發(fā)布時間：2022-12-18 18:22

　　QTL與環(huán)境互作（QTL by environment interactions,QEI）在作物的遺傳分析中被廣泛地檢測到,QEI作圖對分子標(biāo)記輔助選擇、研究重要性狀的遺傳機制和理解基因型與環(huán)境互作具有重要的意義。完備區(qū)間作圖（inclusive composite interval mapping,ICIM）方法成功實現(xiàn)了單環(huán)境的加性、加顯性和上位性作圖,大量模擬研究和實際數(shù)據(jù)的分析表明ICIM是一種行之有效的QTL作圖方法,并已應(yīng)用到大量實驗群體的遺傳分析中。本研究將ICIM方法拓展到多環(huán)境數(shù)據(jù)的加性、加顯性和加加上位性QEI作圖中,并通過模擬群體結(jié)合實驗群體研究了其有效性,研究內(nèi)容主要包括四個方面:1.以DH群體為例闡述了利用ICIM方法進行加性和加加上位性QEI作圖的遺傳學(xué)和統(tǒng)計學(xué)原理;以F2群體為例闡述了加顯性QEI作圖的遺傳學(xué)和統(tǒng)計學(xué)原理。QEI作圖的完備區(qū)間作圖過程包括兩個步驟:第一步,利用逐步回歸選擇每個環(huán)境的顯著標(biāo)記（及標(biāo)記乘積項）并估計其效應(yīng);第二步,利用上一步選擇的顯著標(biāo)記（及標(biāo)記乘積項）修正各個環(huán)境的表型數(shù)據(jù),然后同時利用各環(huán)境修正后的表型數(shù)據(jù)進行全基因組的一維... 

【文章頁數(shù)】：84 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 數(shù)量性狀及其遺傳
    1.2 數(shù)量性狀座位作圖
        1.2.1 QTL作圖的基本原理
        1.2.2 常用的QTL作圖方法
    1.3 QTL與環(huán)境互作作圖的研究進展
        1.3.1 基因型與環(huán)境互作
        1.3.2 從基因型與環(huán)境互作到QTL與環(huán)境互作
        1.3.3 QTL與環(huán)境互作作圖方法的研究進展
    1.4 數(shù)量性狀座位作圖中的顯著性水平及LOD臨界值
    1.5 本研究的目的和意義
第二章 加性QTL與環(huán)境互作的完備區(qū)間作圖
    2.1 材料與方法
        2.1.1 線性模型
        2.1.2 QEI完備區(qū)間作圖的一維掃描
        2.1.3 QTL解釋的表型變異（PVE）
        2.1.4 模擬研究
        2.1.5 功效和假陽性率的計算
        2.1.6 玉米RIL實驗群體
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 DH群體獨立遺傳模型的檢測功效及位置和效應(yīng)的估計
        2.2.2 DH群體連鎖遺傳模型的檢測功效
        2.2.3 玉米RIL實驗群體的QEI作圖和單環(huán)境作圖結(jié)果
        2.2.4 玉米RIL實驗群體利用表型均值QTL作圖結(jié)果
        2.2.5 玉米RIL實驗群體遺傳模型的檢測功效及位置和效應(yīng)的估計
    2.3 結(jié)論與討論
第三章 加顯性QTL與環(huán)境互作的完備區(qū)間作圖
    3.1 材料與方法
        3.1.1 線性模型
        3.1.2 QEI完備區(qū)間作圖的一維掃描
        3.1.3 QTL解釋的表型變異（PVE）
        3.1.4 模擬研究
        3.1.5 玉米永久F_2實驗群體
    3.2 結(jié)果
        3.2.1 F_2群體獨立遺傳模型的檢測功效、位置和效應(yīng)的估計
        3.2.2 F_2群體連鎖遺傳模型的檢測功效、位置和效應(yīng)的估計
        3.2.3 玉米永久F_2實驗群體的QEI作圖和單環(huán)境作圖結(jié)果
    3.3 結(jié)論與討論
第四章 加加上位性QTL與環(huán)境互作的完備區(qū)間作圖
    4.1 材料與方法
        4.1.1 線性模型
        4.1.2 QEI完備區(qū)間作圖的二維掃描
        4.1.3 模擬研究
    4.2 結(jié)果
    4.3 結(jié)論與討論
第五章 QTL與環(huán)境互作作圖中的經(jīng)驗LOD臨界值
    5.1 材料與方法
    5.2 結(jié)果
    5.3 結(jié)論與討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]QTL IciMapping:Integrated software for genetic linkage map construction and quantitative trait locus mapping in biparental populations[J]. Lei Meng,Huihui Li,Luyan Zhang,Jiankang Wang.  The Crop Journal. 2015(03)
[2]Comparison and Analysis of QTLs, Epistatic Effects and QTLx Environment Interactions for Yield Traits Using DH and RILs Populations in Rice[J]. ZHAO Xin-hua,QIN Yang,JIA Bao-yan,Suk-Man Kim,Hyun-Suk Lee,Moo-Young Eun,Kyung-Min Kim,Jae-Keun Sohn.  Journal of Integrative Agriculture. 2013(02)
[3]QTL作圖中零假設(shè)檢驗統(tǒng)計量分布特征及LOD臨界值估計方法[J]. 孫子淇,李慧慧,張魯燕,王建康.  作物學(xué)報. 2013(01)
[4]Estimation of statistical power and false discovery rate of QTL mapping methods through computer simulation[J]. LI HuiHui,ZHANG LuYan ＆ WANG JianKang Institute of Crop Sciences,The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,and CIMMYT China,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China.  Chinese Science Bulletin. 2012(21)
[5]The Statistical Power of Inclusive Composite Interval Mapping in Detecting Digenic Epistasis Showing Common F2 Segregation Ratios[J]. Luyan Zhang,Huihui Li and Jiankang Wang1 Institute of Crop Sciences,The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,and CIMMYT China,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China.  Journal of Integrative Plant Biology. 2012(04)
[6]數(shù)量性狀基因定位研究中若干常見問題的分析與解答[J]. 李慧慧,張魯燕,王建康.  作物學(xué)報. 2010(06)
[7]陸地棉產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL定位[J]. 秦永生,劉任重,梅鴻獻,張?zhí)煺?郭旺珍.  作物學(xué)報. 2009(10)
[8]數(shù)量性狀基因的完備區(qū)間作圖方法[J]. 王建康.  作物學(xué)報. 2009(02)
[9]QTL and QTL × Environment Effects on Agronomic and Nitrogen Acquisition Traits in Rice[J]. Senapathy Senthilvel,Kunnummal Kurungara Vinod,Palaniappan Malarvizhi,Marappa Maheswaran.  Journal of Integrative Plant Biology. 2008(09)

博士論文
[1]玉米雜種優(yōu)勢遺傳基礎(chǔ)及玉米與水稻比較基因組研究[D]. 嚴(yán)建兵.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003

碩士論文
[1]不同遺傳群體重組率的估計及QTL作圖中檢驗統(tǒng)計量的分布特征[D]. 孫子淇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012



本文編號：3722536