水稻糖分含量全基組關聯(lián)分析及同化物合成相關性狀QTLs驗證
發(fā)布時間:2021-05-27 07:00
水稻產(chǎn)量的形成是源器官產(chǎn)生的同化物輸送到庫器官中固定下來的結(jié)果。籽粒發(fā)育的物質(zhì)來源主要有兩個:抽穗前水稻植株中儲藏的非結(jié)構(gòu)性碳水化合物(NSC)和抽穗后冠層葉片光合作用產(chǎn)生的同化物。為了深入了解NSC各組分在水稻體內(nèi)的含量差異及它們對產(chǎn)量形成的影響,本研究利用533份核心種質(zhì)對水稻糖分含量進行系統(tǒng)考察并對表型數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析(GWAS)。此外,葉片葉綠素含量及劍葉長寬影響同化物合成,基于之前本課題組對核心種質(zhì)劍葉長寬及葉片葉綠素含量GWAS得到的顯著性位點,我們利用回交群體對這些顯著性位點進行了驗證。結(jié)果如下:1.對核心種質(zhì)不同亞群間糖分含量進行差異顯著性分析。結(jié)果表明,糖分含量不同程度受到群體結(jié)構(gòu)的影響,葡萄糖、果糖和淀粉受到的影響小,蔗糖受到影響大,由于可溶性糖主要由蔗糖組成,故在亞群間變化也較大。與抽穗期相比,成熟期所有亞群中可溶性糖與淀粉含量均出現(xiàn)下降,秈稻莖中可溶性糖含量下降比粳稻莖中多,主要體現(xiàn)為蔗糖含量下降。2.對核心種質(zhì)抽穗期和成熟期糖分含量進行相關性分析。大部分糖分之間有顯著(P<0.05)或極顯著(P<0.01)關系。在抽穗期同一糖分不同組織間存...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 水稻糖分含量全基組關聯(lián)分析
1 前言
1.1 水稻源庫理論
1.1.1 水稻源庫理論中“源”、“庫”、“流”的概念
1.1.2 源庫理論在水稻中的應用
1.2 水稻糖分積累的意義
1.3 水稻蔗糖和淀粉積累的相關酶
1.3.1 蔗糖磷酸合成酶
1.3.2 蔗糖合成酶
1.3.3 ADPG焦磷酸化酶
1.3.4 淀粉合成酶
1.3.5 淀粉分支酶
1.4 關聯(lián)分析
1.4.1 關聯(lián)分析的基礎
1.4.2 全基因組關聯(lián)在水稻中的應用
1.5 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 材料種植
2.2.2 糖分抽提與含量測定
2.2.3 產(chǎn)量性狀考察
2.2.4 GWAS分析
3 結(jié)果與分析
3.1 亞群間抽穗期與成熟期糖分含量差異分析
3.2 核心種質(zhì)糖分含量及產(chǎn)量性狀相關性分析
3.2.1 核心種質(zhì)不同時期不同組織糖分含量數(shù)據(jù)相關性分析
3.2.2 核心種質(zhì)糖分與產(chǎn)量的相關性分析
3.3 GWAS檢測糖分及蔗糖轉(zhuǎn)運相關性狀顯著性位點
3.4 GWAS檢測到的顯著性位點與已克隆基因SSSII-2 間的關系
3.5 淀粉合成酶基因SSSII-2 多樣性分析
4 討論
4.1 核心種質(zhì)糖分含量在群體中的遺傳變異
4.2 水稻核心種質(zhì)各種糖分含量及變化對產(chǎn)量的影響
4.3 SSSII-2基因單倍型與亞群結(jié)構(gòu)的關系
4.4 SSSII-2與抽穗期和成熟期不同組織淀粉含量的關系
4.5 GWAS檢測到的顯著性位點與其它基因
第二章 同化物合成相關性狀QTLs驗證
1 前言
1.1 水稻同化物合成相關性狀研究現(xiàn)狀
1.1.1 水稻葉綠素含量的研究
1.1.2 水稻劍葉長寬的研究
1.2 QTL的定位分析
1.2.1 QTL分析原理和步驟
1.2.2 QIL定位方法
