【目的】對107個(gè)云南玉米自交系進(jìn)行遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析,為云南省玉米種質(zhì)創(chuàng)新、遺傳改良、品種管理等提供理論依據(jù),也為今后深入挖掘優(yōu)良性狀相關(guān)基因打下基礎(chǔ)。【方法】以云南當(dāng)?shù)赝茝V的107個(gè)優(yōu)良玉米自交系為供試材料,以45個(gè)我國常用玉米骨干自交系作為雜種優(yōu)勢群劃分的參照,在Axiom^?Maize56K SNP Array平臺上利用玉米SNP芯片（56K）進(jìn)行玉米全基因組掃描,并使用Treebest的NJ-tree模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,利用GCTA（全基因組復(fù)雜性狀分析）工具進(jìn)行主成分分析,揭示其遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)。【結(jié)果】從107個(gè)云南玉米自交系中檢出5533個(gè)均勻分布的高質(zhì)量SNP分子標(biāo)記位點(diǎn)�；谶@些SNP分子標(biāo)記位點(diǎn)分析結(jié)果可知,107個(gè)云南玉米自交系的Nei’s基因多樣性指數(shù)（H）為0.2981～0.5000,平均為0.4832;多態(tài)信息含量（PIC）為0.2536～0.3750,平均為0.3662;最小等位基因頻率為0.5000～0.8178,平均為0.5744。群體遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,K=6時(shí)△K最大即供試自交系可劃分為六大類群,分別為... 

【文章來源】：南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

107個(gè)云南玉米自交系的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果

△K的變化曲線

基于個(gè)體基因型SNP，使用主成分分析方法將不同基因型品種聚類成不同亞群，以明確107個(gè)云南玉米自交系的遺傳結(jié)構(gòu)。主成分分析圖的前三個(gè)維度能解釋所有材料變異情況，也是遺傳變異最多的3個(gè)維度（Yang et al.,2011）。本研究分別將維度1v2、1v3和2v3提取出來制成二維圖，結(jié)果發(fā)現(xiàn)PCA1v2最能代表所有材料的遺傳變異，PCA1v3和PCA2v3次之。由圖4可知，107個(gè)云南玉米自交系與45個(gè)我國常用玉米骨干自交系能明顯區(qū)分，大部分云南玉米自交系集中在我國常用玉米骨干自交系附近，但有少數(shù)云南玉米自交系與我國常用玉米骨干自交系距離較遠(yuǎn)，其中，與歐洲母本血緣、歐洲父本血緣1和歐洲父本血緣2等3個(gè)雜種優(yōu)勢群距離相對較近的自交系極少，還有部分自交系與10個(gè)雜種優(yōu)勢群距離均較遠(yuǎn)，未與我國常用玉米骨干自交系歸為一類，與群體遺傳結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分析結(jié)果相似。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
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