玉米CRK基因家族的鑒定及ZmCRK27的功能探究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-24 17:06
富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶CRK(Cysteine-rich receptor-like protein kinases,CRK)是植物最大的類受體蛋白激酶RLK(Receptor-like protein kinase,RLK)家族之一。目前關(guān)于CRK家族基因的功能研究在擬南芥中報(bào)道較多,集中在脅迫應(yīng)答和調(diào)控生長(zhǎng)發(fā)育等方面,但CRK家族在玉米中的生物學(xué)功能至今未知。玉米是我國(guó)第一大農(nóng)作物,高溫、干旱、鹽堿均會(huì)對(duì)其產(chǎn)量產(chǎn)生影響。因此解析ZmCRKs是否也參與植物的脅迫應(yīng)答網(wǎng)絡(luò)、調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育,對(duì)玉米生產(chǎn)具有重要意義。本文對(duì)玉米CRK家族成員進(jìn)行鑒定和分析,并系統(tǒng)地研究ZmCRK27在非生物脅迫應(yīng)答和生長(zhǎng)發(fā)育中的功能。獲得的主要研究結(jié)果如下:1.利用隱馬爾科夫模型,鑒定出34個(gè)ZmCRK基因。2.系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析發(fā)現(xiàn)玉米、水稻、擬南芥CRK基因可分為4類。玉米CRK與水稻遺傳距離較近,與擬南芥遺傳距離較遠(yuǎn)。3.染色體定位及共線性分析顯示大部分玉米CRK基因由串聯(lián)重復(fù)產(chǎn)生。4.表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn)玉米CRK家族成員有18個(gè)基因?yàn)楦弑磉_(dá)基因,主要在節(jié)間、幼穗、發(fā)育中的胚、胚乳、葉片以及根等組織高...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1 研究問題的由來(lái)
2 文獻(xiàn)綜述
2.1 植物類受體蛋白激酶
2.2 富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶
2.3 ABA信號(hào)通路
2.4 eQTL
2.5 QTL定位
2.6 串聯(lián)重復(fù)基因
3 本研究的意義和目的
第二章 玉米CRK家族的鑒定及分析
1 生信分析方法
1.1 基因鑒定
1.2 進(jìn)化樹構(gòu)建
1.3 蛋白結(jié)構(gòu)和生理生化特性分析
1.4 染色體定位及共線性
1.5 表達(dá)模式分析
1.6 農(nóng)藝性狀候選基因關(guān)聯(lián)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ZmCRKs鑒定及系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 ZmCRKs家族編碼的蛋白分子結(jié)構(gòu)和生理生化特征
2.3 ZmCRKs的染色體定位和共線性分析
2.4 ZmCRKs的表達(dá)分析
2.5 ZmCRKs農(nóng)藝性狀候選基因關(guān)聯(lián)分析
3 討論
第三章 玉米ZmCRK27的功能、自然變異探究
1 材料
1.1 植物材料
1.2 菌株及質(zhì)粒載體
2 方法
2.1 基因與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.2 eQTL分析方法
2.3 常用培養(yǎng)基配制方法
2.4 質(zhì)粒抽提
2.5 凝膠回收
2.6 植物RNA的提取
2.7 植物DNA的提取
2.8 熱激質(zhì)粒轉(zhuǎn)化法
2.9 電激質(zhì)粒轉(zhuǎn)化法
2.10 CRK27蛋白的亞細(xì)胞定位
2.10.1 植物材料
2.10.2 亞細(xì)胞定位載體的構(gòu)建
2.10.3 原生質(zhì)體的分離、培養(yǎng)、檢測(cè)
2.11 超表達(dá)擬南芥材料
2.11.1 載體構(gòu)建
2.11.2 擬南芥的種植
2.11.3 擬南芥的轉(zhuǎn)化
