四翅濱藜蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子和抗氧化系統(tǒng)響應(yīng)鹽處理的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2021-06-18 20:59
四翅濱藜(Atriplex canescens)又稱灰毛濱藜,為藜科(Chenopodiaceae)濱藜屬多年生C4半常綠灌木,其生長速度快,營養(yǎng)價值較高、葉片四季常綠,是一種極具利用價值的優(yōu)良飼草資源。同時,四翅濱藜還具有超強(qiáng)的耐旱性和抗鹽性,可作為鹽漬化荒漠地區(qū)植被恢復(fù)和防風(fēng)固沙的重要物種。在長期適應(yīng)鹽漬環(huán)境過程中,四翅濱藜進(jìn)化出了獨(dú)特的抗鹽機(jī)理,蘊(yùn)含著豐富的抗逆基因資源。實(shí)驗(yàn)室前期研究已初步闡明了四翅濱藜抗鹽的生理機(jī)制,并篩選到參與其離子轉(zhuǎn)運(yùn)、光合作用、水分平衡以及有機(jī)滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)合成等過程的功能基因。但是,目前對四翅濱藜適應(yīng)鹽漬環(huán)境過程中的蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子和抗氧化系統(tǒng)相關(guān)的分子基礎(chǔ)還不清楚,對此展開深入研究將有望為系統(tǒng)揭示該物種的逆境適應(yīng)機(jī)理和挖掘關(guān)鍵抗逆基因奠定基礎(chǔ),這對于四翅濱藜這一資源植物自身的開發(fā)利用以及優(yōu)良牧草的遺傳改良均具有十分重要的理論意義。本論文采用RNA-seq高通量測序技術(shù),對鹽處理下四翅濱藜的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序,在此基礎(chǔ)上分析并初步篩選了蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子、抗氧化酶和抗氧化劑合成等相關(guān)的差異表達(dá)基因,取得如下主要結(jié)果:1.對100 mm...
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄組測序流程
圖 3-1 轉(zhuǎn)錄組測序流程Figure 3-1 Transcriptome sequencing process藜根和葉的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行 Unigene 的過程如圖 3-2 所示:
文 四翅濱藜蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子和抗氧化系統(tǒng)響ll-Unigene 從 nr、Swiss-Prot、KEGG、COG,從而確定其蛋白功能注釋。最后跟所有TScan 預(yù)測其序列信息(熊麗東,2011)。達(dá)譜測序。100 mmol/L NaCl 處理 6 h、24 h 的四翅濱行表達(dá)譜測序并篩選差異表達(dá)基因(Diff體流程如圖 3-3 所示:差異表達(dá)基因,并對其進(jìn)行 GO 富集分析,能的生物學(xué)功能(Wang 等,2013)。具體分ene Ontology 數(shù)據(jù)庫中的各條目(Term)進(jìn);(2)用超幾何檢驗(yàn),找出基因顯著富集的
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃酮類物質(zhì)的生物合成及對干旱脅迫響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 白禹,卯丹,王繼玥. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(16)
[2]棉花過表達(dá)超氧化物歧化酶基因?qū)χ仓昴望}性的影響[J]. 胡根海,張曉紅,付遠(yuǎn)志,董娜,王清連. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(06)
[3]活性氧與植物抗氧化系統(tǒng)研究進(jìn)展[J]. 白英俊,李國瑞,黃鳳蘭,李威,叢安琪,陳永勝. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(36)
[4]四翅濱藜生理生化特征對鹽脅迫的響應(yīng)[J]. 張震中,張?zhí)?李倩,唐達(dá),李思思,王池宇,賀康寧. 西北植物學(xué)報. 2017(12)
[5]西北地區(qū)種植甘草對土壤次生鹽漬化的影響[J]. 李昂,吳應(yīng)珍,馬明廣,張鳴,孫海麗,閆立本. 水土保持通報. 2016(06)
[6]逆境脅迫對苦蕎花期總黃酮含量及關(guān)鍵酶基因表達(dá)的影響[J]. 侯伶俐,楊雄榜,董雪妮,丁夢琦,朱雪梅,邵繼榮. 核農(nóng)學(xué)報. 2016(01)
[7]秋茄硫氧還蛋白調(diào)控活性氧平衡增強(qiáng)煙草耐鹽機(jī)制研究[J]. 荊曉姝,孫苑玲,向敏,錢澤勇,郎濤,趙瑞,沈昕,陳少良. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(06)
[8]鹽漬化土壤改良的研究進(jìn)展[J]. 顧文婷,董喜存,李文建,劉瑞媛,金文杰. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(06)
[9]甘肅沿黃灌區(qū)土壤鹽漬化特征及其成因[J]. 楊思存,車宗賢,王成寶,霍琳,姜萬禮. 干旱區(qū)研究. 2014(01)
[10]土壤鹽分對三角葉濱藜抗旱性能的影響[J]. 譚永芹,柏新富,侯玉平,張振華. 生態(tài)學(xué)報. 2013(23)
博士論文
[1]三種濱藜的旱鹽逆境脅迫及其引種適應(yīng)性評價[D]. 胡生榮.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]四翅濱藜耐鹽抗旱的生理機(jī)制研究[D]. 潘雅清.蘭州大學(xué) 2016
