發(fā)布時間：2021-04-14 04:32

　　【目的】對107個云南玉米自交系進行遺傳多樣性和群體遺傳結構分析,為云南省玉米種質創(chuàng)新、遺傳改良、品種管理等提供理論依據(jù),也為今后深入挖掘優(yōu)良性狀相關基因打下基礎。【方法】以云南當?shù)赝茝V的107個優(yōu)良玉米自交系為供試材料,以45個我國常用玉米骨干自交系作為雜種優(yōu)勢群劃分的參照,在Axiom^?Maize56K SNP Array平臺上利用玉米SNP芯片（56K）進行玉米全基因組掃描,并使用Treebest的NJ-tree模型構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹,利用GCTA（全基因組復雜性狀分析）工具進行主成分分析,揭示其遺傳多樣性與群體遺傳結構�！窘Y果】從107個云南玉米自交系中檢出5533個均勻分布的高質量SNP分子標記位點�；谶@些SNP分子標記位點分析結果可知,107個云南玉米自交系的Nei’s基因多樣性指數(shù)（H）為0.2981～0.5000,平均為0.4832;多態(tài)信息含量（PIC）為0.2536～0.3750,平均為0.3662;最小等位基因頻率為0.5000～0.8178,平均為0.5744。群體遺傳結構分析結果顯示,K=6時△K最大即供試自交系可劃分為六大類群,分別為... 

【文章來源】：南方農(nóng)業(yè)學報. 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

107個云南玉米自交系的群體遺傳結構分析結果

△K的變化曲線

基于個體基因型SNP，使用主成分分析方法將不同基因型品種聚類成不同亞群，以明確107個云南玉米自交系的遺傳結構。主成分分析圖的前三個維度能解釋所有材料變異情況，也是遺傳變異最多的3個維度（Yang et al.,2011）。本研究分別將維度1v2、1v3和2v3提取出來制成二維圖，結果發(fā)現(xiàn)PCA1v2最能代表所有材料的遺傳變異，PCA1v3和PCA2v3次之。由圖4可知，107個云南玉米自交系與45個我國常用玉米骨干自交系能明顯區(qū)分，大部分云南玉米自交系集中在我國常用玉米骨干自交系附近，但有少數(shù)云南玉米自交系與我國常用玉米骨干自交系距離較遠，其中，與歐洲母本血緣、歐洲父本血緣1和歐洲父本血緣2等3個雜種優(yōu)勢群距離相對較近的自交系極少，還有部分自交系與10個雜種優(yōu)勢群距離均較遠，未與我國常用玉米骨干自交系歸為一類，與群體遺傳結構和系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析結果相似。3 討論

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3136665