大麥穗發(fā)育相關(guān)基因的鑒定和功能分析
發(fā)布時間:2021-06-17 23:13
本論文為了鑒定參與穗發(fā)育過程的關(guān)鍵基因,利用反向遺傳學(xué)、正向遺傳學(xué)以及生物信息學(xué)方法開展了相關(guān)研究。研究結(jié)果如下:1.用已報道的水稻和玉米中參與花序發(fā)育的基因作為參考找到大麥中的同源基因,應(yīng)用CRISPR-Cas9 系統(tǒng)構(gòu)建敲除載體。以 Cold1(Chilling-tolerance divergence1)和CSA(Carbon starved anther)基因進行遺傳轉(zhuǎn)化實驗,初步建立了大麥轉(zhuǎn)化體系。我們敲除了 12個與水稻、玉米和擬南芥花序發(fā)育相關(guān)的大麥同源基因,獲得轉(zhuǎn)基因苗,其中鑒定到cold1,qSW5(QTL for seed widthonchromosome5)發(fā)生基因突變,并進行了表型觀察。在大田中我們發(fā)現(xiàn)大麥cold1突變體的株高矮于野生型,在溫室5℃-8℃處理2周幼苗,成熟大麥從第12天開始出現(xiàn)突變體植株矮于野生型,但沒有田里材料顯著。說明HvCold1可能參與大麥株型發(fā)育,并和溫度因子相關(guān),對該基因的功能進行了初步分析。2.為了研究激素在大麥穗發(fā)育中的功能,通過生物信息學(xué)方法在大麥基因組中鑒定到36個生長素/吲哚乙酸(Aux/IAA,Auxin/indole...
【文章來源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2不同棱形基因座的穗型[3|]??Figure?1-2?Spike?morphology?of?different?row-type?loci??:,:,vw:
寧夏大學(xué)碩士學(xué)位論文?第二章應(yīng)用CRISPR/Cas9系統(tǒng)鑒定大麥穗發(fā)育相關(guān)基因??IryFiDD??Seedling?Double?ridge?Lemma?primordium?Stamen?primorduim?Awn?primorduim?White?anther??SO?DR?LP?SP?AP?WA??圖2-2大麥主要的穗發(fā)育時期??Figure?2-2?The?major?phases?of?barley?development??(A)?Seedling:幼苗期,(B)?Double?ridge:雙脊期,(C)?Lemma?primordium:外稃原基期,(D)?Stamen?primordium:??雄蕊原基期,(E)?Awn?primordium:芒原基期,(F)?White?anther:白色花藥期;??同時,對表2-1中14個穗發(fā)育可能相關(guān)基因的表達水平檢測,我們關(guān)注的時期是:雙脊期、??外稃原基期、雄蕊原基期和芒原基期。qRT-PCR結(jié)果表明,和在穗發(fā)育階段有??顯著的髙表達,//vC&4在大麥穗發(fā)育過程中有較顯著的高表達,//vF£^2、//vCr2、i/vC02、//vi/\??//v7U膨、你矽奶和Z/vCoW/在大麥穗發(fā)育階段的表達較高,而價//v7XW和價_L4C??在穗發(fā)育階段的表達量低,//vKELO沒檢測到相應(yīng)的數(shù)據(jù)。但由于這四個基因在水稻/擬南芥/玉米??中的同源基因均與花序分枝相關(guān),因而我們對以上14個基因進行CRISPR/Cas9載體構(gòu)建(圖2-??3)。??HvFEA2?II?HI/CT2?HvAVPI?H/CKX2 ̄??801?12-1?12*1?y
寧夏大學(xué)碩士學(xué)位論文?第二章應(yīng)用CR1SPR/Cas9系統(tǒng)鑒定大麥穗發(fā)育相關(guān)基因??B?Immature?embryo?isolation???'K?|H?Agrobacterium?mediated??M?l?Mtmnsf〇rmati〇n??—_■■??Root?induction?Shoot?induction?Co-culture?and?selection??圖2-4農(nóng)桿菌介導(dǎo)的大麥轉(zhuǎn)化過程??Figure?2-4?Agrobacterium-mQdiatQd?transfonnation?of?barley??(A)大麥未成熟穗,(B)未成熟胚的分離,(C)農(nóng)桿菌侵染后共培養(yǎng)三天以及篩選45天,(D)分化出芽2周,??(E)生根2周。??注:本圖由李剛師兄提供。??2_2_5轉(zhuǎn)基因植株的DNA鑒定??通過上述遺傳轉(zhuǎn)化體系共得到了?14個基因共422棵TO代幼苗,其中由于侵染、共培養(yǎng)和篩??選過程中一些幼胚未能將目的基因整合到大麥基因組中、操作過程中人為造成的污染等原因使得??所得幼苗較少。對以上所得幼苗進行基因組DNA的提取,用Cas9-F/R這對引物進行PCR驗證,??獲得655bp大小的片段,而野生型中無片段,即得到陽性苗422棵,成苗率為21.5%(422/1960),??陽性率為100%。初步驗證Cas9載體己成功整合到了大麥基因組中(表2-4)。本小節(jié)實驗結(jié)果以??(:〇/沿(〇7////叩-?〇以脈^伽2嘆挪^/)為例,18棵。按酌缍季哂校叮担地翱诖笮〉臈l帶(圖2-5)。??表2-4獲得幼苗及陽性苗數(shù)目??Table?2-4?Obtain?the?number?of?seedling
本文編號:3236100
【文章來源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2不同棱形基因座的穗型[3|]??Figure?1-2?Spike?morphology?of?different?row-type?loci??:,:,vw:
寧夏大學(xué)碩士學(xué)位論文?第二章應(yīng)用CRISPR/Cas9系統(tǒng)鑒定大麥穗發(fā)育相關(guān)基因??IryFiDD??Seedling?Double?ridge?Lemma?primordium?Stamen?primorduim?Awn?primorduim?White?anther??SO?DR?LP?SP?AP?WA??圖2-2大麥主要的穗發(fā)育時期??Figure?2-2?The?major?phases?of?barley?development??(A)?Seedling:幼苗期,(B)?Double?ridge:雙脊期,(C)?Lemma?primordium:外稃原基期,(D)?Stamen?primordium:??雄蕊原基期,(E)?Awn?primordium:芒原基期,(F)?White?anther:白色花藥期;??同時,對表2-1中14個穗發(fā)育可能相關(guān)基因的表達水平檢測,我們關(guān)注的時期是:雙脊期、??外稃原基期、雄蕊原基期和芒原基期。qRT-PCR結(jié)果表明,和在穗發(fā)育階段有??顯著的髙表達,//vC&4在大麥穗發(fā)育過程中有較顯著的高表達,//vF£^2、//vCr2、i/vC02、//vi/\??//v7U膨、你矽奶和Z/vCoW/在大麥穗發(fā)育階段的表達較高,而價//v7XW和價_L4C??在穗發(fā)育階段的表達量低,//vKELO沒檢測到相應(yīng)的數(shù)據(jù)。但由于這四個基因在水稻/擬南芥/玉米??中的同源基因均與花序分枝相關(guān),因而我們對以上14個基因進行CRISPR/Cas9載體構(gòu)建(圖2-??3)。??HvFEA2?II?HI/CT2?HvAVPI?H/CKX2 ̄??801?12-1?12*1?y
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