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玉米單倍體誘導(dǎo)效應(yīng)分析與機(jī)器學(xué)習(xí)在DH技術(shù)中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-04-14 14:36
  玉米單倍體技術(shù)目前已經(jīng)在生產(chǎn)上得到廣泛應(yīng)用,高效的誘導(dǎo)以及準(zhǔn)確快速的單倍體鑒別為規(guī)模化生產(chǎn)單倍體提供保障。目前關(guān)于單倍體誘導(dǎo)的研究主要集中在誘導(dǎo)系的父本效應(yīng),對(duì)于母本效應(yīng)知之甚少;此外如何系統(tǒng)的應(yīng)用單倍體技術(shù)實(shí)現(xiàn)工程化育種也是迫切需要解決的問(wèn)題。本研究從母本可誘導(dǎo)性的QTL定位闡述單倍體誘導(dǎo)的母本效應(yīng)。利用B73背景的染色體片段代換系分析誘導(dǎo)率QTL qhir8的效應(yīng)。通過(guò)遺傳距離分析父母本互作與誘導(dǎo)率的關(guān)系。同時(shí)探討機(jī)器學(xué)習(xí)在單倍體鑒別、自然加倍預(yù)測(cè)以及DH系選擇中的應(yīng)用。這些研究將為單倍體技術(shù)的工程化奠定理論基礎(chǔ)。本研究主要內(nèi)容如下:1.利用齊319和昌7-2的F1衍生出包含135個(gè)家系的DH群體。在北京、濟(jì)南、石家莊、三亞四個(gè)地點(diǎn)種植DH群體,利用誘導(dǎo)系CHO13進(jìn)行誘導(dǎo)并統(tǒng)計(jì)誘導(dǎo)率。結(jié)合DH群體的6KSNP芯片數(shù)據(jù)構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜,對(duì)控制母本可誘導(dǎo)性的QTL進(jìn)行定位。四個(gè)環(huán)境下共檢測(cè)到13個(gè)QTL,其中三亞和石家莊兩個(gè)環(huán)境下的QTL效應(yīng)值較高,表型貢獻(xiàn)率分別為22.14%和17.44%。這兩個(gè)主效QTL在其他環(huán)境也被檢測(cè),為后續(xù)的精細(xì)定位提供依據(jù)。2.利用B73背景的染色體片... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:117 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

玉米單倍體誘導(dǎo)效應(yīng)分析與機(jī)器學(xué)習(xí)在DH技術(shù)中的應(yīng)用


圖1-1在胚和胚乳顏色表達(dá)清晰度變異(引自Prasanna等,2012)??Fig.?1-1?Variation?in?Rl-?nj?expression?on?the?embryo?and?endospemi?(cited?from?Prasanna?et?al,?2012)??為了突破顏色抑制基因?qū)伪扼w鑒別的限制,陳紹江和宋同明等(2003)根據(jù)花粉直感效應(yīng)??

種子結(jié)實(shí),數(shù)據(jù)校正,多環(huán),母本


2.3.2表型數(shù)據(jù)校正??采用R中的lme4包擬合混合線(xiàn)性分析模型對(duì)DH群體的母本可誘導(dǎo)性進(jìn)行多環(huán)境下的BLUP??結(jié)果如圖2-3A所示。??A??—?-??§1?1?。-?/??f?[?1?^?/??g?「?^?y/??「?1??O?」?J?1?1?■????.…1?*"?.??1

柱狀圖,多環(huán),柱狀圖,殘差


?150?200??圖2-2?DH〇種子結(jié)實(shí)數(shù)分布??Fig.?2-2?Seedset?distribution?of?DH〇?lines??2.3.2表型數(shù)據(jù)校正??采用R中的lme4包擬合混合線(xiàn)性分析模型對(duì)DH群體的母本可誘導(dǎo)性進(jìn)行多環(huán)境下的BLUP??結(jié)果如圖2-3A所示。??A??—?-??§1?1?。-?/??f?[?1?^?/??g?「?^?y/??「?1??O?」?J?1?1?■????.…1?*"?.??1

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于近紅外光譜的果蔬脆片品質(zhì)評(píng)價(jià)方法研究[J]. 劉靜,杜廣全,管驍.  分析科學(xué)學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]玉米單倍體雄穗自然加倍性輪選遺傳修復(fù)與高加倍率材料的創(chuàng)制[J]. 才卓,徐國(guó)良,任軍,代玉仙,于明艷,李淑華,劉小丹,郭琦,王麗娜,張銘堂.  玉米科學(xué). 2016(04)
[3]Genetic dissection of maize seedling root system architecture traits using an ultra-high density bin-map and a recombinant inbred line population[J]. Weibin Song,Baobao Wang,Andrew L Hauck,Xiaomei Dong,Jieping Li,Jinsheng Lai.  Journal of Integrative Plant Biology. 2016(03)
[4]基于近紅外漫反射與漫透射光譜的玉米單倍體鑒別比較研究(英文)[J]. 覃鴻,馬競(jìng)一,陳紹江,嚴(yán)衍祿,李衛(wèi)軍,王平,劉金.  光譜學(xué)與光譜分析. 2016(01)
[5]玉米單倍體自然二倍化研究[J]. 吳鵬昊,任姣姣,田小龍,王樂(lè)樂(lè),李國(guó)梁,劉文欣,陳紹江.  中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]基于機(jī)器視覺(jué)的玉米單倍體自動(dòng)分選系統(tǒng)[J]. 李衛(wèi)軍,劉玉梅,陳紹江,覃鴻,劉金,田震.  農(nóng)機(jī)化研究. 2016(01)
[7]應(yīng)用近紅外反射和透射光譜法鑒定玉米雜交種的純度[J]. 李天昕,賈仕強(qiáng),劉旭,趙盛毅,冉航,嚴(yán)衍祿,安冬.  光譜學(xué)與光譜分析. 2015(12)
[8]基于可見(jiàn)光光譜高效鑒別玉米單倍體籽粒(英文)[J]. 劉金,郭婷婷,李浩川,賈仕強(qiáng),嚴(yán)衍祿,安冬,張垚,陳紹江.  光譜學(xué)與光譜分析. 2015(11)
[9]玉米單倍體誘導(dǎo)系對(duì)不同母本資源誘導(dǎo)效果的比較[J]. 蘇娟娟,景希強(qiáng).  玉米科學(xué). 2015(02)
[10]玉米自交系單倍體誘導(dǎo)率的研究[J]. 劉麗,于麗娟,畢亞琪,張培高.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2014(05)

博士論文
[1]玉米單倍體自動(dòng)化鑒別與新型誘導(dǎo)系選育研究[D]. 劉金.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]玉米單倍體誘導(dǎo)基因qhir1精細(xì)定位與新型誘導(dǎo)系選育研究[D]. 董昕.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]結(jié)合大重組自交系群體和超高密度分子標(biāo)記進(jìn)行玉米重要農(nóng)藝性狀的QTL定位[D]. 王寶寶.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014

碩士論文
[1]基于機(jī)器學(xué)習(xí)的分類(lèi)算法研究[D]. 裴松年.中北大學(xué) 2016
[2]面向近紅外光譜藥品鑒別的高效機(jī)器學(xué)習(xí)算法研究[D]. 蔣淑潔.桂林電子科技大學(xué) 2015



本文編號(hào):3137494

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