì)定位[D]. 蔡靜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]利用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建高密度丹參連鎖圖譜[D]. 劉甜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]油菜開花期QTL分析以及三個(gè)主效QTL的精細(xì)定位[D]. 熊化鑫.浙江師范大學(xué) 2016
[5]甘藍(lán)型油菜株高和角果長(zhǎng)及其相關(guān)性狀QTL定位[D]. 陰濤.西南大學(xué) 2015
[6]甘藍(lán)型油菜花期調(diào)控基因標(biāo)記開發(fā)與開花時(shí)間QTL定位[D]. 譚勇俊.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]甘藍(lán)型油菜主要株型性狀的遺傳分析和QTL初步定位[D]. 張倩.西南大學(xué) 2013
[8]結(jié)球甘藍(lán)抽薹性狀的遺傳分析及分子標(biāo)記研究[D]. 郭輝.西南大學(xué) 2012
[9]油菜早熟品種生理生化特性研究[D]. 王必慶.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[10]不結(jié)球白菜抽薹性狀生化特性和分子標(biāo)記及遺傳模型分析[D]. 杜正香.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3239506
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 研究背景
1.2 株高和開花的遺傳研究
1.2.1 影響植物株高的主要因素
1.2.2 開花的遺傳研究
1.3 植物數(shù)量性狀主基因+多基因遺傳分析研究
1.3.1 主基因+多基因遺傳分析研究思路
1.3.2 開花時(shí)間的主基因+多基因遺傳分析研究進(jìn)展
1.4 蕓薹屬遺傳圖譜的研究進(jìn)展
1.4.1 油菜遺傳圖譜的研究
1.4.2 SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建遺傳圖譜的研究
1.5 油菜株高及相關(guān)性狀和開花時(shí)間的QTL研究進(jìn)展
1.5.1 油菜株高及相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.5.2 油菜開花時(shí)間的QTL研究進(jìn)展
1.6 本研究的目的意義
第二章 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間的主基因+多基因遺傳分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 材料種植與田間管理
2.2.2 性狀調(diào)查及方法
2.2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 六世代群體各性狀統(tǒng)計(jì)性狀及次數(shù)分布
2.3.2 開花時(shí)間及關(guān)聯(lián)性狀主基因+多基因遺傳分析
2.4 討論
2.4.1 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間及關(guān)聯(lián)性狀的遺傳分析
2.4.2 甘藍(lán)型油菜開花時(shí)間遺傳與QTL比較分析
2.5 結(jié)論
第三章 基于SLAF-seq技術(shù)的甘藍(lán)型油菜高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 DNA的提取與檢測(cè)
3.2.2 酶切方案設(shè)計(jì)
3.2.3 重測(cè)序建庫(kù)測(cè)序
3.2.4 SLAF建庫(kù)測(cè)序
3.2.5 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與評(píng)估
3.2.6 SNP標(biāo)記的開發(fā)與基因分型
3.2.7 遺傳圖譜構(gòu)建
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 基因組DNA質(zhì)量檢測(cè)
3.3.2 生物信息學(xué)分析
3.3.3 遺傳圖譜構(gòu)建
3.3.4 繪制連鎖群
3.3.5 遺傳圖譜基本信息統(tǒng)計(jì)
3.3.6 遺傳圖譜評(píng)估
3.4 討論
3.4.1 SLAF-seq技術(shù)在SNP標(biāo)記開發(fā)的可行性
3.4.2 甘藍(lán)型高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
3.4.3 偏分離標(biāo)記分析
3.5 結(jié)論
第四章 甘藍(lán)型油菜株高與開花時(shí)間的QTL定位及候選基因分析
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 性狀調(diào)查與分析
4.2.2 QTL定位方法與軟件
4.2.3 候選基因注釋
4.2.4 候選基因分析
4.2.5 SCAR標(biāo)記的開發(fā)
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 表型統(tǒng)計(jì)
4.3.2 相關(guān)性分析
4.3.3 QTL定位分析
4.3.4 QTL物理位置一致性比較
4.3.5 候選基因注釋
4.3.6 候選基因分析
4.3.7 候選基因表達(dá)分析
4.3.8 SCAR標(biāo)記的開發(fā)
4.4 討論
4.4.1 株高及相關(guān)性狀QTL定位結(jié)果比較
4.4.2 開花時(shí)間及相關(guān)性狀QTL定位結(jié)果比較
4.4.3 本研究試驗(yàn)創(chuàng)新與不足
4.5 結(jié)論
第五章 全文結(jié)論
5.1 開花時(shí)間的“主基因+多基因”遺傳分析
5.2 株高與開花時(shí)間的表型統(tǒng)計(jì)與相關(guān)性分析
5.3 基于SLAF-seq技術(shù)的甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜構(gòu)建
5.4 株高與開花時(shí)間性狀的QTL定位
5.5 候選基因預(yù)測(cè)與分析
