敦煌地區(qū)不同鹽堿類型土壤中未培養(yǎng)細菌多樣性研究
發(fā)布時間:2022-01-23 05:51
本研究利用分子生態(tài)學方法,應用Illumina Hi Seq 2500高通量測序技術和構建土壤細菌16S r RNA基因克隆文庫的方法來分析敦煌地區(qū)不同類型鹽堿土壤中細菌多樣性、群落結構及其與土壤理化性質之間的關系,從而揭示敦煌地區(qū)不同類型鹽堿土壤中細菌群落組成的多樣性。主要研究結果有:(1)高通量測序技術對14個土壤樣品優(yōu)化后的序列進行劃分共得到4997個OTUs。主要分歸于厚壁菌門(Firmicutes),放線菌門(Actinobacteria),變形菌門(Proteobacteria),Deinococcus-Thermus,擬桿菌門(Bacteroidetes),芽單胞菌門(Gemmatimonadetes),綠彎菌門(Chloroflexi),酸桿菌門(Acidobacteria),浮霉菌門(Planctomycetes),纖維桿菌門(Fibrobacteres)等17個菌門以及未知類群?寺∥膸鞓嫿ǖ9個土壤樣品中共得到厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、浮霉菌門(Planctomycetes)...
【文章來源】:西北師范大學甘肅省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣品平均序列度(bp)和樣品優(yōu)化序列
22圖3-2 樣品的 釋性曲線Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤細菌群落組成特征3.2.3.1 水平上 菌類群 成圖 3-3 中顯示了豐度較高的細菌門類,每一個柱狀圖是一個樣品的物種分布組成,而每種顏色的面積代表了一個物種的相對豐度。14 個土壤樣品的 1229404條序列分隸屬于細菌類群的 17 個門和未知菌門,主要包括細菌域的變形菌門(Proteobacteria),浮霉菌門(Planctomycetes),芽單胞菌門(Gemmatimonadetes),厚壁菌門(Firmicutes),纖維桿菌門(Fibrobacteres)
23圖3-3 菌群落相對 度在 水平上的分布統(tǒng)計Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community圖3-4 基于 水平上的熱圖分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap圖3-4熱圖可以清晰的展現(xiàn)出在門水平上,細菌在各樣品中的不同分布。土壤中占優(yōu)勢的細菌菌門為厚壁菌門(76.27%),其次是放線菌門(11.23%)和變形菌門(5.99%),研究發(fā)現(xiàn)在敦煌地區(qū)的土壤樣品中的這三個菌門在14個
【參考文獻】:
期刊論文
[1]土壤微生物多樣性分析方法的研究進展[J]. 金明. 農(nóng)業(yè)技術與裝備. 2016(04)
[2]內(nèi)蒙古河套灌區(qū)不同鹽堿程度的土壤細菌群落多樣性[J]. 李新,焦燕,代鋼,楊銘德,溫慧洋. 中國環(huán)境科學. 2016(01)
[3]河西走廊酒泉地區(qū)鹽堿土未培養(yǎng)放線菌多樣性[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,閻薇如,耿暉,韓彩虹,達文燕,張愛梅,朱學泰. 應用生態(tài)學報. 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地區(qū)鹽堿土中放線菌多樣性——以民勤縣為例[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,朱學泰,張愛梅,達文燕,韓彩虹,閻薇如,耿暉. 中國環(huán)境科學. 2015(06)
[5]土壤微生物多樣性研究的新進展[J]. 李旭東,徐莉娜,薛林貴. 廣州化工. 2014(20)
[6]柴達木盆地達布遜鹽湖微生物多樣性研究[J]. 趙婉雨,楊漸,董海良,吳耿,王尚,孫永娟,賴忠平,蔣宏忱. 地球與環(huán)境. 2013(04)
[7]三峽庫區(qū)小江流域消落區(qū)土壤微生物多樣性[J]. 邱權,陳雯莉. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
[8]微生物分子生態(tài)學發(fā)展歷史及研究現(xiàn)狀[J]. 李曉然,呂毅,宮路路,柳陳堅. 中國微生態(tài)學雜志. 2012(04)
[9]高通量測序技術及其在生命科學中的應用[J]. 李慶崗,陶立. 畜牧與飼料科學. 2012(02)
[10]土壤微生物多樣性及其研究方法綜述[J]. 蔡晨秋,唐麗,龍春林. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2011(28)
博士論文
[1]庫姆塔格沙漠東緣風沙活動及羽毛狀沙丘剖面特征[D]. 王永勝.中國林業(yè)科學研究院 2014
[2]莠去津對土壤微生物群落結構及分子多樣性的影響[D]. 王軍.山東農(nóng)業(yè)大學 2012
