發(fā)布時間：2024-01-27 14:36

　　目的:研究不同連作年限山地丹參根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其多樣性,為闡釋丹參連作障礙的形成提供理論依據(jù)。方法:分別采集未種植丹參(CK)、種植1年(Y1)及種植2年(Y2)的根際土壤,基于Illumina公司Miseq高通量測序平臺,進(jìn)行細(xì)菌16S rRNA序列V3-V4區(qū)的高通量測序,對不同連作年限山地丹參根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其多樣性分析進(jìn)行研究。結(jié)果:CK、Y1及Y2處理中分別得到28 205、13 847及9 296條有效序列,注釋為3 832、1 989及1 295種細(xì)菌操作分類單元(OTU),其中隨著連作年限的增加,根際土壤細(xì)菌群落的種類及多樣性均呈現(xiàn)下降趨勢。在細(xì)菌門分類水平上,3個處理土壤中主要優(yōu)勢菌群落為厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和細(xì)菌變形菌門(Proteobacteria);在綱分類水平上優(yōu)勢菌株相差較大,CK及Y2中所占比例最大的為擬桿菌綱(Bacteroidia),分別為26.40%及38.90%,Y1中所占比例最大的為芽孢桿菌綱(Bacilli),為25.06%;在目分類水平上優(yōu)勢菌株相差明顯,CK和Y2中所占比例最大...

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圖2不同連作年限山地丹參土壤細(xì)菌在門分類水平群落結(jié)構(gòu)

圖3不同連作年限山地丹參土壤細(xì)菌在綱分類水平群落結(jié)構(gòu)

圖4不同連作年限山地丹參土壤細(xì)菌在目分類水平群落結(jié)構(gòu)

圖6不同連作年限山地丹參土壤細(xì)菌群落OTU維恩圖及種類數(shù)目注：A.OTU維恩圖；B.不同連作年限山地丹參土壤細(xì)菌群落1024

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