1.3 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗材料種植
2.3 性狀考察
2.4 分子標記QTL分析
2.4.1 DNA提取和PCR擴增
2.4.2 電泳檢測
2.4.3 數(shù)據(jù)處理與分析
3 結(jié)果與分析
3.1 SPAD、SPAD-FL和劍葉長寬在群體中分布
3.2 SPAD、SPAD-FL和劍葉長寬QTL驗證
4 討論
4.1 SPAD與SPAD-FL的比較
4.2 全基因組關聯(lián)分析與分子標記連鎖的QTL定位
4.3 水稻劍葉長寬及SPAD值與產(chǎn)量關系
參考文獻
附錄
附A 水稻可溶性糖與淀粉抽提與含量測定
附B 聚丙烯酰胺(PAGE)制作流程
致謝
本文編號:3207130
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 水稻糖分含量全基組關聯(lián)分析
1 前言
1.1 水稻源庫理論
1.1.1 水稻源庫理論中“源”、“庫”、“流”的概念
1.1.2 源庫理論在水稻中的應用
1.2 水稻糖分積累的意義
1.3 水稻蔗糖和淀粉積累的相關酶
1.3.1 蔗糖磷酸合成酶
1.3.2 蔗糖合成酶
1.3.3 ADPG焦磷酸化酶
1.3.4 淀粉合成酶
1.3.5 淀粉分支酶
1.4 關聯(lián)分析
1.4.1 關聯(lián)分析的基礎
1.4.2 全基因組關聯(lián)在水稻中的應用
1.5 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 材料種植
2.2.2 糖分抽提與含量測定
2.2.3 產(chǎn)量性狀考察
2.2.4 GWAS分析
3 結(jié)果與分析
3.1 亞群間抽穗期與成熟期糖分含量差異分析
3.2 核心種質(zhì)糖分含量及產(chǎn)量性狀相關性分析
3.2.1 核心種質(zhì)不同時期不同組織糖分含量數(shù)據(jù)相關性分析
3.2.2 核心種質(zhì)糖分與產(chǎn)量的相關性分析
3.3 GWAS檢測糖分及蔗糖轉(zhuǎn)運相關性狀顯著性位點
3.4 GWAS檢測到的顯著性位點與已克隆基因SSSII-2 間的關系
3.5 淀粉合成酶基因SSSII-2 多樣性分析
4 討論
4.1 核心種質(zhì)糖分含量在群體中的遺傳變異
4.2 水稻核心種質(zhì)各種糖分含量及變化對產(chǎn)量的影響
4.3 SSSII-2基因單倍型與亞群結(jié)構(gòu)的關系
4.4 SSSII-2與抽穗期和成熟期不同組織淀粉含量的關系
4.5 GWAS檢測到的顯著性位點與其它基因
第二章 同化物合成相關性狀QTLs驗證
1 前言
1.1 水稻同化物合成相關性狀研究現(xiàn)狀
1.1.1 水稻葉綠素含量的研究
1.1.2 水稻劍葉長寬的研究
1.2 QTL的定位分析
1.2.1 QTL分析原理和步驟
1.2.2 QIL定位方法
1.3 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗材料種植
2.3 性狀考察
2.4 分子標記QTL分析
2.4.1 DNA提取和PCR擴增
2.4.2 電泳檢測
2.4.3 數(shù)據(jù)處理與分析
3 結(jié)果與分析
3.1 SPAD、SPAD-FL和劍葉長寬在群體中分布
3.2 SPAD、SPAD-FL和劍葉長寬QTL驗證
4 討論
4.1 SPAD與SPAD-FL的比較
4.2 全基因組關聯(lián)分析與分子標記連鎖的QTL定位
4.3 水稻劍葉長寬及SPAD值與產(chǎn)量關系
參考文獻
附錄
附A 水稻可溶性糖與淀粉抽提與含量測定
附B 聚丙烯酰胺(PAGE)制作流程
致謝
本文編號:3207130
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