鹽堿脅迫是世界范圍內(nèi)限制糧食生產(chǎn)的主要環(huán)境因素之一。水稻作為世界上最重要的糧食作物之一,其種植面積是國家糧食安全的重要保證。但由于鹽堿土壤的不斷惡化,耕地面積的逐年減少,水稻的生長和產(chǎn)量已經(jīng)受到了嚴(yán)重的影響。因此,研究水稻的耐鹽堿性、培育耐鹽堿水稻品種對(duì)提高鹽堿土地的利用率、確保我國水稻穩(wěn)定生產(chǎn)都具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。鹽堿土壤中,以NaHC03和Na2C03為主要成分的堿性鹽脅迫（簡稱堿脅迫）對(duì)植物造成的傷害要比以NaCl和Na2S04為主要成分的中性鹽脅迫（簡稱鹽脅迫）更加嚴(yán)重。目前為止,關(guān)于水稻耐堿性基因的挖掘與利用明顯落后于鹽脅迫研究,且多數(shù)研究還處于QTL初定位階段。本研究對(duì)295個(gè)粳稻品種組成的自然群體進(jìn)行了平均測序深度為14.62×的重測序基因分型,在最小等位基因頻率（MAF）≥5%和缺失率（Missing data）20%的前提下,共計(jì)獲得了 788,396個(gè)高質(zhì)量的群體SNP。利用全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法,對(duì)苗期的堿害級(jí)別、地上部Na+濃度、地上部K+濃度、地上部Na+/K+、根部Na+濃度、根部K+濃度、根部Na+/K+、相對(duì)地上部鮮重、相對(duì)地上部干重、相對(duì)根部鮮重、相對(duì)... 

【文章來源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：126 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１－３技術(shù)路線圖??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ??１７??

圖３－ｌｂ耐堿相關(guān)性狀在粳稻群體中的頻率分布??Ｆｉｇｕｒｅ?３－ｌｂ?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?

群體ＳＮＰ?ｃａｌｌｉｎｇ總計(jì)獲得３４３．８萬個(gè)非冗佘ＳＮＰ。以最小等位基因頻率（ＭＩＦ）?２?５％，??缺失率（ｍｉｓｓｉｎｇｄａｔａ）?￡?２０％為標(biāo)準(zhǔn)過濾后，總計(jì)獲得了?７８８，３９６個(gè)高質(zhì)量ＳＮＰ標(biāo)記用于后??續(xù)分析。這些標(biāo)記可以比較均勻的覆蓋在水稻１２條染色體上（圖３－２）。其中，第６染色體??上分布的ＳＮＰ標(biāo)記數(shù)最多（９６，３７７個(gè)），平均每Ｍｂ范圍內(nèi)有３，１０９個(gè)ＳＮＰ標(biāo)記。第３號(hào)染??色體分布的標(biāo)記數(shù)最少（３９，４５４個(gè)），平均每Ｍｂ范圍內(nèi)有ｌ，０６６?個(gè)ＳＮＰ標(biāo)記（表３－３）。??５Ｍｂ?１?熱ｆｔ）?１４Ｍｂ?１９Ｍｂ?２４Ｍｂ?２９Ｍｂ?３４Ｍｔ＞?３８Ｍｂ?４３Ｍｂ??加■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■??加―——＾——??⑶?ｌＢ８ＢｉＢＢｉＢＢｉｉｉＢＢＩＩｉＢｉＢＢｉｉＢＢｉｉｉｉＢＢＩＭＩｉｌｌ?＿９２４??－?＿?Ｍｌｍ??ｃｆｓ，°?（４６２０??Ｅｌ?ＩＳＴｓ??．．ｒ－?＾?：＜?＇－ｈｍ?＊：７３９２??圖３－２本研究所用ＳＮＰ在染色體上的分布??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｔｈｅ?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＳＮＰｓ?ｕｓｅｄ?ｆｏｒ?ＧＷＡＳ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??３３??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3213749