農(nóng)田土壤微生物堿性磷酸酶基因的多樣性及其對(duì)磷素響應(yīng)
發(fā)布時(shí)間:2024-01-18 16:56
隨著化學(xué)化肥的普遍使用,我國(guó)農(nóng)田存在不同程度的過(guò)量施肥現(xiàn)象,并引起了一系列生態(tài)問(wèn)題。珠三角地區(qū)作為南方重要蔬菜種植區(qū)域也存在著同樣的問(wèn)題。研究長(zhǎng)期過(guò)量施肥中農(nóng)田土壤微生物基因及功能的變化,可為農(nóng)田的合理施肥提供一定的指導(dǎo)意見(jiàn)。本研究以農(nóng)田土壤的堿性磷酸酶為主要研究對(duì)象,先通過(guò)結(jié)合傳統(tǒng)理化指標(biāo)檢測(cè)和高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)廣州區(qū)域農(nóng)田土壤進(jìn)行了調(diào)查研究。同時(shí)使用代表性土壤模擬施肥實(shí)驗(yàn),研究施放磷肥過(guò)程中,土壤堿性磷酸酶的轉(zhuǎn)錄表達(dá)及酶活的變化情況。后從農(nóng)田土壤中篩選得有機(jī)磷細(xì)菌進(jìn)行長(zhǎng)期無(wú)機(jī)磷連續(xù)培養(yǎng),以研究長(zhǎng)期磷源脅迫作用下有機(jī)磷細(xì)菌堿性磷酸酶的基因表達(dá)及酶活性的變化差異。本研究得到以下主要結(jié)論:從廣州區(qū)域番禺、海珠、天河、荔灣和從化等地采集六處農(nóng)田土壤樣品,進(jìn)行理化指標(biāo)的測(cè)定和16S rDNA、18S rDNA、堿性磷酸酶基因phoD和phoX高通量測(cè)序。理化指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果顯示,廣州區(qū)域的農(nóng)田土壤的無(wú)機(jī)磷,氨氮含量普遍較低。高通量測(cè)序結(jié)果顯示,廣州區(qū)域農(nóng)田土壤的微生物多樣性豐富,門(mén)水平上,細(xì)菌群落的優(yōu)勢(shì)物種是Proteobacteri,真菌群落的優(yōu)勢(shì)物種是Ascomycota。而含有phoD和ph...
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 土壤微生物
1.2 土壤磷元素化學(xué)循環(huán)
1.3 土壤中的有機(jī)磷微生物降解
1.3.1 土壤有機(jī)磷微生物
1.3.2 堿性磷酸酶
1.4 我國(guó)及珠三角地區(qū)農(nóng)田土壤施肥現(xiàn)狀
1.5 現(xiàn)代測(cè)序技術(shù)在微生物學(xué)上的應(yīng)用
1.5.1 高通量測(cè)序技術(shù)分析微生物群落
1.5.2 全基因組測(cè)序在細(xì)菌組學(xué)上的應(yīng)用
1.5.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在細(xì)菌組學(xué)上的應(yīng)用
1.6 本研究的目的和內(nèi)容
1.6.1 本研究的主要內(nèi)容
1.6.2 本研究的主要技術(shù)路線
1.6.3 本研究的主要目的與意義
第二章 廣州地區(qū)農(nóng)田土壤微生物及細(xì)菌堿性磷酸酶基因phoD和phoX多樣性分析及模擬施肥實(shí)驗(yàn)
2.1 引言
2.2 主要實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.2.1 主要實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 主要實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 土壤采集信息及理化指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果
2.3.2 土壤總DNA提取結(jié)果及PCR預(yù)實(shí)驗(yàn)
2.3.3 六處農(nóng)田土壤堿性磷酸酶基因豐度分析
2.3.4 模擬施肥實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.5 16S rDNA和 18sS rDNA基因高通量測(cè)序分析
2.3.6 堿性磷酸酶基因phoD和phoX基因高通量測(cè)序分析
2.4 本章小結(jié)
第三章 有機(jī)磷細(xì)菌的篩選及相關(guān)組學(xué)研究
3.1 引言
3.2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 結(jié)論與討論
3.3.1 有機(jī)磷微生物的篩選與鑒定
3.3.2 GN1全基因組測(cè)序結(jié)果與分析
3.3.3 GN1在不同磷源培養(yǎng)條件下各項(xiàng)理化特性檢測(cè)
3.3.4 GN1不同磷源實(shí)驗(yàn)組的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果與分析
