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陸地棉×毛棉種間高密度遺傳圖譜構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2021-05-18 11:04
  棉花是重要的天然纖維作物,同時(shí)也是重要的植物蛋白和油料來(lái)源。隨著全球?qū)徔椘沸枨蟮脑黾?提高纖維產(chǎn)量和纖維品質(zhì)一直是棉花育種者關(guān)注的焦點(diǎn)。陸地棉具備高產(chǎn)、強(qiáng)適應(yīng)性的特點(diǎn),在全世界各地都有種植,但陸地棉遺傳基礎(chǔ)比較狹窄,限制了棉花產(chǎn)量、品質(zhì)改良的進(jìn)展。毛棉具有耐旱、抗鹽堿等陸地棉不具有的特性,陸地棉與毛棉間的雜交可產(chǎn)生可育后代。構(gòu)建陸地棉和野生棉種毛棉種間高密度遺傳圖譜,對(duì)毛棉優(yōu)良性狀QTL有利等位基因的挖掘和陸地棉分子標(biāo)記輔助選擇育種(marker assisted selection,MAS)具有重要意義。本研究對(duì)實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的陸地棉與毛棉BC1群體遺傳連鎖圖譜進(jìn)行標(biāo)記加密,并比較分析了棉花基因組染色體結(jié)構(gòu)變異。主要結(jié)果如下:1.引物多態(tài)性篩選用21426對(duì)SSR引物對(duì)兩親本陸地棉CCRI 35和P0601211進(jìn)行多態(tài)性篩選,最終共獲得962對(duì)多態(tài)性SSR引物,多態(tài)性比例為4.90%。2.遺傳連鎖圖譜加密與偏分離檢測(cè)用篩選出來(lái)的多態(tài)性引物對(duì)92個(gè)BC1單株進(jìn)行群體標(biāo)記基因型檢測(cè),加密后的遺傳圖譜包含1915個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),圖譜總長(zhǎng)度為406... 

