大麥籽粒大小的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2020-06-03 05:51
【摘要】:大麥籽粒大小和千粒重既是大麥重要的產(chǎn)量因子,又是重要的品質(zhì)性狀。本研究選用了具有廣泛遺傳代表性的600份野生和400份栽培大麥材料,比較了栽培與野生大麥、皮大麥與裸大麥之間粒長、粒寬、粒厚和千粒重之間的相關(guān)性及差異性,并開展了全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),主要結(jié)果如下:1、大麥籽粒大小各指標(biāo)在不同基因型間差異顯著,栽培大麥的平均千粒重(39.7g)顯著高于野生大麥(35.9g)。皮大麥千粒重(41.9g)顯著高于裸大麥(36.3g)。野生大麥的平均粒長(10.4mm)顯著高于栽培大麥(8.9mm)。皮大麥平均粒長(9.7mm)顯著高于裸大麥(7.6mm)。野生大麥粒寬(3.0mm)顯著小于栽培大麥(3.4mm)。粒寬在皮、裸大麥間無顯著差異,在年份間有顯著差異。栽培大麥粒厚(2.5mm)顯著大于野生大麥(1.9mm),且粒厚在皮、裸和年份間均有顯著差異。2、大麥籽粒大小各指標(biāo)相關(guān)性分析表明,粒寬與粒厚都與粒重呈極顯著的強(qiáng)相關(guān)性(0.6~0.8),且粒寬與粒重的相關(guān)性略高于粒厚;2016年度粒長與粒寬和粒厚均呈極顯著的負(fù)相關(guān),2017年度的粒長與粒厚也呈極顯著的負(fù)相關(guān),表明這些指標(biāo)存在一定的環(huán)境效應(yīng);而在所有分類方式中,大麥的粒寬與粒厚都呈極顯著的強(qiáng)相關(guān)性(0.8~1.0)。主成分分析(PCA)結(jié)果顯示,野生大麥和栽培大麥在二維坐標(biāo)上能明顯區(qū)分開,皮大麥和裸大麥也能相互區(qū)分。主成分1和主成分2總和達(dá)到91.2%,說明大麥籽粒粒形與千粒重的大小可能由主效基因組控制。篩選到的大麥籽粒大小特異的遺傳材料也可為大麥育種提供原始材料或基因。3、在野生大麥中定位到47個(gè)QTL位點(diǎn),在栽培大麥中定位到50個(gè)QTL位點(diǎn),其中栽培與野生大麥重合位點(diǎn)一共有8個(gè)。定位位點(diǎn)與多種性狀基因(花期、株高、葡聚糖、激素、棱型、淀粉合成、蛋白質(zhì)合成)相關(guān)聯(lián),說明大麥籽粒大小及千粒重受多種基因調(diào)控,與多個(gè)性狀相關(guān)聯(lián)。淀粉合成與蛋白質(zhì)合成基因?qū)ψ蚜4笮∮绊戄^大,定位到的栽培與野生大麥籽粒大小QTL位點(diǎn)與淀粉合成和蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因的關(guān)聯(lián)性差異較為明顯:野生大麥中與粒長和粒厚相關(guān)的QTL89靠近GBSSⅠ基因而栽培大麥中與粒寬、粒厚和千粒重相關(guān)的QTL10則靠近Starch synthase基因;野生大麥中未定位到靠近蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因的位點(diǎn),但在栽培大麥中成功定位到靠近蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因HvNAM1的QTL38。與淀粉合成相關(guān)的GBSSⅠ基因和Starch synthase基因附近的QTL位點(diǎn)都與籽粒的粒厚相關(guān),證明了淀粉積累對(duì)于籽粒粒厚的重要性。本研究利用具有廣泛遺傳代表性大麥種質(zhì)開展粒形和千粒重的比較分析,進(jìn)一步揭示了栽培與野生大麥間籽粒的粒形和千粒重差異與相關(guān)性。全基因組關(guān)聯(lián)分析得到大量可能與粒形和千粒重等性狀相關(guān)的QTL位點(diǎn),對(duì)比現(xiàn)有報(bào)道和大麥基因組注釋信息,獲得了一些潛在的功能區(qū)域和候選基因,為后續(xù)大麥籽粒大小相關(guān)基因挖掘提供了重要的參考。
【圖文】:
具體參見楊倩(2018)碩士學(xué)位論文。逡逑2.2實(shí)驗(yàn)方法逡逑2.2.1實(shí)驗(yàn)田間設(shè)計(jì)逡逑2016年11月,將所有材料種植于紫金港實(shí)驗(yàn)農(nóng)場(chǎng),2017年11月,種植于逡逑長興浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)科學(xué)試驗(yàn)站。點(diǎn)播,,k渦兄種玻保爸輳芯啵玻擔(dān)悖恚騁懷9嫣镥義霞涔芾懟e義希玻玻擦P問蕕幕袢″義鮮棧癯な屏己玫乃胱櫻蚜:笞勻渙欄傘J褂猛蟶睿櫻茫列橢腫幼遠(yuǎn)<板義锨ЯV匾遣飭苛3、?硨頹ЯV兀看穩(wěn)。罰埃浚福傲V腫悠狡炭脅飭,五辶x洗紊镅е馗,使用道`郵雜偽昕ǔ卟飭苛:,每匪W牧涎∪。保噶=脅飭。辶x
本文編號(hào):2694390
【圖文】:
具體參見楊倩(2018)碩士學(xué)位論文。逡逑2.2實(shí)驗(yàn)方法逡逑2.2.1實(shí)驗(yàn)田間設(shè)計(jì)逡逑2016年11月,將所有材料種植于紫金港實(shí)驗(yàn)農(nóng)場(chǎng),2017年11月,種植于逡逑長興浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)科學(xué)試驗(yàn)站。點(diǎn)播,,k渦兄種玻保爸輳芯啵玻擔(dān)悖恚騁懷9嫣镥義霞涔芾懟e義希玻玻擦P問蕕幕袢″義鮮棧癯な屏己玫乃胱櫻蚜:笞勻渙欄傘J褂猛蟶睿櫻茫列橢腫幼遠(yuǎn)<板義锨ЯV匾遣飭苛3、?硨頹ЯV兀看穩(wěn)。罰埃浚福傲V腫悠狡炭脅飭,五辶x洗紊镅е馗,使用道`郵雜偽昕ǔ卟飭苛:,每匪W牧涎∪。保噶=脅飭。辶x
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