3.4 本章小結(jié)
第四章 磷源壓迫環(huán)境下細(xì)菌模擬進(jìn)化實(shí)驗(yàn)
4.1 引言
4.2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 結(jié)論與分析
4.3.1 有機(jī)磷細(xì)菌GN1的長(zhǎng)期培養(yǎng)結(jié)果與分析
4.3.2 不同培養(yǎng)時(shí)間批次GN1菌株的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果與分析
4.3.3 GN1長(zhǎng)期無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)后基因組重測(cè)序結(jié)果與分析
4.4 本章小結(jié)
結(jié)論與展望
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
附件
本文編號(hào):3879664
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 土壤微生物
1.2 土壤磷元素化學(xué)循環(huán)
1.3 土壤中的有機(jī)磷微生物降解
1.3.1 土壤有機(jī)磷微生物
1.3.2 堿性磷酸酶
1.4 我國(guó)及珠三角地區(qū)農(nóng)田土壤施肥現(xiàn)狀
1.5 現(xiàn)代測(cè)序技術(shù)在微生物學(xué)上的應(yīng)用
1.5.1 高通量測(cè)序技術(shù)分析微生物群落
1.5.2 全基因組測(cè)序在細(xì)菌組學(xué)上的應(yīng)用
1.5.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在細(xì)菌組學(xué)上的應(yīng)用
1.6 本研究的目的和內(nèi)容
1.6.1 本研究的主要內(nèi)容
1.6.2 本研究的主要技術(shù)路線
1.6.3 本研究的主要目的與意義
第二章 廣州地區(qū)農(nóng)田土壤微生物及細(xì)菌堿性磷酸酶基因phoD和phoX多樣性分析及模擬施肥實(shí)驗(yàn)
2.1 引言
2.2 主要實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.2.1 主要實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 主要實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 土壤采集信息及理化指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果
2.3.2 土壤總DNA提取結(jié)果及PCR預(yù)實(shí)驗(yàn)
2.3.3 六處農(nóng)田土壤堿性磷酸酶基因豐度分析
2.3.4 模擬施肥實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.5 16S rDNA和 18sS rDNA基因高通量測(cè)序分析
2.3.6 堿性磷酸酶基因phoD和phoX基因高通量測(cè)序分析
2.4 本章小結(jié)
第三章 有機(jī)磷細(xì)菌的篩選及相關(guān)組學(xué)研究
3.1 引言
3.2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 結(jié)論與討論
3.3.1 有機(jī)磷微生物的篩選與鑒定
3.3.2 GN1全基因組測(cè)序結(jié)果與分析
3.3.3 GN1在不同磷源培養(yǎng)條件下各項(xiàng)理化特性檢測(cè)
3.3.4 GN1不同磷源實(shí)驗(yàn)組的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果與分析
3.4 本章小結(jié)
第四章 磷源壓迫環(huán)境下細(xì)菌模擬進(jìn)化實(shí)驗(yàn)
4.1 引言
4.2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 結(jié)論與分析
4.3.1 有機(jī)磷細(xì)菌GN1的長(zhǎng)期培養(yǎng)結(jié)果與分析
4.3.2 不同培養(yǎng)時(shí)間批次GN1菌株的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果與分析
4.3.3 GN1長(zhǎng)期無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)后基因組重測(cè)序結(jié)果與分析
4.4 本章小結(jié)
結(jié)論與展望
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間取得的研究成果
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