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘藍(lán)型油菜株高及其相關(guān)性狀的主基因+多基因遺傳分析[J]. 劉霞,張冰冰,馬兵,趙娜,田正書,秦夢(mèng)凡,王陽(yáng),郎麗娜,劉亞萍,黃鎮(zhèn),徐愛(ài)遐. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(04)
[2]基于SSR標(biāo)記的四倍體鴨茅遺傳圖譜加密[J]. 唐露,金夢(mèng)雅,黃琳凱,張旭,趙欣欣,張新全. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[3]高粱株型性狀數(shù)量遺傳分析[J]. 李延玲,白曉倩,于澎湃,高建明,裴忠有,羅峰,孫守鈞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]甘藍(lán)型油菜莖稈強(qiáng)度性狀的主基因+多基因遺傳分析[J]. 李洪戈,張麗萍,伍曉明. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]切花小菊主要分枝性狀的混合遺傳分析[J]. 楊信程,蘇江碩,吳洋洋,張飛,管志勇,陳發(fā)棣,房偉民. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[6]基于SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建亞麻高密度遺傳圖譜[J]. 高鳳云,斯欽巴特爾,張輝,賈霄云,伊六喜,周宇,李強(qiáng),葉應(yīng)福,侯建華. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(03)
[7]Rapeseed research and production in China[J]. Qiong Hu,Wei Hua,Yan Yin,Xuekun Zhang,Lijiang Liu,Jiaqin Shi,Yongguo Zhao,Lu Qin,Chang Chen,Hanzhong Wang. The Crop Journal. 2017(02)
[8]甘藍(lán)型油菜抗寒相關(guān)基因的QTL初步定位[J]. 趙娜,郎麗娜,盧虹,劉璐,劉亞萍,劉霞,田正書,王陽(yáng),黃鎮(zhèn),徐愛(ài)遐. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(05)
[9]胡麻粗脂肪含量的主基因+多基因遺傳分析[J]. 化青春,趙利,王利民,趙瑋,黨照,張建平,黨占海. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(11)
[10]大粒型水稻材料粒型性狀的QTL定位[J]. 汪欲鵬,王根發(fā),武志峰,王智權(quán),石慶華,潘曉華,吳自明. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(12)
博士論文
[1]辣椒高密度遺傳圖譜構(gòu)建與小孢子胚胎發(fā)生QTL定位[D]. 張曉芬.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]利用高密度SNP圖譜定位甘藍(lán)型油菜含油量及角粒相關(guān)性狀QTL[D]. 陳軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]金花菜的遺傳多樣性及連鎖圖譜構(gòu)建[D]. 任海龍.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[4]梅花高密度遺傳圖譜構(gòu)建及部分觀賞性狀QTL分析[D]. 張杰.北京林業(yè)大學(xué) 2016
[5]春性甘藍(lán)型油菜遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及開花時(shí)間的QTL定位分析[D]. 柳海東.青海大學(xué) 2015
[6]甘藍(lán)型油菜導(dǎo)入系構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]牡丹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL分析[D]. 蔡長(zhǎng)福.北京林業(yè)大學(xué) 2015
[8]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[9]甘藍(lán)型油菜硼高效基因的定位[D]. 趙尊康.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[10]甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜構(gòu)建及農(nóng)藝、品質(zhì)性狀的QTL定位[D]. 王峰.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜株高遺傳及株高和開花時(shí)間的QTL定位[D]. 劉霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)型油菜一個(gè)主效開花期QTLqFTc2-1的精細(xì)定位[D]. 蔡靜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]利用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建高密度丹參連鎖圖譜[D]. 劉甜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]油菜開花期QTL分析以及三個(gè)主效QTL的精細(xì)定位[D]. 熊化鑫.浙江師范大學(xué) 2016
[5]甘藍(lán)型油菜株高和角果長(zhǎng)及其相關(guān)性狀QTL定位[D]. 陰濤.西南大學(xué) 2015
[6]甘藍(lán)型油菜花期調(diào)控基因標(biāo)記開發(fā)與開花時(shí)間QTL定位[D]. 譚勇俊.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]甘藍(lán)型油菜主要株型性狀的遺傳分析和QTL初步定位[D]. 張倩.西南大學(xué) 2013
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