[2]擬南芥黃烷酮-3-羥化酶調(diào)控非生物脅迫抗性機(jī)理研究[D]. 孫鵬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]亞麻芥不同發(fā)育時期種子轉(zhuǎn)錄組測序及分析[D]. 李雨霖.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]植物鹽分吸收和積累對其抗旱性能的影響[D]. 譚永芹.魯東大學(xué) 2012
[5]紅花轉(zhuǎn)錄組測序分析及其油體蛋白全長的獲得[D]. 熊麗東.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]鹽脅迫對中亞濱藜營養(yǎng)器官內(nèi)部結(jié)構(gòu)的影響及其鹽囊泡發(fā)育過程研究[D]. 楊美娟.山東師范大學(xué) 2005
本文編號:3237372
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄組測序流程
圖 3-1 轉(zhuǎn)錄組測序流程Figure 3-1 Transcriptome sequencing process藜根和葉的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行 Unigene 的過程如圖 3-2 所示:
文 四翅濱藜蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子和抗氧化系統(tǒng)響ll-Unigene 從 nr、Swiss-Prot、KEGG、COG,從而確定其蛋白功能注釋。最后跟所有TScan 預(yù)測其序列信息(熊麗東,2011)。達(dá)譜測序。100 mmol/L NaCl 處理 6 h、24 h 的四翅濱行表達(dá)譜測序并篩選差異表達(dá)基因(Diff體流程如圖 3-3 所示:差異表達(dá)基因,并對其進(jìn)行 GO 富集分析,能的生物學(xué)功能(Wang 等,2013)。具體分ene Ontology 數(shù)據(jù)庫中的各條目(Term)進(jìn);(2)用超幾何檢驗(yàn),找出基因顯著富集的
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃酮類物質(zhì)的生物合成及對干旱脅迫響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 白禹,卯丹,王繼玥. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(16)
[2]棉花過表達(dá)超氧化物歧化酶基因?qū)χ仓昴望}性的影響[J]. 胡根海,張曉紅,付遠(yuǎn)志,董娜,王清連. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(06)
[3]活性氧與植物抗氧化系統(tǒng)研究進(jìn)展[J]. 白英俊,李國瑞,黃鳳蘭,李威,叢安琪,陳永勝. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(36)
[4]四翅濱藜生理生化特征對鹽脅迫的響應(yīng)[J]. 張震中,張?zhí)?李倩,唐達(dá),李思思,王池宇,賀康寧. 西北植物學(xué)報. 2017(12)
[5]西北地區(qū)種植甘草對土壤次生鹽漬化的影響[J]. 李昂,吳應(yīng)珍,馬明廣,張鳴,孫海麗,閆立本. 水土保持通報. 2016(06)
[6]逆境脅迫對苦蕎花期總黃酮含量及關(guān)鍵酶基因表達(dá)的影響[J]. 侯伶俐,楊雄榜,董雪妮,丁夢琦,朱雪梅,邵繼榮. 核農(nóng)學(xué)報. 2016(01)
[7]秋茄硫氧還蛋白調(diào)控活性氧平衡增強(qiáng)煙草耐鹽機(jī)制研究[J]. 荊曉姝,孫苑玲,向敏,錢澤勇,郎濤,趙瑞,沈昕,陳少良. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(06)
[8]鹽漬化土壤改良的研究進(jìn)展[J]. 顧文婷,董喜存,李文建,劉瑞媛,金文杰. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(06)
[9]甘肅沿黃灌區(qū)土壤鹽漬化特征及其成因[J]. 楊思存,車宗賢,王成寶,霍琳,姜萬禮. 干旱區(qū)研究. 2014(01)
[10]土壤鹽分對三角葉濱藜抗旱性能的影響[J]. 譚永芹,柏新富,侯玉平,張振華. 生態(tài)學(xué)報. 2013(23)
博士論文
[1]三種濱藜的旱鹽逆境脅迫及其引種適應(yīng)性評價[D]. 胡生榮.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]四翅濱藜耐鹽抗旱的生理機(jī)制研究[D]. 潘雅清.蘭州大學(xué) 2016
[2]擬南芥黃烷酮-3-羥化酶調(diào)控非生物脅迫抗性機(jī)理研究[D]. 孫鵬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]亞麻芥不同發(fā)育時期種子轉(zhuǎn)錄組測序及分析[D]. 李雨霖.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]植物鹽分吸收和積累對其抗旱性能的影響[D]. 譚永芹.魯東大學(xué) 2012
[5]紅花轉(zhuǎn)錄組測序分析及其油體蛋白全長的獲得[D]. 熊麗東.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]鹽脅迫對中亞濱藜營養(yǎng)器官內(nèi)部結(jié)構(gòu)的影響及其鹽囊泡發(fā)育過程研究[D]. 楊美娟.山東師范大學(xué) 2005
本文編號:3237372
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/nzwlw/3237372.html
最近更新
教材專著