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轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)答非生物脅迫Meta分析及玉米耐旱候選基因挖掘

發(fā)布時間:2021-06-11 17:08
  植物的一生中通常會遭受各種逆境脅迫,對植物的生長發(fā)育造成非常不利的影響,嚴重的甚至會引起死亡。植物的逆境脅迫主要包括生物脅迫和非生物脅迫兩大類。世界上主要農(nóng)作物每年有近50%的產(chǎn)量損失都與非生物脅迫有關(guān)。轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控植物適應(yīng)非生物脅迫過程中意義重大。本研究通過整合分析方法,對過表達WRKY、MYB、CBF轉(zhuǎn)基因植物及其野生型在干旱、高鹽和低溫脅迫下的表現(xiàn)進行定量比較分析;同時,利用SSR分子標記對62份玉米導入系材料進行基因型分析和苗期耐旱性鑒定,試圖篩選出與玉米耐旱相關(guān)的單片段導入系材料。本研究的目的是統(tǒng)計學和試驗科學研究方法共同探討非生物脅迫下植物生長調(diào)控機制,以期為培育耐旱、耐鹽、耐低溫植物提供理論依據(jù)。主要結(jié)果如下:1.不同水分脅迫環(huán)境條件下WRKY過表達轉(zhuǎn)基因植物與其野生型表現(xiàn)不同。在非水分脅迫下,轉(zhuǎn)基因植物與其野生型在相對含水量上表現(xiàn)差異顯著;在水分脅迫下,轉(zhuǎn)基因植物的存活率顯著高于其野生型,在16個響應(yīng)指標中有7個指標變化率超過20%,其中存活率提高了89.8%。2.不同鹽脅迫環(huán)境條件下MYB過表達轉(zhuǎn)基因植物與其野生型表現(xiàn)不同。在非鹽脅迫下,僅在脯氨酸含量上轉(zhuǎn)基因植物和... 

【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)答非生物脅迫Meta分析及玉米耐旱候選基因挖掘


整合分析基本過程

分布圖,地理位置,分布圖


2.1 試驗材料2.1.1 WRKY 轉(zhuǎn)錄因子響應(yīng)干旱脅迫數(shù)據(jù)搜集從 PubMed、Web of science、SpringerLink 3 個英文數(shù)據(jù)庫中以“植物(Plant)或作物(Crop)”“過表達(Overexpression)”;“干旱(Drought)或非生物脅迫(Abiotic stress)或水分虧缺(Watdeficit)”;WRKY 轉(zhuǎn)錄因子(WRKY transcription factors)為關(guān)鍵詞進行檢索。對檢索到的 435 篇文獻按照以下篩選標準進行篩選:(1)發(fā)表 2008-2018 年間的文章;(2)至少應(yīng)包括一個表型評價指標(如株高,發(fā)芽率,脯氨酸含量,丙二醛含量等);(3)剔除從不同數(shù)據(jù)庫中檢索到的相同研究;(4)剔除綜述、會議報告等非研究型文章;(5)每一個研究應(yīng)包含對照組和處理組;(6每一個處理應(yīng)至少包含 3 個重復;(7)每一篇研究均是以英文的形式發(fā)表的。獲得了符合上述標準的文獻 47 篇,包含 158 個獨立研究(附表 S1)。其中,涉及 19 個物種,其中單子葉植物 6 種雙子葉植物 13 種。禾本科植物 5 種,豆科植物 3 種,茄科植物 2 種,菊科植物 2 種,其它植物種。納入國內(nèi)外干旱研究地理位置分布如圖 2 所示。從圖 2 中可以看出,本次納入的干旱研究地點在世界地圖上主要分布在亞歐大陸,在中國地圖上主要集中在華北平原,少數(shù)分布在長江中下游平原。

位置分布,位置分布,轉(zhuǎn)錄因子,科屬


轉(zhuǎn)錄因子應(yīng)答非生物脅迫 Meta 分析及玉米耐旱候選基因挖掘.1.2 MYB 轉(zhuǎn)錄因子響應(yīng)高鹽脅迫數(shù)據(jù)搜集從 PubMed、Web of science、中國知網(wǎng)(CNKI)、萬方(WanFang)4 個數(shù)據(jù)庫中,以“Plant)”、“MYB 轉(zhuǎn)錄因子(MYB Transcription factors)”、“過表達(Overexpression)”、“鹽Salt stress)”為關(guān)鍵詞進行文獻的檢索。對所檢索到的 632 篇文獻再按照以下標準進行篩選表時間介于 2008-2018 年間;(2)剔除從不同數(shù)據(jù)庫中檢索到的相同研究;(3)研究應(yīng)至脯氨酸含量、鈉離子含量、鉀離子含量、根長等 16 個表型評價指標之一;(4)每一個處少包含 3 個重復;(5)每一個研究應(yīng)包含對照組和處理組;(6)剔除綜述、會議報告等非文章。符合上述標準的文獻有 70 篇,包含了 263 個獨立研究(附表 S2)。其中,英文文,中文文獻 27 篇;涉及 28 個物種,16 個科屬;研究數(shù)量居多的科屬包括禾本科(80)、(36)菊科(24)茄科(24)、豆科(19)等。納入國內(nèi)外高鹽研究地理分布如圖 3 所示 3 中可以看出,本次納入的高鹽研究地點在世界地圖上主要分布在亞歐大陸,在中國地圖集中在華北平原,少數(shù)分布在長江中下游平原和內(nèi)陸地區(qū)。

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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[3]小麥MYB轉(zhuǎn)錄因子的功能研究[D]. 張立超.中國農(nóng)業(yè)科學院 2013
[4]滲透脅迫下水稻體內(nèi)多胺代謝及其生理功能研究[D]. 周小梅.湖南農(nóng)業(yè)大學 2008

碩士論文
[1]玉米抗旱相關(guān)基因ZmMYB48你的功能分析[D]. 王彥.安徽農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]耐鹽堿基因OsMYB56轉(zhuǎn)化水稻的初步研究[D]. 王曉雪.吉林農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]轉(zhuǎn)CBF3基因茄子后代植株抗寒性與分子檢測研究[D]. 蔡霞.西南大學 2015
[4]玉米蔗糖代謝關(guān)鍵基因灌漿期動態(tài)表達及其調(diào)控的初步研究[D]. 任曉東.四川農(nóng)業(yè)大學 2014
[5]玉米細胞壁轉(zhuǎn)化酶基因Incw2在玉米籽粒中的過量表達[D]. 李淑君.四川農(nóng)業(yè)大學 2011
[6]玉米酸轉(zhuǎn)化酶基因(ivr2)的耐旱性關(guān)聯(lián)分析及自交系耐旱性分析[D]. 李亮.新疆農(nóng)業(yè)大學 2010
[7]我國常用玉米自交系耐旱性鑒定、評價與改良研究[D]. 李爭光.石河子大學 2010



本文編號:3224942

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