為闡明文山市石漠化土壤真菌多樣性情況及優(yōu)勢關(guān)鍵類群,采集石漠化樣區(qū)中植物根際土壤,提取土壤總DNA,利用 Illumina HiSeq 平臺對真核微生物 ITS （Internal Transcribed Spacer） 區(qū)擴(kuò)增進(jìn)行高通量測序后注釋鑒定,分析了土壤真菌組成及多樣性。結(jié)果表明,典型樣本共獲得168 677條有效優(yōu)化序列,平均長度為452.7 bp;α多樣性指數(shù)顯示3個樣本間的真核微生物豐度與群落多樣性差異不顯著（P>0.05）;檢測到的序列聚類共得到 314 個OTUs,屬于真菌的有7門,其中子囊菌門是占比最高的一門優(yōu)勢菌,其相對豐度最高值為71.07%,從綱階元層看,座囊菌綱是占比最高的一屬優(yōu)勢菌,其相對豐度最高值為37.96%;在目階元層看格孢腔目是占比最高的一目優(yōu)勢菌,范圍在20.67%～21.71%、其次是煤炱目（14.29%～15.66%）和肉座菌目（19.24%～20.38%）;從屬水平上看未分類真核微生物達(dá)52.70%～53.98%,其次是Boeremia（15.10%～16.88%）和芽枝霉屬13.25%～14.28%)、旋孢腔菌屬（3.66%～6.... 

【文章來源】：文山學(xué)院學(xué)報. 2020,33(06)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1材料與方法
    1.1樣品采集
    1.2土壤DNA提取和PCR擴(kuò)增
    1.3測序數(shù)據(jù)處理
    1.4統(tǒng)計與生物信息學(xué)分析
2結(jié)果與分析
    2.1α多樣性
    2.2土壤中的真核微生物群落結(jié)構(gòu)
        2.2.1真核微生物群落結(jié)構(gòu)分析
        2.2.2樣方土壤中AM真菌分布狀況
    2.3優(yōu)勢與共有菌種分析
    2.4組間群落結(jié)構(gòu)差異分析
3討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3643145