碩士論文
[1]石油污染物質輸入對濱海濕地根際微生物群落結構的影響研究[D]. 孫會梅.中國海洋大學 2013
[2]庫姆塔格沙漠土壤微生物多樣性研究[D]. 許璐.中國林業(yè)科學研究院 2013
[3]新一代高通量測序技術研究土壤微生物群落結構對環(huán)境條件的響應[D]. 張彩霞.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
[4]敦煌盆地地下水數(shù)值模擬及可視化與管理[D]. 桑學鋒.蘭州大學 2006
本文編號:3603731
【文章來源】:西北師范大學甘肅省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣品平均序列度(bp)和樣品優(yōu)化序列
22圖3-2 樣品的 釋性曲線Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤細菌群落組成特征3.2.3.1 水平上 菌類群 成圖 3-3 中顯示了豐度較高的細菌門類,每一個柱狀圖是一個樣品的物種分布組成,而每種顏色的面積代表了一個物種的相對豐度。14 個土壤樣品的 1229404條序列分隸屬于細菌類群的 17 個門和未知菌門,主要包括細菌域的變形菌門(Proteobacteria),浮霉菌門(Planctomycetes),芽單胞菌門(Gemmatimonadetes),厚壁菌門(Firmicutes),纖維桿菌門(Fibrobacteres)
23圖3-3 菌群落相對 度在 水平上的分布統(tǒng)計Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community圖3-4 基于 水平上的熱圖分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap圖3-4熱圖可以清晰的展現(xiàn)出在門水平上,細菌在各樣品中的不同分布。土壤中占優(yōu)勢的細菌菌門為厚壁菌門(76.27%),其次是放線菌門(11.23%)和變形菌門(5.99%),研究發(fā)現(xiàn)在敦煌地區(qū)的土壤樣品中的這三個菌門在14個
【參考文獻】:
期刊論文
[1]土壤微生物多樣性分析方法的研究進展[J]. 金明. 農(nóng)業(yè)技術與裝備. 2016(04)
[2]內(nèi)蒙古河套灌區(qū)不同鹽堿程度的土壤細菌群落多樣性[J]. 李新,焦燕,代鋼,楊銘德,溫慧洋. 中國環(huán)境科學. 2016(01)
[3]河西走廊酒泉地區(qū)鹽堿土未培養(yǎng)放線菌多樣性[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,閻薇如,耿暉,韓彩虹,達文燕,張愛梅,朱學泰. 應用生態(tài)學報. 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地區(qū)鹽堿土中放線菌多樣性——以民勤縣為例[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,朱學泰,張愛梅,達文燕,韓彩虹,閻薇如,耿暉. 中國環(huán)境科學. 2015(06)
[5]土壤微生物多樣性研究的新進展[J]. 李旭東,徐莉娜,薛林貴. 廣州化工. 2014(20)
[6]柴達木盆地達布遜鹽湖微生物多樣性研究[J]. 趙婉雨,楊漸,董海良,吳耿,王尚,孫永娟,賴忠平,蔣宏忱. 地球與環(huán)境. 2013(04)
[7]三峽庫區(qū)小江流域消落區(qū)土壤微生物多樣性[J]. 邱權,陳雯莉. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
[8]微生物分子生態(tài)學發(fā)展歷史及研究現(xiàn)狀[J]. 李曉然,呂毅,宮路路,柳陳堅. 中國微生態(tài)學雜志. 2012(04)
[9]高通量測序技術及其在生命科學中的應用[J]. 李慶崗,陶立. 畜牧與飼料科學. 2012(02)
[10]土壤微生物多樣性及其研究方法綜述[J]. 蔡晨秋,唐麗,龍春林. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2011(28)
博士論文
[1]庫姆塔格沙漠東緣風沙活動及羽毛狀沙丘剖面特征[D]. 王永勝.中國林業(yè)科學研究院 2014
[2]莠去津對土壤微生物群落結構及分子多樣性的影響[D]. 王軍.山東農(nóng)業(yè)大學 2012
碩士論文
[1]石油污染物質輸入對濱海濕地根際微生物群落結構的影響研究[D]. 孫會梅.中國海洋大學 2013
[2]庫姆塔格沙漠土壤微生物多樣性研究[D]. 許璐.中國林業(yè)科學研究院 2013
[3]新一代高通量測序技術研究土壤微生物群落結構對環(huán)境條件的響應[D]. 張彩霞.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
[4]敦煌盆地地下水數(shù)值模擬及可視化與管理[D]. 桑學鋒.蘭州大學 2006
本文編號:3603731
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