棉花染色體細胞學標記的開發(fā)及其著絲粒DNA序列的分析
發(fā)布時間:2021-03-12 04:29
棉花是世界上重要的纖維作物,同時也是研究植物多倍化演化的模式材料。由于四倍體陸地棉染色體數目多(2n=52)且染色體長度較短,缺乏明顯的表型區(qū)別,因此,難以開展染色體的識別與深入的核型分析。本研究通過篩選人工染色體BAC克隆,獲得了一套位于異源四倍體陸地棉26條染色體不同臂的特異BAC。在此基礎上,結合著絲粒特異的BAC 97G20和擬南芥端粒特異的序列標記,對陸地棉進行了染色體的精細識別。結果發(fā)現:最長染色體是A亞組的10號染色體,長度是3.51 μm(131.0Mb)占比是5.40%。最短的染色體是D亞組的4號染色體,長度是1.59μm(59.4Mb)占比是2.45%。除了A亞組的四號染色體比它同源的D亞組的染色體短,A亞組的染色體都長于D亞組相對應的同源染色體。同時,在棉屬的不同種間,使用陸地棉核型分析的BAC做探針,其結果顯示,這一套標記適用于棉屬不同種間的染色體核型分析。以上的這些實驗結果對陸地棉在染色體水平和棉花基因結構方面進行了詳細的分析,擴大了棉花基因組結構的認識,同時為植物細胞遺傳學的研究提供有力的工具。在大多數的真核植物中著絲粒染色質是由高度重復的著絲粒反轉錄轉座子...
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 棉屬的分類
2 陸地棉的特征
3 熒光原位雜交技術
3.1 熒光原位雜交技術簡介
3.2 熒光原位雜交的基本原理
3.3 原位雜交技術的發(fā)展
4 熒光原位雜交技術的應用
4.1 染色體作圖
4.2 比較染色體作圖
4.3 單拷貝基因比較染色體作圖
4.4 轉基因植物鑒定中的應用
4.5 植物重復序列的研究
5 植物著絲粒的研究進展
5.1 植物著絲粒的DNA序列
5.1.1 衛(wèi)星DNA序列
5.1.2 反轉錄轉座子
5.2 植物著絲粒特異組蛋白
5.3 植物著絲粒DNA序列的進化
6 本研究的目的和內容
6.1 目的和意義
6.2 主要研究內容
第二章 陸地棉染色體的細胞學研究
1 材料
2 方法
2.1 熒光原位雜交
2.1.1 靶染色體制備
2.1.2 探針的制備
2.1.3 原位雜交
2.2 信號檢測與圖像分析
2.3 棉花特異BAC的提取
3 結果與分析
3.1 陸地棉染色體臂特異BAC克隆的篩選
3.2 陸地棉的核型分析
3.2.1 使用陸地棉著絲粒特異的BAC序列和端粒序列進行分析
3.2.2 陸地棉染色體的測量
3.3 陸地棉近緣種間染色體長度的分析
3.3.1 陸地棉AD亞組染色體長度的比較
3.3.2 陸地棉A亞組的6號和8號染色體與其祖先染色體比較的研究
3.4 陸地棉45S rDNA和5S rDNA位點
3.5 陸地棉特異BACs在棉屬不同種適用性分析
4 討論
4.1 染色體BAC在測序中的應用
4.2 陸地棉AD亞組染色體測量長度不同的討論
4.3 陸地棉AD亞組染色體重復序列在非編碼區(qū)域的擴增
第三章 棉花著絲粒DNA序列的進化分析
1 材料
2 方法
2.1 棉花基因組DNA的提取
2.2 膠回收
2.3 染色質免疫共沉淀
3 結果與分析
3.1 雷蒙德氏棉著絲粒序列的挖掘與分析
3.1.1 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的挖掘
3.1.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的分析
3.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的fiber-FISH分析
3.3 雷蒙德氏棉著絲粒序列在棉屬間的演化模式
4 討論
4.1 陸地棉中呈擴大趨勢的反轉錄轉座子
4.2 關于Gr298,Gr359和Gr334序列的進一步推論
第四章 小結與展望
1 小結
2 展望
參考文獻
致謝
本文編號:3077681
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 棉屬的分類
2 陸地棉的特征
3 熒光原位雜交技術
3.1 熒光原位雜交技術簡介
3.2 熒光原位雜交的基本原理
3.3 原位雜交技術的發(fā)展
4 熒光原位雜交技術的應用
4.1 染色體作圖
4.2 比較染色體作圖
4.3 單拷貝基因比較染色體作圖
4.4 轉基因植物鑒定中的應用
4.5 植物重復序列的研究
5 植物著絲粒的研究進展
5.1 植物著絲粒的DNA序列
5.1.1 衛(wèi)星DNA序列
5.1.2 反轉錄轉座子
5.2 植物著絲粒特異組蛋白
5.3 植物著絲粒DNA序列的進化
6 本研究的目的和內容
6.1 目的和意義
6.2 主要研究內容
第二章 陸地棉染色體的細胞學研究
1 材料
2 方法
2.1 熒光原位雜交
2.1.1 靶染色體制備
2.1.2 探針的制備
2.1.3 原位雜交
2.2 信號檢測與圖像分析
2.3 棉花特異BAC的提取
3 結果與分析
3.1 陸地棉染色體臂特異BAC克隆的篩選
3.2 陸地棉的核型分析
3.2.1 使用陸地棉著絲粒特異的BAC序列和端粒序列進行分析
3.2.2 陸地棉染色體的測量
3.3 陸地棉近緣種間染色體長度的分析
3.3.1 陸地棉AD亞組染色體長度的比較
3.3.2 陸地棉A亞組的6號和8號染色體與其祖先染色體比較的研究
3.4 陸地棉45S rDNA和5S rDNA位點
3.5 陸地棉特異BACs在棉屬不同種適用性分析
4 討論
4.1 染色體BAC在測序中的應用
4.2 陸地棉AD亞組染色體測量長度不同的討論
4.3 陸地棉AD亞組染色體重復序列在非編碼區(qū)域的擴增
第三章 棉花著絲粒DNA序列的進化分析
1 材料
2 方法
2.1 棉花基因組DNA的提取
2.2 膠回收
2.3 染色質免疫共沉淀
3 結果與分析
3.1 雷蒙德氏棉著絲粒序列的挖掘與分析
3.1.1 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的挖掘
3.1.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的分析
3.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的fiber-FISH分析
3.3 雷蒙德氏棉著絲粒序列在棉屬間的演化模式
4 討論
4.1 陸地棉中呈擴大趨勢的反轉錄轉座子
4.2 關于Gr298,Gr359和Gr334序列的進一步推論
第四章 小結與展望
1 小結
2 展望
參考文獻
致謝
本文編號:3077681
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