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基于DNA宏條形碼的莼菜大田土壤真菌多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2022-09-17 14:32
  高通量測(cè)序與DNA條形碼結(jié)合產(chǎn)生的DNA宏條形碼技術(shù)(DNA-Metabarcoding),能快速鑒定混合樣本中的物種,現(xiàn)已成為檢測(cè)群類物種多樣性和豐富度的常用方法.本試驗(yàn)采用這一方法分析了莼菜大田不同種植年限土壤真菌多樣性,結(jié)果表明:10年生土壤中含有最多的真菌種類,多樣性及豐富度最高;在屬水平上表現(xiàn)為蛙糞霉屬、裂梗霉屬、酵母屬等占優(yōu)勢(shì);群類組成分析顯示,種植年限的變化對(duì)土壤真菌群落組成有一定的影響;聚類分析中10年與15年生莼菜土壤物種多樣性相似度較高. 

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣品采集與準(zhǔn)備
    1.2 樣品總DNA提取
    1.3 PCR擴(kuò)增及測(cè)序
    1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
        1.4.1 原始數(shù)據(jù)整理、 過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估
        1.4.2 OTU劃分和分類地位鑒定
        1.4.3 Alpha多樣性分析
        1.4.4 分類學(xué)組成分析
2 結(jié) 果
    2.1 OTU分類學(xué)鑒定
    2.2 Alpha多樣性分析
    2.3 不同年限莼菜土壤真菌群落的組成
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3679408

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