2.11.4 陽(yáng)性純合子篩選
2.12 ABA處理擬南芥種子統(tǒng)計(jì)發(fā)芽率
2.13 鹽處理擬南芥種子統(tǒng)計(jì)發(fā)芽率
2.14 自然變異基因型鑒定及分析
2.15 RIL群體農(nóng)藝性狀鑒定
2.16 玉米遺傳材料的構(gòu)建
2.17 常用儀器及試劑
2.18 本研究所用引物
3 結(jié)果與分析
3.1 ZmCRK27的啟動(dòng)子變異
3.2 TE插入影響ZmCRK27的表達(dá)量及農(nóng)藝性狀
3.3 ZmCRK27基因與蛋白結(jié)構(gòu)
3.4 ZmCRK27的亞細(xì)胞定位
3.5 超表達(dá)擬南芥材料的鑒定
3.6 ZmCRK27影響ABA處理下擬南芥種子的發(fā)芽率
3.7 ZmCRK27影響NaCl處理下擬南芥種子的發(fā)芽率
3.8 玉米遺傳材料的鑒定
4 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號(hào):3204545
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1 研究問題的由來(lái)
2 文獻(xiàn)綜述
2.1 植物類受體蛋白激酶
2.2 富含半胱氨酸的類受體蛋白激酶
2.3 ABA信號(hào)通路
2.4 eQTL
2.5 QTL定位
2.6 串聯(lián)重復(fù)基因
3 本研究的意義和目的
第二章 玉米CRK家族的鑒定及分析
1 生信分析方法
1.1 基因鑒定
1.2 進(jìn)化樹構(gòu)建
1.3 蛋白結(jié)構(gòu)和生理生化特性分析
1.4 染色體定位及共線性
1.5 表達(dá)模式分析
1.6 農(nóng)藝性狀候選基因關(guān)聯(lián)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ZmCRKs鑒定及系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 ZmCRKs家族編碼的蛋白分子結(jié)構(gòu)和生理生化特征
2.3 ZmCRKs的染色體定位和共線性分析
2.4 ZmCRKs的表達(dá)分析
2.5 ZmCRKs農(nóng)藝性狀候選基因關(guān)聯(lián)分析
3 討論
第三章 玉米ZmCRK27的功能、自然變異探究
1 材料
1.1 植物材料
1.2 菌株及質(zhì)粒載體
2 方法
2.1 基因與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.2 eQTL分析方法
2.3 常用培養(yǎng)基配制方法
2.4 質(zhì)粒抽提
2.5 凝膠回收
2.6 植物RNA的提取
2.7 植物DNA的提取
2.8 熱激質(zhì)粒轉(zhuǎn)化法
2.9 電激質(zhì)粒轉(zhuǎn)化法
2.10 CRK27蛋白的亞細(xì)胞定位
2.10.1 植物材料
2.10.2 亞細(xì)胞定位載體的構(gòu)建
2.10.3 原生質(zhì)體的分離、培養(yǎng)、檢測(cè)
2.11 超表達(dá)擬南芥材料
2.11.1 載體構(gòu)建
2.11.2 擬南芥的種植
2.11.3 擬南芥的轉(zhuǎn)化
2.11.4 陽(yáng)性純合子篩選
2.12 ABA處理擬南芥種子統(tǒng)計(jì)發(fā)芽率
2.13 鹽處理擬南芥種子統(tǒng)計(jì)發(fā)芽率
2.14 自然變異基因型鑒定及分析
2.15 RIL群體農(nóng)藝性狀鑒定
2.16 玉米遺傳材料的構(gòu)建
2.17 常用儀器及試劑
2.18 本研究所用引物
3 結(jié)果與分析
3.1 ZmCRK27的啟動(dòng)子變異
3.2 TE插入影響ZmCRK27的表達(dá)量及農(nóng)藝性狀
3.3 ZmCRK27基因與蛋白結(jié)構(gòu)
3.4 ZmCRK27的亞細(xì)胞定位
3.5 超表達(dá)擬南芥材料的鑒定
3.6 ZmCRK27影響ABA處理下擬南芥種子的發(fā)芽率
3.7 ZmCRK27影響NaCl處理下擬南芥種子的發(fā)芽率
3.8 玉米遺傳材料的鑒定
4 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號(hào):3204545
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