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小麥葉片順序和非順序衰老轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

發(fā)布時間:2021-05-07 16:59
  非順序衰老小麥是灌漿后期旗葉早于倒二葉衰老的一類小麥。而順序衰老小麥是按照葉片發(fā)育早晚的順序從下向上漸次衰老的一類小麥。與順序衰老小麥相比,非順序衰老小麥具有較高的產(chǎn)量和抗逆性。論文以順序衰老小麥(NR9405)和非順序衰老小麥(溫麥19)為材料,應(yīng)用數(shù)字基因表達譜技術(shù)對兩種衰老類型小麥旗葉在揚花后25d、30d和32d的基因表達量進行檢測,篩選花后25d和30d,30d和32d旗葉的差異表達基因,并對差異表達基因進行GO、KEGG富集分析和表達譜的加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析,從轉(zhuǎn)錄水平揭示小麥葉片順序和非順序衰老的形成機制及其在小麥生產(chǎn)中的應(yīng)用價值。主要取得如下結(jié)論:1.順序衰老小麥NR9405花后30d與25d相比,差異表達基因共計6659個,其中上調(diào)表達基因3404個,下調(diào)表達基因3255個;花后32d與30d相比,差異表達基因共計4058個,其中上調(diào)表達基因3017個,下調(diào)表達基因1041個。非順序衰老小麥溫麥19花后30d與25d相比,差異表達基因共計13609個,其中上調(diào)表達基因7454個,下調(diào)表達基因6155個;花后32d與30d相比,差異表達基因共計6321個,其中上調(diào)表達... 

【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1.1 選題背景,目的和意義
    1.2 植物葉片衰老
        1.2.1 植物葉片衰老的內(nèi)源因素
        1.2.2 植物葉片衰老的外源因素
        1.2.3 植物衰老基因
    1.3 順序型衰老小麥和非順序衰老小麥研究
    1.4 RNA-Seq技術(shù)
    1.5 基因功能注釋
    1.6 加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析
第二章 小麥葉片非順序和順序衰老數(shù)字基因表達譜分析
    2.1 植物材料
    2.2 數(shù)據(jù)分析
        2.2.1 測序數(shù)據(jù)處理及比較分析
        2.2.2 差異基因分析
        2.2.3 差異基因富集分析
        2.2.4 差異基因RT-q PCR驗證
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 測序結(jié)果評估
        2.3.2 差異基因的分析
        2.3.3 差異表達基因GO富集分析
        2.3.4 差異表達基因KEGG路徑富集分析
        2.3.5 差異表達基因的RT-q PCR驗證
    2.4 討論
第三章 非順序和順序衰老小麥加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    3.1 試驗材料
    3.2 試驗方法
        3.2.1 WGCNA構(gòu)建兩種衰老類型小麥在衰老過程中共表達網(wǎng)絡(luò)
        3.2.2 基因網(wǎng)絡(luò)模塊可視化及分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 兩種衰老類型小麥加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        3.3.2 順序衰老小麥的核心基因
        3.3.3 非順序衰老小麥核心基因的篩選
    3.4 討論
        3.4.1 小麥衰老與轉(zhuǎn)運相關(guān)基因的關(guān)系
        3.4.2 小麥衰老和光合作用相關(guān)基因的關(guān)系
        3.4.3 小麥衰老和其他相關(guān)基因的關(guān)系
第四章 結(jié)論和展望
    4.1 結(jié)論
    4.2 創(chuàng)新點
    4.3 展望
參考文獻
致謝
個人簡歷



本文編號:3173757

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