世界上有超過一般的人口以水稻為主食,日益增長的人口以及日趨嚴峻的水稻生產(chǎn)環(huán)境給進一步提高水稻單產(chǎn)帶來挑戰(zhàn)。水稻單產(chǎn)由三要素構(gòu)成,包括單位面積有效穗數(shù)、每穗實粒數(shù)以及千粒重,而有效穗數(shù)是三要素中最基本的要素。實踐證明理想株型育種結(jié)合雜交育種是實現(xiàn)水稻超高產(chǎn)育種的新途徑,而水稻穗數(shù)是理想株型的重要組成部分之一。因此,定位控制水稻有效穗數(shù)QTL對水稻育種極為重要。本研究利用1090份水稻種質(zhì)資源以及雙親衍生的次級分離群體,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析與連鎖分析共同定位影響水稻有效穗數(shù)的QTL,主要研究結(jié)果如下:1.水稻種質(zhì)資源的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）本研究以1090份遺傳基礎(chǔ)豐富的水稻種質(zhì)資源為材料,2016年在三亞和深圳兩個環(huán)境測定水稻有效穗數(shù),利用4.8M的SNP進行有效穗數(shù)的GWAS分析,定位到6個QTL,分別位于第1、2、4、8染色體上。利用位于基因編碼區(qū)的非同義突變顯著SNP進行單倍型分析,最終,確定了位于第2、4染色體上的共2個QTL的6個候選基因。2.利用Lemont背景的近等基因系進行有效穗數(shù)主效QTL Qpn4的精細定位前人利用有效穗數(shù)較多的特青（TQ）導(dǎo)入有效穗數(shù)較少的Le... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

SNP在全基因組中的分布

圖 2.2 1090 份材料的 PCA3D 圖igure 2.2 PCA 3D plot of the first three principal components (PC) in 1090 accessio 分別代表了主成分分析中的前三個主成分，主成分 1，主成分 2，主成分 3，每個圓圈代表了藍色圓圈代表著熱帶粳稻，橙色圓圈代表著溫帶粳稻，紫色圓圈代表著 AUS，綠色圓圈代表（Bas），黃色圓圈代表著混合性粳稻。component 1), PC2(principal component 2) and PC3 (principal component 3) representated tal component analysis (PCA). Each circle represents a sample. Among them, the red circle represeneng, the orange circle represented temperate Geng, purple circle represented AUS, the green circleented Bas, and the yellow circle represented Geng-adm.效穗數(shù)表型料在兩個環(huán)境中均表現(xiàn)出了廣泛的遺傳變異（圖 2.3，表 2.2）。

圖 2.2 1090 份材料的 PCA3D 圖re 2.2 PCA 3D plot of the first three principal components (PC) in 1090 accession別代表了主成分分析中的前三個主成分，主成分 1，主成分 2，主成分 3，每個圓圈代表了一圓圈代表著熱帶粳稻，橙色圓圈代表著溫帶粳稻，紫色圓圈代表著 AUS，綠色圓圈代表著as），黃色圓圈代表著混合性粳稻。ponent 1), PC2(principal component 2) and PC3 (principal component 3) representated theomponent analysis (PCA). Each circle represents a sample. Among them, the red circle represente, the orange circle represented temperate Geng, purple circle represented AUS, the green circle red Bas, and the yellow circle represented Geng-adm.數(shù)表型在兩個環(huán)境中均表現(xiàn)出了廣泛的遺傳變異（圖 2.3，表 2.2）。

【參考文獻】：
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