【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 棉屬的起源及分類(lèi)研究
        1.1.1 棉屬的起源
        1.1.2 棉屬的分類(lèi)
        1.1.3 四倍體棉種的分布與分化
    1.2 遺傳標(biāo)記的發(fā)展
        1.2.1 分子標(biāo)記的發(fā)展簡(jiǎn)史
        1.2.2 DNA分子標(biāo)記在作物育種的應(yīng)用
    1.3 棉花遺傳圖譜的構(gòu)建
        1.3.1 作圖群體
        1.3.2 棉花種間遺傳圖譜的研究進(jìn)展
        1.3.3 棉花種內(nèi)遺傳圖譜的研究進(jìn)展
    1.4 棉花物理圖譜的研究進(jìn)展
    1.5 棉花染色體結(jié)構(gòu)變異
    1.6 毛棉的特征和研究
第2章 引言
    2.1 研究目的與意義
    2.2 技術(shù)路線(xiàn)
第3章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
    3.2 棉花基因組DNA的提取
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)主要儀器
        3.2.2 主要試劑配制
        3.2.3 DNA的提取步驟
    3.3 引物的來(lái)源以及PCR擴(kuò)增反應(yīng)
        3.3.1 引物的來(lái)源
        3.3.2 PCR擴(kuò)增
        3.3.3 PCR反應(yīng)程序
    3.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳
        3.4.1 試劑配制
        3.4.2 電泳
    3.5 陸地棉與毛棉種間遺傳圖譜的構(gòu)建
        3.5.1 SSR引物多態(tài)性篩選及作圖群體基因型檢測(cè)
        3.5.2 圖譜構(gòu)建
    3.6 偏分離檢測(cè)
    3.7 共線(xiàn)性分析
        3.7.1 陸、海遺傳圖譜與陸、毛遺傳圖譜線(xiàn)性關(guān)系
        3.7.2 遺傳圖譜與陸地棉、雷蒙德氏棉和亞洲棉基因組物理圖譜共線(xiàn)性分析
第4章 結(jié)果與分析
    4.1 親本引物多態(tài)性篩選及分析
    4.2 BC_1 群體基因型檢測(cè)
    4.3 遺傳圖譜標(biāo)記加密
    4.4 標(biāo)記位點(diǎn)偏分離檢測(cè)
    4.5 不同遺傳圖譜之間的共線(xiàn)性分析
    4.6 遺傳圖譜與物理圖譜間共線(xiàn)性分析
第5章 討論
    5.1 親本間標(biāo)記多態(tài)性分析
    5.2 遺傳圖譜的加密
    5.3 標(biāo)記偏分離現(xiàn)象
    5.4 不同遺傳圖譜間的共線(xiàn)性關(guān)系
    5.5 遺傳圖譜與不同物理圖譜間的線(xiàn)性分析
第6章 結(jié)論
    6.1 陸地棉和毛棉BC1 群體種間遺傳圖譜加密
    6.2 遺傳圖譜間的線(xiàn)性關(guān)系
    6.3 遺傳圖譜與物理圖譜間的線(xiàn)性關(guān)系
參考文獻(xiàn)
已發(fā)表論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棉花種質(zhì)資源收集鑒定與創(chuàng)新利用[J]. 杜雄明,劉方,王坤波,賈銀華,周忠麗,何守樸,龔文芳,潘兆娥,王立如,耿曉麗,龐保印.  棉花學(xué)報(bào). 2017(S1)
[2]陸地棉主要產(chǎn)量相關(guān)性狀的SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 王娟,董承光,劉麗,孔憲輝,王旭文,余渝.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]近5年毛棉考察總結(jié)[J]. 王坤波,劉方,周忠麗,王星星,王春英,黎紹惠.  中國(guó)棉花. 2016(06)
[4]偏分離群體連鎖圖矯正和QTL定位軟件包DistortedMap的研制[J]. 謝尚潛,耿青春,章元明.  南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]棉花資源收集、保存、評(píng)價(jià)與利用現(xiàn)狀及未來(lái)[J]. 杜雄明,孫君靈,周忠麗,賈銀華,潘兆娥,何守樸,龐保印,王立如.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(02)
[6]夏威夷毛棉考察簡(jiǎn)報(bào)[J]. 王坤波,文學(xué),黎紹惠,朱蕓.  中國(guó)棉花. 2011(12)
[7]中國(guó)棉花生產(chǎn)與政策60年[J]. 馬淑萍,王戈,龍熹.  中國(guó)棉花. 2009(09)
[8]中國(guó)棉花生產(chǎn)中存在的主要問(wèn)題及建議[J]. 王延琴,楊偉華,許紅霞,周大云,馮新愛(ài),匡猛.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2009(14)
[9]利用高代回交和分子標(biāo)記輔助選擇構(gòu)建棉花染色體片段代換系[J]. 楊澤茂,李駿智,李?lèi)?ài)國(guó),張保才,劉廣平,李俊文,石玉真,劉愛(ài)英,蔣建雄,王濤,袁有祿.  分子植物育種. 2009(02)
[10]作物QTL定位常用作圖群體[J]. 蔣洪蔚,劉春燕,高運(yùn)來(lái),李燦東,張聞博,胡國(guó)華,陳慶山.  生物技術(shù)通報(bào). 2008(S1)

博士論文
[1]陸地棉種內(nèi)雜交F2:3群體的耐鹽性、纖維品質(zhì)和產(chǎn)量性狀的QTL定位[D]. LATYR DIOUF.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]棉屬細(xì)胞質(zhì)基因組進(jìn)化及陸地植物基因水平轉(zhuǎn)移分析[D]. 陳志文.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]陸地棉種內(nèi)高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL定位[D]. 賈曉昀.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[4]陸地棉與海島棉、毛棉、達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜加密及線(xiàn)性關(guān)系比較[D]. 劉方.西南大學(xué) 2016
[5]不結(jié)球白菜抗蕪菁花葉病毒基因分子標(biāo)記與遺傳定位[D]. 王新華.上海交通大學(xué) 2010

碩士論文
[1]陸地棉與達(dá)爾文氏棉種間BC1群體遺傳圖譜構(gòu)建[D]. 劉瑞.西南大學(xué) 2017
[2]陸地棉×黃褐棉種間BC1群體遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 李曼.西南大學(xué) 2017
[3]陸海種間圖譜加密與染色體結(jié)構(gòu)變異分析[D]. 王文文.西南大學(xué) 2017
[4]海島棉抗枯萎病性的遺傳分析及遺傳連鎖圖譜加密[D]. 陳磊.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]陸地棉和毛棉種間SSR遺傳圖譜構(gòu)建及其茸毛和蜜腺基因的染色體定位[D]. 侯美英.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]加工番茄抗黃萎病基因的QTL定位及品種(系)遺傳多樣性分析[D]. 張超.石河子大學(xué) 2011
[7]四倍體棉種起源與演化的FISH研究[D]. 劉三宏.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2004



本文編號(hào):3193680

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